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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |正序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:/ c6 u3 ~( H7 h

( j! C$ U9 O7 O8 P3 E1.函数定义:4 I, Y+ L3 t1 V- w' b
& ?' p: T$ f0 P4 I' P9 ~: u
2 G* h: i" d, Z1 F+ G2 w
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
5 N) E$ O( |* W% u& P, h1 L* d0 W- q
+ i' c; Y$ P9 Z& K0 [& U" P
" S9 t. g% E( y/ _) S3.数据读取与标准化:
, _6 W, v& Q! g! @1 W: d2 |! Z
. C$ F: h+ _( X- {$ E$ S* }$ J
4 t; W* L6 d( P! p4.将原始数据raw_data赋值给变量A。) N4 _( I6 T0 j6 ~5 X+ }
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。1 O+ B0 k* W1 N" u4 u6 ]7 N) G
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
9 t% P" |$ l& y7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
6 U/ M* J, J  j% @# M' A' p2 P) e. z+ i: J; T8 q$ t
( t1 [- H/ j* X* b; ^$ P, j
8.求解相关系数:3 }9 [  L! Q, Y- Y' a1 `
& Y9 t6 X. M4 X2 k- H
- ~; F3 ]4 O5 q* h& p7 t( U
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。2 W1 w  m3 v. e  |$ R$ E. O5 `3 ?

: `# C+ O& o+ P  {4 c, m% h% Y( x* O3 D
10.计算特征值和特征向量:9 y/ `; U  h/ I+ d% O. P
$ S1 I5 x' O6 L& e1 Y

$ @7 h4 ~! a0 P9 c1 ]11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。  x; `7 ^# |3 @  u; b

/ d, c! H. U# T
( H- x7 a' _1 @& r" o8 i12.提取特征值和计算贡献率:
2 |0 `8 u1 K1 v7 Q. T, C/ H: V+ P. y" \& u. S
% W% ^7 V: `+ g1 a. s* y* Z
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
( O+ ?1 S5 T: ]+ j14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
( |7 s% m  M, R/ ^, g15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。* C, G2 N' W2 \: y) ]
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。/ c6 `7 N" l" |. ~; b
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。
" }8 G1 Y* O$ \/ T  |
6 t* Z# V7 i: P2 B5 d6 ]4 U9 p( I) q4 ^" ]& M; A$ a! d
18.确定保留主成分的数量:. o2 m' h. d8 k3 a! j3 H
& g, l5 r6 j; S, b3 X

' ]' p- ]) Z, |! _2 R/ Z  @5 w' f19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。7 ?$ J' ]6 j5 |: ?  l! j/ W
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。  ]! w- ~4 z. p3 ~9 r8 G
+ [7 d: K0 a0 g2 f

& U# f( o. n. R$ `- [21.提取主成分对应的特征向量:. }# D5 |" I$ H+ w
4 H: Z6 [/ X/ h1 }! e
% @0 D, k1 i0 D) T1 w; r# a
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
: t8 G* _9 I$ N* q# B9 G% i* \! _; W! V0 c

7 X4 M, A6 ~0 m2 _* u# W23.计算在主成分上的数据得分:
% e2 U" \& i6 g6 j. k9 ^8 W  {: D( V' |& w8 S( y

7 E/ a5 r4 A9 Q& y, z24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。4 l1 P* S5 c# L+ \+ k5 Y/ F
$ \3 e. K  Y0 |8 B! Z0 b3 O
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
1 n5 c" {* V: Y' s) w; r8 l
2 v8 K5 S# O# j' d* [. v
( V( g/ J* j! J1 ^5 [) d/ O! K* w
5 C: F9 |" A. [. e+ A! x3 P# N! ?, J+ [4 W; c
, |  g/ h2 w5 y  N$ K! v8 B

PCA.m

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