QQ登录

只需要一步,快速开始

 注册地址  找回密码
查看: 2343|回复: 0
打印 上一主题 下一主题

[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

[复制链接]
字体大小: 正常 放大
浅夏110 实名认证       

542

主题

15

听众

1万

积分

  • TA的每日心情
    开心
    2020-11-14 17:15
  • 签到天数: 74 天

    [LV.6]常住居民II

    邮箱绑定达人

    群组2019美赛冲刺课程

    群组站长地区赛培训

    群组2019考研数学 桃子老师

    群组2018教师培训(呼伦贝

    群组2019考研数学 站长系列

    跳转到指定楼层
    1#
    发表于 2020-6-9 11:11 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta |邮箱已经成功绑定
    随着人类的进化,人们为了揭示生命的奥妙,越来越重视遗传学的研究,特别是遗 传特征的逐代传播,引起人们更多的注意。无论是人,还是动植物都会将本身的特征遗 传给下一代,这主要是因为后代继承了双亲的基因,形成自己的基因对,基因对将确定 后代所表现的特征。下面,我们来研究两种类型的遗传:常染色体遗传和 x − 链遗传。 根据亲体基因遗传给后代的方式,建立模型,利用这些模型可以逐代研究一个总体基因 型的分布。1 J0 ]* A( i/ A" l
    - f, C% K% A" e, p* Z4 P8 ^
    1 常染色体遗传模型
    4 F, z# `# T. D1 R2 @常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。3 B: o. G5 C6 U' a, t$ v
    ; x  E- B' p9 X( S( N% k
    $ e0 g6 p+ M7 o+ w( m/ ~* w  B+ c

    ' ~. q( I6 w; h! h例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?2 L. Y( S# y. `+ [

    0 m7 \, x/ I. e(a)假设  Y, H4 \/ p& {) J, F3 D
    令n = 0,1,2,...。
    # h/ w$ ~6 D$ h
      f; \4 b! m  \* U  i, n
    9 y9 b3 O0 D5 H
    ) E3 l6 E' r. m! N) Q; Y( B( ^% z) Z# b(b)建模
    * ?( J9 \. R( ]- @: X; R. {4 K9 u; ~6 ^. G, K% g9 k
    * z1 ]/ h; r3 V8 k5 e& I
    9 O0 W+ s" z% L1 c% D% C

    ! d1 v" ]% Z: F. w# A; ?- e0 _* l& D
    编写如下 Matlab 程序:$ Y& n! L9 h5 m# t( q: j
    9 ^: V) g8 g! S% K+ `) d6 h+ X! x
    syms n a0 b0 c0
    . P/ d+ G5 Q4 o1 hM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');
    1 X& I( u) `7 I, U; ][p,lamda]=eig(M);# [  v( c6 y. w
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];0 p2 x, E1 \2 F7 ?/ T: w. X
    x=simple(x)
    % L7 k3 V! `6 g# k+ o
    9 |1 ~2 s3 R, N2 ?
    ! H0 t/ }' R: ?% Z, `! y0 T- b$ P5 _3 O1 G4 {# ]' d; W

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。


    - l2 E- s% w* r0 x9 T9 J# U2 j  l6 ^- g' c$ ?- G* B! ?( E# D6 v; c! W' w

    ) C7 p9 @1 u6 G9 ~' b7 w' p) D4 s' R编写如下 Matlab 程序:" m- n5 R! \& Q; W; d$ k

    , E: V. Q. t. A4 q6 v5 |syms n a0 b0 c0
    ( \) e3 \7 b2 {( R' [0 g3 [M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');, R5 S, m" m/ h4 T
    [p,lamda]=eig(M);+ M+ O( `) h* ^; e% v
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    & Z. y3 [9 o7 g# F: Xx=simple(x) # J4 y' Y0 N: ~' \! N( M

    9 ?8 e3 u2 }) S% ^
    2 v9 f: g! J& s) d3 I( r1 W
    , K; u1 J2 Q8 c" j- F) m& j3 e; f) j
    2 常染色体隐性病模型$ _/ u% _+ o7 e! g( K
    现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。
    9 x( {0 c" r/ ^% k9 j5 a; p0 t7 [: R; S& _+ q  `9 i6 }# B) f
    (a)假设
    2 ]$ Y) n* J9 m" L(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    : l  |% {5 v1 _3 I: q/ ]1 Y- ~- Y; e1 V1 o: V0 {
    # e6 Y( X, A, [9 J, A! b& v

    2 t" n! S) ?. a$ Y (b)建模
    * G0 C) C6 o4 \0 F. ~/ ]0 G
    0 R9 p8 @# ?. D6 w" j8 h0 u* n- }

    , d* ?# N/ L5 n7 r' K2 ^7 l- _3 z2 w8 x9 h/ f2 ?# W* H. a
    9 p, t" [( n& U1 B# ~" Z( \
    (c)模型讨论
    2 R) Y9 O1 U' N5 m0 @/ s研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为# y$ c* A* |3 i9 P/ m/ g

    " d2 O- G/ S( c1 v% d8 j) [) B+ N$ A0 Y, H
    . Q: i- q0 t% D2 u" X
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。* K* T) E9 X9 e" A. _  z6 Z
    ) j- S" t2 k: k+ x: ~( v
    3   X − 链遗传模型
      a& y3 u3 }. vX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。% N$ j6 A8 j: N8 f- i3 x
    / R  ?% R& ^, l7 t. J# E$ Y& v
    (a)假设* [2 W' U+ V! y- ^( N1 U9 V
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。# W% g% }$ o; h7 E& `( H9 f8 c

    0 [. c: k; ~( {( X% X% S(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    ! k$ ?1 [2 X0 v' n7 ~( w  [% M9 d( Z. U( ^, N# E3 `( B  Q

    , ^' y2 K" Q- g6 Z/ v2 o" Z: x# [: c$ [6 T! @" U' U
    / Z8 T8 I4 x9 i+ ?2 T
    ) A9 c. Q& O& E. K. u3 r

    & _* \  [% ~- H
    ; c( k+ u5 K: T8 n
    7 E, G7 J* \# m1 M  v8 S编写如下 Matlab 程序:% B7 r1 ?& O% e' `3 G$ r5 b

    7 R/ D- A1 |7 N6 F) ]% Tsyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0+ S3 W/ |# i, r  l9 E0 E( C
    M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;
    ' _/ k- I* g/ { 0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
    : Z3 \! ~) E) s% i( k- }M=sym(M);0 a, j8 l2 d5 }& z$ o5 A! s
    [p,lamda]=eig(M);
    0 `9 M8 ]+ U% Y1 A% M2 zx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];
      H, W: i/ C4 Q# fx=simple(x)
    6 @8 R: g' a, C# L' s
    , T; i6 h* V. t
    ; P6 J( C  i: m由上述程序计算结果可以看出9 p8 K, f9 U) L+ [+ q9 ^  h9 _

    ) }7 Z- @5 Y# |) }+ ], i; B9 \) X7 ]0 q( J" F

    9 z' f( r" c! H% P1 @8 t% d$ b$ m8 T6 g4 p- j
    ————————————————, U% A6 i& d9 q+ U
    版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    , q0 A5 n8 Z" f原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596# o. h/ J2 S2 c6 T- l4 S* W* p

    ( j" r# V- M0 U- |5 p0 j8 w/ i; X& |) t8 N! U6 J
    zan
    转播转播0 分享淘帖0 分享分享0 收藏收藏0 支持支持0 反对反对0 微信微信
    您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册地址

    qq
    收缩
    • 电话咨询

    • 04714969085
    fastpost

    关于我们| 联系我们| 诚征英才| 对外合作| 产品服务| QQ

    手机版|Archiver| |繁體中文 手机客户端  

    蒙公网安备 15010502000194号

    Powered by Discuz! X2.5   © 2001-2013 数学建模网-数学中国 ( 蒙ICP备14002410号-3 蒙BBS备-0002号 )     论坛法律顾问:王兆丰

    GMT+8, 2026-4-12 02:30 , Processed in 0.475851 second(s), 51 queries .

    回顶部