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R语言绘制二维密度图

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    开心
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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-10-29 10:55 |只看该作者 |正序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    R语言绘制二维密度图二维密度图显示了两个数值变量之间的关系,一个在x轴上表示,另一个在Y轴上表示,与散点图类似,然后计算二维空间中特定区域内的观测数,并用颜色梯度表示。二维密度图有几种类型,以下主要展示二维直方图和Hexbin图的绘图代码。- h& M% r6 r+ ?0 _* R
    4 u5 U1 z( r# \: E
    R语言|绘制二维直方图
    # P. z/ A3 X9 o8 ]1 a* [7 k* R对于2d直方图,plot区域被划分为多个正方形,调用geombin2d()函数,它提供了一个bins参数,用于控制要显示的bins数量。- Q" F' h# o: O- q1 k
    ) K- H! i# y+ P' M7 P: ^4 w8 L
    1.先绘制基础的散点图;
    + E% p+ p( `$ N9 D, v8 |##二维直方图3 p* i7 h8 g8 W7 a- u
    # Library; h0 z! G2 C  x* i8 s
    library(tidyverse)$ H) D2 U6 z8 u# ?# y& r# k) n- d. D
    library(ggplot2)
    ! {/ B4 l) \- _9 Q& A
    + `/ @2 [  T+ e6 t# 读取数据( ~4 i+ d! t" S% c# ?, y
    a <- data.frame( x=rnorm(20000, 10, 1.9), y=rnorm(20000, 10, 1.2) )
    . q+ e# `( p$ o( T! B+ `& @b <- data.frame( x=rnorm(20000, 14.5, 1.9), y=rnorm(20000, 14.5, 1.9) )
    4 E1 W% f3 z7 k7 \5 m: c9 Gc <- data.frame( x=rnorm(20000, 9.5, 1.9), y=rnorm(20000, 15.5, 1.9) )
    + y2 u1 z9 p( Z* Mdata <- rbind(a,b,c)- _& j: S2 j" q
    - d5 f- r; t8 l( M: ~, W- y
    #绘制基础的散点图
    # z) H7 b  A# L& _. u1 |, k" aggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +0 i" P: a4 J; w* X( e
      geom_point()
      T9 X1 W5 C, l4 c  A8 ]& I3 `3 o; ~. c4 a5 X; q
    & x- V: ?$ V0 P- u  s- F! c  O
    1 R3 @& p  [. [( i( z+ X
    2.绘制二维直方图。
    , g6 k7 K+ w- p: }( W& W####二维直方图可使用geom_bin2d()函数绘制4 C, N6 s2 Z0 O/ Q$ z
    #二维直方图默认选项0 ^; Q8 I7 Z* U2 F9 `
    ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +, b- z+ b: ^  m
      geom_bin2d() +2 H8 ]$ C# ~& O! L
      theme_bw()! c, C% ?3 o4 `2 H7 Q4 T- C& {

    9 J/ k5 e7 Y6 u( _7 N# Bin大小控制与调色板) n( I# K( F! T8 e7 }
    ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +
    % J8 V# C( a- ?8 z' `: z8 u  geom_bin2d(bins = 70) +# }; D* D0 v1 @' ]4 a; a
      scale_fill_continuous(type = "viridis") +
    $ ~2 @6 O* s" N; F- l4 _; B  theme_bw()
    # b8 L, E. _, n% `1 T* Z( V* [3 T/ R0 p- j4 f3 Y' v

    + k5 n0 x) T- `" m7 \( `

    R语言|绘制Hexbin图

    当显示大型数据集时,散点图很难解释,因为点不可避免地会被覆盖,并且可能不被单独识别出来。hexbin图中将地块划分为多个六边形,图中阴影部分代替了条形图的高度。图形是通过R的hexbin包绘制的。


    8 N8 a' i( n. d3 q0 e# Packages
    7 j4 g# K0 k5 b# {' g' Q5 O1 C) ilibrary(hexbin)# z1 N6 Y+ Q, \% B. |0 ?: Q
    library(RColorBrewer)
    * i! q( y7 l9 G" |7 _! s
    ' p; I+ P6 h7 r0 |+ a; p2 ]5 L# Create data
    + U- Z7 d6 o4 v8 s2 Ox <- rnorm(mean=1.5, 5000)
    2 y# W; j. Z5 j; @& |2 p( `y <- rnorm(mean=1.6, 5000)
    ; y* j, Y2 c+ T8 T# |; O" i( k% z, @7 `" m; r% [
    # Make the plot
    0 E3 f* z$ c2 ~9 i; [bin<-hexbin(x, y, xbins=40)" k( d" e* G/ m) G, y/ E. V3 j$ L
    my_colors=colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))8 Y/ R$ m( x7 [
    plot(bin, main="" , colramp=my_colors , legend=F )
    / k! s" a( @+ ^6 ^' R) f' f: \  m, [0 {  j, F" S
    * P* S- m* x, g( I3 B& L' x% L4 ^
    3 E. \# \/ y: K, U
    zan
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