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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |正序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。8 i, g6 [6 x  b$ h, k
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
+ V2 Z, M. ]/ W% W" D; A8 k主成分分析的步骤如下:
* f7 D7 I) E) L$ a+ o# J' {+ U( o# [, T" P3 f
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
9 k  N- y% [( K# z8 c2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。
7 N$ h  P& g' i4 a/ b& a. D9 r3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
. e  J  y8 r2 o8 x$ v# I) a( Y4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
2 H/ e3 {+ `, l4 ~, |: y5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。
; |# X7 g' _  M/ `  w6 O) R% ?2 }9 I2 p  A
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。* `5 T0 ~0 }& z" j7 K& ?3 a" R
3 a+ h1 t3 T1 d, ]- T# L8 }
逐行解释代码的含义:
* H+ g/ h( R& z4 Timport numpy as np/ a# }* E+ q* a; t
import pandas as pd1 M: O0 {* h' w/ u4 S2 \. y: @
from sklearn.decomposition import PCA
3 t* `; q9 w. |8 J6 Q2 T+ h% W1 f1 ~
这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。; r* p9 j/ s& Z0 H) d$ [# i9 Z7 \
df = pd.DataFrame({3 p2 m7 o) Z) h* s! T' x9 E' R
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],. m9 c7 x" [+ |+ r# Z' W1 K
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],3 f8 U* ~/ \4 w0 Z/ p4 \
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]/ f3 s' r& D% M8 w$ y) S
})# @8 Z! t- d. J& D$ x
9 v% }" r* M+ _" T* l9 n, f
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。
2 l- Z& L5 Y( C6 J6 F% [. c0 W. vmodel = PCA().fit(np.array(df))& ^7 f' }% ]2 }0 ~
4 Y! a' m" }; C
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
& `2 W- j1 _" d) _+ Dprint('特征值:', model.explained_variance_)- E4 X- X; u' Z$ ], b6 D
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
' y4 e# Q# i4 l5 G* rprint('各主成分的系数:', model.components_)
$ X& x' \& b" r4 X4 J* L4 t, }: ^2 Y  H
这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:
- ?# U  R5 o4 V
$ n4 U! W" P) o8 Y' X& z1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。0 e4 K) D3 x8 p+ c0 y2 g4 @! O
2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。0 t9 c9 d- y* r8 w5 \7 [$ l5 D
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。
# w/ s6 j- w# `7 R8 H0 |
; P/ d8 o. L8 N* |; D! C9 g: X2 e; mpca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df))); d* h; e& K$ V2 H) L
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']2 n; @7 j/ E. h. G
pca_df
8 }. j" n7 U, t  T' M: r3 f7 ~3 P( c
这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。; Y% |1 k1 C4 t, G
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
# H% c+ I5 g' G2 P& i& N3 O  G! }2 f" {+ s4 G
. I  d) C" w/ V

29.pca.py

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