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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码2 H6 s$ q, y3 V% J8 ^\" s& X8 [
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维7 A) ?2 N8 ]: K' X# A$ }4 _6 ^
- function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)- g* R ~! ^\" F6 l+ Q. k: W
- %% 偏最小二乘回归的通用程序- K) a& e$ A- E\" Z3 O$ k! D Z
- % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此. I6 F- f& b- z% n2 R
- %% 输入参数列表+ G1 [# ] X\" R* z& V; R2 u0 G! r
- % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长
4 g% @5 _\" s5 X% G- M, e8 {! n - % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分7 t( a- B+ s\" { d0 {5 [
- % x 验证集光谱矩阵
& E' F6 y# P; O2 ~2 L - % y 验证集浓度矩阵2 `8 C, g& t\" G0 L! }
- % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定; ]$ a; R, U, [* i$ V
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定) {! m/ V\" ]\" `' e6 ]0 I. D
- %% 输出参数列表- x6 J& X( s' z& X0 r
- % y5 x对应的预测值(y为真实值)# \. F) e- z+ p3 h5 X. g; u* G
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y
\" X6 k/ i8 R- `6 J' U5 f - % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
& S- P0 S3 F* B8 K% x3 E' q -
, H* w& b8 u7 o9 h9 `5 b d! M4 Q! B& E - %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理
. ]8 F/ i' _3 `# Q. H$ v3 N - [n,k]=size(X);: F) `0 ~4 i- j/ b4 C8 O' k
- m=size(Y,2);
2 J# j$ x# p4 p: T( b- t9 H5 H! X - Xx=[X;x];
, _( w8 n2 `; x( U3 p - Yy=[Y;y];3 N$ M7 G: f' Z. Q7 l0 Z
- xmin=zeros(1,k);
, _0 C9 K% {3 M1 O$ g - xmax=zeros(1,k);4 S4 L8 p) [ |8 K\" y
- for j=1:k% `4 ?+ w# U1 ]
- xmin(j)=min(Xx(:,j));0 d; R& M- z# s2 G; Y0 A
- xmax(j)=max(Xx(:,j));+ D0 _% \6 I) m6 h! r
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
5 n8 L) p) q. W8 U# Y6 k - end\" k# i- {) ?* v6 \, q4 T& Y4 s
- ymin=zeros(1,m); k) i- C5 q4 `: @- V: P
- ymax=zeros(1,m);3 Q\" l w$ f6 j2 R J( g
- for j=1:m0 S5 c. p+ |' z& k6 o; S C
- ymin(j)=min(Yy(:,j));, f7 P; K: W; Q
- ymax(j)=max(Yy(:,j));$ \/ [+ K2 S) a4 ^! a% T
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
9 |# D5 v6 C+ Z8 K9 Z9 R4 B - end
& j/ ~! g7 f. W9 ^4 j H3 X - X1=Xx(1:n,:);8 @9 ~/ { ~4 r, ]2 w% h( i: f
- x1=Xx((n+1):end,:);
8 w: C1 J; |4 p) I, ?- A - Y1=Yy(1:n,:);
. Y% I1 k5 i2 J5 e1 g - y1=Yy((n+1):end,:);% n4 x1 h/ g\" Q3 V9 |
- - M4 M4 P; S* |$ _( B. U3 ^
- %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间7 D+ e; V. `. K
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);7 N# L) _* ?; c\" x5 s
- [CY,SY,LY]=princomp(Y1);1 c- ]\" x$ d* T* P$ R
- CX=CX(:,1:p);
% e5 `8 B2 O9 ] - CY=CY(:,1:q);
8 U+ b2 f1 P! S: j# T5 K6 p - X2=X1*CX;8 ^4 e6 a( Q! N) F8 g$ F' D
- Y2=Y1*CY;3 @3 [7 z' ?\" U* s0 |5 T5 _
- x2=x1*CX;
L! |4 t9 T/ `5 w! _* ]7 \+ d - y2=y1*CY;; B0 A8 N9 R9 { y* `- t+ a
- ' n z6 h( Y. I: t) x( X4 a9 a5 Z. l$ i
- %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归' |8 g, o, A# X
- B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整# `7 \4 ?! D1 a; _& z1 W; H
- 3 x* W/ w& y/ c( M. m* p6 z- S
- %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y35 [. R; z- P5 L0 D$ l
- y3=x2*B;
\" J5 F+ H, g, Q! P, S2 T5 c - 5 Q5 ~\" f5 c. W3 ^+ a6 {$ ?) q
- %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4! \7 q+ [5 V' T! x( k4 R, o- Z
- y4=y3*pinv(CY);
9 W, w9 u\" g. i# Q1 M# U R$ `! S6 L -
/ u) g J$ m6 _; Q - %% 第六步:将y4反归一化得到y58 l3 U4 I$ E4 ?
- for j=1:m
x4 U7 T7 l, c! j/ N2 G - y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);
2 @1 N\" v4 G( U8 { - end
Q- l& z\" Y5 U# J -
/ u: f* t( R3 J% a1 E1 R - %% 第七步:计算误差
+ [9 G* C- J- c3 p1 a. p! M - e1=y5-y;
, z F# }) F& H' p9 S - e2=abs((y5-y)./y);
) q/ N+ O& @' y& S3 [- E - % k9 o1 k) ~7 B
- function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)2 e4 T0 n' y* B5 r$ ]
- %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
8 E6 L9 l h- j2 }* T! S - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本
4 o/ y4 s+ l\" \8 P/ S' x) m - %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数& K( g2 x+ {; d
- %%8 \\" W. W' r0 j$ a% k3 w& G
- [n,k]=size(X);
: b) @/ n5 _- ~8 Z - m=size(Y,2);. i4 h1 y! ]6 p) {3 x4 i) J6 v
- pmax=n-1;2 `\" ^; V' Y! O2 w5 t* n
- q=m;# [7 L3 C( _$ {! S$ @
- ERROR=zeros(1,pmax); S\" W! ?% {( [6 ^
- PRESS=zeros(1,pmax);\" p4 N4 f8 }8 t: A% h' V
- SECV=zeros(1,pmax);
L% Y' _ ]+ f- @, O O - SEC=zeros(1,pmax);
( }* F) Y5 |0 `- P: A4 H' F7 Y+ B8 S - XX=X;
9 {+ p9 c0 ^: x% r- K - YY=Y; @1 |% W) L/ h& o2 ^
- N=size(XX,1);; A& B* |4 c: `5 p\" t' I2 @\" A
- for p=1:pmax# T% E7 U4 ~. h: o7 q
- disp(p);# Y& q7 m3 N2 v0 J! _/ U( _/ W+ h
- Err1=zeros(1,N);%绝对误差+ L+ g# N8 U6 A8 Q
- Err2=zeros(1,N);%相对误差. s( Y: _\" b8 _$ q/ } O; _
- for i=1:N8 Q5 i0 C; F- B7 H5 k
- disp(i);
\" a$ z& a' a\" m5 m, ? - if i==1
5 s! u. \# v* E& i' A) D( r - x=XX(1,:);/ W2 F- E/ F; h# X+ X% U( ? ]( c
- y=YY(1,:);
3 ]/ F\" x; l; H+ y9 X5 F* R - X=XX(2:N,:);
' P7 N6 G' W8 x. d/ X% i - Y=YY(2:N,:);0 m2 O% @7 i8 z* a8 ]
- elseif i==N7 d' [5 d B' J2 n9 ^/ U) b5 g
- x=XX(N,:);$ }* o7 T( M& d% J1 a2 i
- y=YY(N,:);
! H$ O9 J7 U1 X3 M4 @\" r - X=XX(1:(N-1),:);
9 X' f/ t/ V4 ^3 Y4 ?5 ] - Y=YY(1:(N-1),:);
3 ]4 ? x5 f2 z, z6 L - else9 ~% D2 B\" I, r1 N) H
- x=XX(i,:);+ b4 j, ~: z. P7 V A
- y=YY(i,:);! a8 k\" U/ R( ~& D
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];
7 q* P; b, g1 x/ |2 y - Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
Z2 [5 u% H0 S8 x& S3 K# d6 } - end\" q; L u% r6 m- U4 ?
- [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);8 {. h; D8 B* _# {
- Err1(i)=e1;( o* _2 V* T$ Q2 K, n
- Err2(i)=e2;
/ J7 o, e2 o/ l2 w3 F. ^4 E& g! f - end6 I. {/ p2 w# K\" c K1 O
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;% C3 e% A1 g I3 W3 H( j5 Q$ v
- PRESS(p)=sum(Err1.^2);
; ?! k8 \9 n+ ` ^* l4 ^# @ - SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
+ }8 W( |; m! o( e2 |2 [) _ - SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
' F\" v' J: t0 r' Q$ D - end0 x' X* ?4 N; K) j\" Y/ A9 Q6 q
- %%5 y8 R& i5 a6 n0 ~& t: t
- [CX,SX,LX]=princomp(X);1 ^! y' E$ y% k; K( [1 V& H- x
- S=SX(:,1:p);( _ q0 X; r0 a0 R
- MD=zeros(1,n);
3 P, t. A$ P4 ?0 {* p - for j=1:n2 q$ |8 s; `0 ^3 ~; p8 H) a8 v
- s=S(j,:);8 z) G6 Q9 V, ] S8 y
- MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);7 c& h$ p7 A) X
- end
1 R$ v3 K( y# O
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4 U# m6 ]" C7 X& N# P/ [3 x' S |
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