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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。9 n9 ~0 S0 `0 T

7 @4 {' i( J. [! `( W2 `/ v( \# A! B3 e( V* ?1 s" \! E
一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。
7 n7 W9 z* {4 t! M4 s& Q1 y4 E/ b* {$ T; R0 [
但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。
7 s1 W/ }' e2 {6 {8 J6 ~针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?4 Y& k! I7 C; U
% W7 Z& B4 q; t& {2 k& c
通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。; f& G8 G3 k, K

6 f3 H" _1 K* K& N! i受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
0 E: \8 T  `/ N9 e& p如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:
( W+ N5 x( ?* x! Y  L8 e% g- V(1) y1= x1    简单回归
" ]4 t7 F( k) \6 I(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)  V. Q- p* ?3 c* H" |' t) i7 p
(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)
: U3 q. k4 s# q: p* B/ F(4) y1= a   单因素方差分析& p( }" P. k! h4 e! G3 T* L/ D
(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析
: R- G; e$ p4 D(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析2 ^2 I) W# W: n2 L. [
(7) y1= a x1   协方差分析% y# n: v; H4 P" _
(8) y3= a   单因素logistic回归
/ }9 A7 n. [  @. Z  ~. R(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归6 A( V* N  ^3 P' L
(10) y3(time) =a   单因素cox回归0 z: J& W5 {: |$ u8 z
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归
0 H  R$ F' i5 }) G; H% Y: f
) o. G8 z! D% z& l. C1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例7 [& O: {9 f( b! d& l; ]. h
' S6 w' f7 Q6 n% T) b1 f- R
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。
/ T% q3 e$ D+ E; {% g- X
' g, `1 ~. c1 L% U0 u- Y但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。' `3 o9 W# X; _; T( u0 {; X% G

+ }7 T7 x% I' M8 q% ?9 T再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。
! E# U8 r( o' H, `# B. V- T
  W& K! K1 i0 o" q1 X5 @3 J- m+ B附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较
, m7 `( W; b& N- q5 l   data drugtest; 6 q' ~5 g- B1 b2 q- V. \& x1 T
      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
; [9 w0 X, \; w: j      datalines;
: d- Y6 S( O6 ]$ l$ Y   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
# N( h0 S' h7 w# H9 e: \, ?0 {% ~   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0   ^* z# z+ y  P* z% I- N% A
   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18
* f* N' p  B. l! x0 q% i6 y   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9 4 ~5 \% ^: L' h+ Y5 {3 ?
   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23 5 s* }+ q& @- A7 O
   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20
* w9 F, f5 k( W   ; $ F* y! f( \$ F) [4 x; {6 c. v* [

9 L( j/ |3 Y" K7 ^   proc glm;
2 g4 b  h' h( S1 P+ Y3 T! a- F      class Drug; ) H/ N5 o  T+ s; N0 }$ j- z3 B4 y
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution;
% c6 v0 B7 u, x7 d      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans; 3 G% B8 K0 n9 X; d9 O$ s
   run; - ?) x  z6 h( b$ Y5 {  y2 `
- h3 U1 Z2 u1 i
   proc genmod data=drugtest; 9 p+ d. G3 B  J4 i
      class Drug; ) M) x- ^* }- M7 i  j8 e, G- ]) I
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1; 3 q# L( [( u7 f' {
   run;
% A. ?8 ?! l& M. A$ i# B, |: L+ X8 S8 o+ n9 k0 h* |$ ]
   proc print data=adjmeans; 8 g) Z, H' Y( }" D+ v
   run;# C+ _. Q& Y% u1 d* v: |/ C8 |

. d3 G5 I6 L& D$ R# W1 l
" I3 n' q1 Q# v: z- |+ y
+ m4 V3 v: G% _& A
zan
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飘过

2 ~" T+ z, V  L) ^+ K+ F7 ?学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒
0 |( P1 q! m% l3 ^7 U8 ~2 g2 G3 v/ R
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    学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件
    6 V! M6 B, E  W! {" f/ X”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,
    6 q$ G; @" `2 l1 q3 ]2 {5 c2 e
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @
    4 |# \$ l) Q. ~; `4 O
    深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。1 l& J7 W5 d( u) @- j
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。7 s" v  d9 j8 h3 ]' J: {
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