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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
5 {* z/ s3 U0 ^' q/ h7 L5 e, ]9 H9 [
1.函数定义:( O9 G% z m+ ]5 Z0 _4 D/ U' B+ {( c
3 {4 n( A* q2 b1 y, ^" h) U' F9 z" g
8 }# j5 V9 |& t t& {* Q: Q0 ?, ?+ n2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。* J, X; ~" y; { p) f+ K; |1 \
: @1 ?% H | j
& n9 w d+ w4 g6 S9 ^1 D3.数据读取与标准化:
8 j+ N6 T" i3 k9 E: k% o6 F8 Z9 ]3 k- _; u
2 X! i; R* [. q6 j3 Q& V& v$ R4 T/ k# o1 c4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
; ?7 P- A$ p% _5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。 C) l2 A/ j2 d' q& N3 B/ X
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
; e o" f; I% X- e7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。0 ?# m" |7 K0 r0 h: R: l4 @6 F
# e+ k6 V3 t% w1 }, L) F& U7 S9 T' s6 Z; O2 R
8.求解相关系数:- f, O) i; @% [% a- {" u) l7 U
* K/ B% x0 N. Z6 M3 Z* l! R* j3 f/ m3 o1 h
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。/ l3 C3 A( c& S Z5 O2 z4 J
! H0 z4 I+ N( r7 G
e/ K" E" D5 b* J2 S# w/ q' _
10.计算特征值和特征向量:
, e ^" A0 L" N0 s) ~$ Z' z& ]+ c$ D. H' j" s4 W; b% W6 P
' }: l7 y- @" \7 G F+ m" H* v
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
! ~5 J4 h2 a. X3 D" Q/ m9 w
& z. X4 g! L/ m; Y' Q |
0 { H. i1 S( d% R" p# W' T1 j9 X# z. C12.提取特征值和计算贡献率:
) {/ D1 K; d, p4 p5 X' o4 X( A6 }4 }) L" A# C- n! j+ V9 G. B
) y5 N5 J" X$ t b7 @/ n* L
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。- d$ d$ k% O2 \ O+ e4 t
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
V1 F/ w4 X! n3 p) s* [& m! U8 |15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
# C/ x. O4 ]6 ~& Q7 Z0 D2 F2 I4 D16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
4 B# s& J) J1 k4 @3 C2 g/ l17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。. |0 _& u+ G# _
7 O, r4 K0 V9 M3 }, f) H
/ L/ V: c) s P1 _ T& u8 t% D18.确定保留主成分的数量:
3 m/ t- d# G3 |% y0 G4 R0 I) }1 Q I A
# K+ i" D$ D( q2 t( V4 B: L- Q4 d
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。/ C! e( e& J; Q3 p5 k
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。+ ~: U5 `9 R1 ^$ n/ j5 K' e+ W5 u
. _( r) ] V6 y
: E% @6 E" x. Q0 s8 f& K0 w% }% R21.提取主成分对应的特征向量:
) g$ i. Z5 q/ s- {3 u
& r. k- B2 e" ?+ c0 L6 B% i/ B, r. a
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。3 k1 ]7 U, u! l7 S1 q" G5 p
' D0 o4 d* H6 l% T4 i' X1 T$ \" ^ B, ]. k4 ?
23.计算在主成分上的数据得分:
- ~. ~3 Y3 K8 J* W$ j5 l1 e3 k# y$ S" b& ^ M$ x
/ R# h: E" N4 w; {
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
& M5 U& t+ _$ @1 r/ Z; r
. Z* G8 G/ P4 m9 R* X. k该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。8 m1 B5 ]8 a; ~* |8 `
( U8 ~1 U; |% M8 q2 _' W, j- T, Y d2 K2 U5 A1 D
, ]8 L9 B: e3 Y6 G0 |& A% @& t7 H1 E ?* k- u
, n" D: Y) J4 p& w: ^. i) |9 d |
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PCA.m
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zan
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