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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:' S: ~- s! l, r4 n, Y! ]0 b( g
q: S2 ?+ R; L* X
1.函数定义:
5 d2 T% k' `! }4 ~* k% K( n& i3 }: A: G
# H7 r3 V/ `4 U- U/ ~
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
# U+ R6 s# R( E$ g7 c. T% {! f
0 F" _ [0 L" N$ N, z8 |6 ~
5 a# A9 i7 ]3 c; x( k3.数据读取与标准化:+ [* A! J4 D( y% I& m
2 S/ Y7 i1 }# _8 {5 x& W
; [: B% v0 J" k4.将原始数据raw_data赋值给变量A。* ~ J- ^1 z4 {' y
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。) u1 h9 ]# k* C5 k* }
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
/ S3 T( ]: M! g& H" Q* Y- s% D/ ]7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
2 q2 i/ n9 v) g) g8 [
! x* B4 ]' u# O0 W! f
) ^* T9 `. i, o( R8.求解相关系数:! t2 h( G& l1 y
. m; g7 d( x& b1 M6 |! o9 w
" G, J, X$ q q" k9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
$ X9 s. n$ u& X) U9 ]: v' R0 N3 s! c3 U# u" ]
4 B& r N! s& a' n7 [3 a: `+ S* H
10.计算特征值和特征向量:
1 K: t) p% m4 r3 p8 j' N9 u; w0 B5 ^7 m
. }. a7 D, y- u8 b/ D% B
' @ X; |4 @# y% t& Q4 e8 ]4 [11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
1 Q9 Y8 s, m8 Y3 G; N% E3 g% u
5 [0 p; Z/ g0 l9 _' I
W* Z0 g* e! P6 s3 w* w12.提取特征值和计算贡献率:1 }8 X5 l3 q) O; _6 M* H
8 l% a! r$ X. v, A3 R! x2 S; r9 x9 o( a
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。, b( I. v- g* _& a
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。* l& E4 N7 ?5 T
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。$ }' f2 ]3 e1 ]$ q
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
8 w8 Y7 u/ ?$ c5 ]$ E) e( Y" o: l17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。: B9 W9 j, K# b. ?
1 V- k' s6 h' r/ Z" \' b7 d/ N6 m' R+ n6 K$ [& T4 j& | D
18.确定保留主成分的数量:" d- V2 Z6 F- J+ A) o
+ x+ B& l5 L) m9 X
% t: c/ h2 n1 @/ ^' b19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。3 j* [" h: r! k$ ?8 @" ~
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。& Q( t% V8 j; R4 j. c
8 x* N/ s' y1 y9 H$ D& T( z# K3 I
- A# A" b5 v" _" E- ~21.提取主成分对应的特征向量:; V. S1 B: C7 ` Z& W3 Z
/ ?* K# @& p, C# h2 d% K. s
+ t8 F6 q- E( B7 W' A: z' ?% N22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
6 i; U# `6 M' d& \/ @, B
/ Y6 J+ }& K% \# ^. _5 Z$ p" ~& A( h
- H5 g/ S4 t# R" q3 G3 R8 W* {23.计算在主成分上的数据得分:
- N" G8 w! Q+ z3 T" B/ B+ U* \, b" u4 K8 K( A
, X: c4 p7 Y: Q! D) E1 N! t24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
4 U9 e! O: o0 s+ {
7 A. f- s! K1 a6 M该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
& w0 z. \9 _$ J" @7 P
4 }3 M R: Y* J
: |3 G M# l# y: |# W! N! e/ D% [' W3 Q# B' m4 S
; K0 h8 Y* F3 X) B- D# o6 k: c2 b
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PCA.m
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zan
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