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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |正序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录. }+ t0 A: x# f* x  f
    书籍:《R语言与数据挖掘》4 @8 x# s& z5 S2 c: _
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
    - Q& E, A! y. G' e; k( flibrary(reshape)3 b/ }5 u: M% j1 J% Z( u2 m4 u
    CO2  B, D% `, u2 Z- }+ H' o( e
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat")); {) `3 N2 d: i; x- }

    / D& B' _0 a; G, v' P* y  c- ~( o#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    2 A4 t! [4 F2 g9 d& `- d4 [+ n> anyNA(CO2)
    % J+ _0 {* T: X[1] FALSE: Q# `6 q5 S* \) R( \- X: t7 G
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    # P$ a; Z8 \8 \, ~# C5 z2 y6 [# @+ Q' H" o
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    / N* N. G  I+ \4 Q4 I7 P# X9 D7 n#篇幅问题删除部分输出数据/ k" ]& D5 G7 t
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    ; Q% o* d6 }6 ^* C+ h$ } [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    0 b2 F8 d7 q% O! y0 e8 y3 \( }[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.41 h# }, [: S6 A" N; L$ \
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    & l% ?+ _" B9 V( G[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2: \( T2 ]( r1 ^
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9( w7 F" e& Q2 Y
    > sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)/ \/ |) [! l) e" M7 S# y
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    4 R: z2 O/ o5 g2 O5 ^- {' e[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    8 R$ C0 F1 q: X* x6 B6 k3 I[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    $ X! ]. P0 ~2 j4 e7 R- D# l[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9- {/ _$ @) z: H( Z& E/ Y
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    ( _8 H* A; X0 {
    ( t6 S  a* m+ p( e9 U> CO2[order(CO2$uptake),], ~9 F$ g; Q7 Q/ L* t
       Plant        Type      Treat conc uptake
    # Y  c1 Y) @6 ]: ?# T/ u71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    1 V$ @. [) V6 i4 ?29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
    ) {8 \1 W" v" @64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    9 W. Y' v# i, w/ R1 y% F+ a1 A43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    ; D- e: b& {2 f  X! x! U; s78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6$ x4 a5 |( m& v% a& h! u0 f7 M/ Z
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3+ `4 ^9 |) N4 S8 ~$ D. l& o
    % ^! e4 _7 K- @+ ~+ U! [: w& ?
    > CO2[order(-CO2$uptake),]( I' q% u9 s" a! H# m
       Plant        Type      Treat conc uptake5 h/ {) }% o9 Y1 ^; \7 o- N3 B" m
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5, x1 g6 J, s6 G+ q6 E1 X' Y; n2 T: I
    14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    / _- b( n) p9 X; i! E. \2 B/ @20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    # e1 [6 C8 y+ @, R9 e  {& j# S19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    5 p( S9 w9 u0 |$ p35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4" x  v6 U, S1 }- P

    : ~4 t. F9 b, `+ V) R- p#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:42 s9 E) R* x0 V! t
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    8 o$ g0 E; v& h/ H' Z) ~(sample1 <- CO2[n == 1,])
    8 D' q- M- Q7 N(sample2 <- CO2[n == 2,])
    ) H; _2 O# J$ A2 _8 Y8 F" O6 X, X7 n
    ( `4 F, |4 y0 j: f#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
      f  t) p' N) r* c+ J6 A$ `tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)3 Z8 |1 i+ {* ]% }' Y6 W4 N
    9 }; H8 w8 D; M5 s# x% i& w" b
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值. @, V; X  f. t% ?
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean); G, j9 |* ?  B( _
    - J% ?+ @+ J  @! M$ z$ Z7 T
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    ! Y$ O: O9 x4 o8 |/ j9 c$ d; |0 \lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)7 ], n) Z5 f5 H% h9 P1 E6 T" f) J
    * h7 y4 ]1 q9 W' u
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中/ y: E' E( t* w5 k' ?- K8 w0 Q6 n
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    1 N8 k+ B- p" TPlant_Qn; X: Z" s  b; @( n2 ?* j

    ) X# [. V3 Z: A* [$ H#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
    : J2 L9 F& m/ q( r3 u! A" Q" C7 I
    / j& |8 J1 `* P; E
    0 ^& F7 }' n- S) O6 }7 p0 U+ M5 C#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
    0 f# `0 a& z$ T4 D' t. M#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……7 @* a; Y% `) r% a- k
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    ; v4 ~' h  H# E% E& t8 W
    % J( ]. c. K0 T. y9 }! klibrary(fBasics)
    # i- E2 b. l: X: R1 v- k. Astat <- function(x)
    / g! O! w: G* M  M: X{
    7 g7 m) t. |3 ~( u  H4 f+ U  if(!is.numeric(x))# b  \3 ^7 R: _
      {2 |9 J* a( u! R) N4 X4 A
        stop("the input data must be numeric!\n")
    : Q, F+ W! ~) r' _; f# F  }& E- e4 P6 H' Y4 U
      if(length(x) == 1). }2 O6 }+ G5 v1 u" I3 C
      {0 m* V6 x! U8 i1 n6 ]8 i( a. F  L: R
        stop("can not compute sd for one number!\n")
    $ z' r( j; J4 O- U  }8 b( ?& ?. w0 r/ Q% z, l* B8 Y' Y
      max1 <- max(x)& {! Y9 J  i0 S' L: C* u9 B+ V/ k
      min1 <- min(x)% ~+ t' T- w* n! v3 l0 I7 M& p# i1 X
      mean1 <- mean(x)
    ' o1 w: [2 l. Z; h6 c  skewness1 <- skewness(x)) b1 v' n  f3 u- T1 u0 r- T
      kurtosis1 <- kurtosis(x)
    " i0 L7 u9 P* n$ E" R$ g  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)- @, q- P, ]  E) v" k% j, z8 B" Y
      return(answer)
    7 {% J1 [5 \! x/ B' N  I9 j}0 G$ k+ u- y( G
    0 }1 ?- P- `# z1 K, m. C
    t <- rt(100,2)- C7 h+ l9 o! Q
    stat(t)3 z! H9 i% `! F. |2 J
    : W, T3 v5 e5 L4 J: P7 f

    3 f& ~& A' k6 Y' w1 l/ B
    0 a" K" H$ s4 e( y' |+ u' p: O$ u4 O" x6 H" \! k2 w/ f/ ^
    zan
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