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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录. }+ t0 A: x# f* x f
书籍:《R语言与数据挖掘》4 @8 x# s& z5 S2 c: _
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
- Q& E, A! y. G' e; k( flibrary(reshape)3 b/ }5 u: M% j1 J% Z( u2 m4 u
CO2 B, D% `, u2 Z- }+ H' o( e
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat")); {) `3 N2 d: i; x- }
/ D& B' _0 a; G, v' P* y c- ~( o#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
2 A4 t! [4 F2 g9 d& `- d4 [+ n> anyNA(CO2)
% J+ _0 {* T: X[1] FALSE: Q# `6 q5 S* \) R( \- X: t7 G
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
# P$ a; Z8 \8 \, ~# C5 z2 y6 [# @+ Q' H" o
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
/ N* N. G I+ \4 Q4 I7 P# X9 D7 n#篇幅问题删除部分输出数据/ k" ]& D5 G7 t
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
; Q% o* d6 }6 ^* C+ h$ } [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
0 b2 F8 d7 q% O! y0 e8 y3 \( }[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.41 h# }, [: S6 A" N; L$ \
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
& l% ?+ _" B9 V( G[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2: \( T2 ]( r1 ^
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9( w7 F" e& Q2 Y
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)/ \/ |) [! l) e" M7 S# y
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
4 R: z2 O/ o5 g2 O5 ^- {' e[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
8 R$ C0 F1 q: X* x6 B6 k3 I[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
$ X! ]. P0 ~2 j4 e7 R- D# l[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9- {/ _$ @) z: H( Z& E/ Y
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
( _8 H* A; X0 {
( t6 S a* m+ p( e9 U> CO2[order(CO2$uptake),], ~9 F$ g; Q7 Q/ L* t
Plant Type Treat conc uptake
# Y c1 Y) @6 ]: ?# T/ u71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
1 V$ @. [) V6 i4 ?29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
) {8 \1 W" v" @64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
9 W. Y' v# i, w/ R1 y% F+ a1 A43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
; D- e: b& {2 f X! x! U; s78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6$ x4 a5 |( m& v% a& h! u0 f7 M/ Z
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3+ `4 ^9 |) N4 S8 ~$ D. l& o
% ^! e4 _7 K- @+ ~+ U! [: w& ?
> CO2[order(-CO2$uptake),]( I' q% u9 s" a! H# m
Plant Type Treat conc uptake5 h/ {) }% o9 Y1 ^; \7 o- N3 B" m
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5, x1 g6 J, s6 G+ q6 E1 X' Y; n2 T: I
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
/ _- b( n) p9 X; i! E. \2 B/ @20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
# e1 [6 C8 y+ @, R9 e {& j# S19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
5 p( S9 w9 u0 |$ p35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4" x v6 U, S1 }- P
: ~4 t. F9 b, `+ V) R- p#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:42 s9 E) R* x0 V! t
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
8 o$ g0 E; v& h/ H' Z) ~(sample1 <- CO2[n == 1,])
8 D' q- M- Q7 N(sample2 <- CO2[n == 2,])
) H; _2 O# J$ A2 _8 Y8 F" O6 X, X7 n
( `4 F, |4 y0 j: f#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
f t) p' N) r* c+ J6 A$ `tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)3 Z8 |1 i+ {* ]% }' Y6 W4 N
9 }; H8 w8 D; M5 s# x% i& w" b
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值. @, V; X f. t% ?
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean); G, j9 |* ? B( _
- J% ?+ @+ J @! M$ z$ Z7 T
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
! Y$ O: O9 x4 o8 |/ j9 c$ d; |0 \lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)7 ], n) Z5 f5 H% h9 P1 E6 T" f) J
* h7 y4 ]1 q9 W' u
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中/ y: E' E( t* w5 k' ?- K8 w0 Q6 n
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
1 N8 k+ B- p" TPlant_Qn; X: Z" s b; @( n2 ?* j
) X# [. V3 Z: A* [$ H#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
: J2 L9 F& m/ q( r3 u! A" Q" C7 I
/ j& |8 J1 `* P; E
0 ^& F7 }' n- S) O6 }7 p0 U+ M5 C#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
0 f# `0 a& z$ T4 D' t. M#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……7 @* a; Y% `) r% a- k
gsub("[t]","t",CO2$Plant)
; v4 ~' h H# E% E& t8 W
% J( ]. c. K0 T. y9 }! klibrary(fBasics)
# i- E2 b. l: X: R1 v- k. Astat <- function(x)
/ g! O! w: G* M M: X{
7 g7 m) t. |3 ~( u H4 f+ U if(!is.numeric(x))# b \3 ^7 R: _
{2 |9 J* a( u! R) N4 X4 A
stop("the input data must be numeric!\n")
: Q, F+ W! ~) r' _; f# F }& E- e4 P6 H' Y4 U
if(length(x) == 1). }2 O6 }+ G5 v1 u" I3 C
{0 m* V6 x! U8 i1 n6 ]8 i( a. F L: R
stop("can not compute sd for one number!\n")
$ z' r( j; J4 O- U }8 b( ?& ?. w0 r/ Q% z, l* B8 Y' Y
max1 <- max(x)& {! Y9 J i0 S' L: C* u9 B+ V/ k
min1 <- min(x)% ~+ t' T- w* n! v3 l0 I7 M& p# i1 X
mean1 <- mean(x)
' o1 w: [2 l. Z; h6 c skewness1 <- skewness(x)) b1 v' n f3 u- T1 u0 r- T
kurtosis1 <- kurtosis(x)
" i0 L7 u9 P* n$ E" R$ g answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)- @, q- P, ] E) v" k% j, z8 B" Y
return(answer)
7 {% J1 [5 \! x/ B' N I9 j}0 G$ k+ u- y( G
0 }1 ?- P- `# z1 K, m. C
t <- rt(100,2)- C7 h+ l9 o! Q
stat(t)3 z! H9 i% `! F. |2 J
: W, T3 v5 e5 L4 J: P7 f
3 f& ~& A' k6 Y' w1 l/ B
0 a" K" H$ s4 e( y' |+ u' p: O$ u4 O" x6 H" \! k2 w/ f/ ^
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zan
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