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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录% G6 b' R6 E. e' m4 P( }
书籍:《R语言与数据挖掘》5 ]9 A% K) S# g4 i- B4 ]1 S- d
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
/ \/ ~" _( d) K! _library(reshape)+ [0 D9 M* p# r" a; v, L* ~
CO2
2 {% z' t/ r) A+ D) }) TCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))! S; D! i6 h0 I6 ]/ g3 ~8 _
" j& {3 H4 x! p& H
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行/ Z# l' }+ [$ \' B: K% i
> anyNA(CO2)8 c' |( K @0 l" M1 y
[1] FALSE
, S6 ]- U! w7 |3 V+ o1 N. L2 s#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]- J2 V: u* `/ @# u4 i
0 e0 |% y; A& c. @2 M
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)6 t: z. \" \9 @7 @+ n
#篇幅问题删除部分输出数据
+ C- @$ D8 K2 q3 ]; m1 j# t2 @> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
: t5 b5 r& r' K [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
: b9 |" }! V. I" u# z- M[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.48 Y1 U; J' u- s
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
8 P7 f, ~0 d K$ ^: T: d[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
6 P, V) w. z- z, _: ^[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.97 y6 g& z/ X: H' E
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
5 v3 N2 N5 r" S- W0 f; X# p [1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
, H$ v& V" E# z3 _7 k! U% j[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.19 E3 p6 N6 m+ v$ V0 R2 I0 A
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
0 {5 l! F4 ]0 \& e+ p[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9- G3 c' B3 f; Y' y" y
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3: C! ]6 Y+ A5 z1 f( d
; K- S5 s, \! P- u8 p
> CO2[order(CO2$uptake),]
8 S* v# e7 w) i Plant Type Treat conc uptake6 g3 ~5 N# v, J Y; u& K
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7% t/ |+ O$ Y( f* M/ Y
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
2 D; ?2 d% \7 {4 d; F9 _4 D64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5! Y& ~ n6 o0 c# S
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
n+ x; T. X: N* l8 t/ f78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6; W2 Z0 Y4 l* ?! c
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3: Q1 E% k$ ~4 z7 ?3 l- t
" L7 O W L( | N& y. F1 O# N
> CO2[order(-CO2$uptake),]
7 m2 W, n3 {' [* v8 g% G/ ~) a: e Plant Type Treat conc uptake& }- p0 l' R8 n3 ^' S; q
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5+ z4 ?( J: k1 q$ Z+ l
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
$ x" i# i' z X1 @, k. E: U20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.95 X f' t! x- {! Y: n% W1 j
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9' c8 U3 G. y. q0 }) T
35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
5 v3 N0 W. [2 |+ L7 x/ A% d8 A- ~: m, z/ q5 a
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
9 }: D: b4 K5 f3 o% R) r& Gn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))& { q+ h& e7 x. s5 m+ B& q1 u
(sample1 <- CO2[n == 1,])
8 K. M9 i& B' P' f* J8 E# t. z+ f- e(sample2 <- CO2[n == 2,])
1 ~# f) _2 b9 ? l% T* M4 A0 e, P6 S! d! d' m1 W! w
#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
1 g( U- G$ @0 C: M! htapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
! s5 H7 g/ x0 y8 w/ }1 \
9 D; u) g1 K/ |5 Z- f#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值# b ?* F, X3 K- a! X
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
! Z+ T8 N7 d5 Y. G( N5 \! Q
, s* a# m1 V5 q#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值0 H/ n7 T9 Z- Z/ R) h% E$ ]
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean), Z. S' x; J8 n! @% K
1 M; O, c0 e6 k. G5 s* n* T5 f#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中" Y8 P. p. g& x4 \
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)% U1 B0 Q/ w2 i) m4 K( } s
Plant_Qn- f( M( ~6 l0 T% o
2 J/ X m* p- `( J! Q6 [$ j, R
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“0 p; G$ z0 W0 P* W6 M; n8 o. d
2 I% X T9 `- Y% M- e
; v9 ]$ R' q. _# W: W* `8 Y
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
4 z% N" y+ f7 W$ J* H" |" C7 _#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……7 g! E( T+ G4 k% P! Q
gsub("[t]","t",CO2$Plant)
8 X- ]" l4 T' [5 w
6 R u) @( E4 d. ?3 g& i( @library(fBasics)" z1 C6 L6 X/ h9 F; ?
stat <- function(x)
- a- V$ q% T/ A. y7 O; ?{* g' o" e% Y% K, \6 M
if(!is.numeric(x))
w0 m4 u8 o# b$ f8 x2 [6 W {
: i+ U; o$ B/ e8 B, K stop("the input data must be numeric!\n")3 }8 ~8 i& g, z3 {. p
}8 C9 U$ q1 m' T4 o. A9 L A6 h
if(length(x) == 1) w4 [( j8 }5 a1 ?8 B! \. J/ i
{
/ K" e# f9 q7 m& o stop("can not compute sd for one number!\n"); E8 i4 A; k2 U5 k
}
8 d3 m9 L' K3 h# h8 Z max1 <- max(x)/ r$ D5 O2 v) ?2 l' V, u
min1 <- min(x)0 A! L1 f& m2 L/ c
mean1 <- mean(x)$ A- \9 Z5 \* e
skewness1 <- skewness(x)
/ K* `& j9 q. B: o' n kurtosis1 <- kurtosis(x)
- E- Y v a2 L+ K: F" G answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
, o# r6 u5 {; ~: d return(answer)
2 C) S$ o' q- r- c) z}
1 }8 @3 ^- O6 c# q. L0 g4 {- h. u. B) y/ \( B' Z
t <- rt(100,2)
0 @* e' o( l, h( C5 h. t( E& tstat(t)& U7 k! ?( ?# D6 G6 a
7 ~2 u2 Z0 A; R: l2 z
. }4 A) i2 d* N# M: \- @7 g: P4 \8 u5 F' p# V
' o8 [1 [$ f+ j% X* L |
zan
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