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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。
2 A  ]' p; [( O: d: ]
" L" a$ B; z* ]5 ~- P) @0 q" J2 Z, x1 b
一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。
! Y4 z! |" H+ D" r9 E7 b& |! ?6 w/ i1 t
但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。
) `( S: ~9 `5 O针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
4 W/ X4 d: u7 n: i2 N
2 Y1 K6 V' |" O, x; E! x通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。
- y' h5 b( R$ s/ }! o/ u2 o. D; C2 \
受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):* d1 Y9 n( e* o# P  `( L
如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:
9 g5 B" ^& k' s+ g1 g(1) y1= x1    简单回归8 B& y/ Z" f% t
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)
9 [# L1 r9 y0 D3 K(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)& D7 P( B6 d1 G" k& j9 b7 p
(4) y1= a   单因素方差分析
+ y1 j$ @* A; d6 R9 w(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析% {2 {; g3 ]# `; L) n: i
(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析! ]# f8 C+ a7 ?9 z3 s; R/ \6 s
(7) y1= a x1   协方差分析9 c9 e& o% o  i$ r
(8) y3= a   单因素logistic回归* ]" T) p2 u7 V) w+ [9 f3 M
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归
% R" n) J) Y1 d# T7 T! {(10) y3(time) =a   单因素cox回归
) I! O5 A  t: V4 T* s(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归# K$ r2 a  d, m6 c' k
( x; i' P6 Q, O
1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例
) R* n3 F1 S. T7 O. v- Z1 E' A( d4 [! w, B$ M, ]
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。
$ |2 a& J3 H2 x. `$ y4 k* F4 g  p0 u- J9 i" B' J5 A
但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
! _+ e5 l% h6 c' A
: _' J* z6 Q* Q2 G+ l再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。6 j' s( D: T! H! K: Y. U
$ I, X+ L8 T. Y8 V/ H+ K
附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较
/ @: K' U8 C! T% U6 z8 f% \   data drugtest;   a' ]; @1 z9 L4 S+ ~
      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@; # }$ m- y- S) s! C0 G
      datalines; , f6 ^7 F8 d8 k6 r: p0 B
   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
! A7 n$ W' b8 {- |) [' a7 D   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0 / g; h2 a9 L  C9 x! E6 F
   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18 ! S* Z5 a* x7 G/ J1 ?3 B/ H
   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9
9 m2 T1 ~6 C+ H   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23   e, `+ w, X* z& h1 O3 Y7 l1 U# _
   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20
/ Z; T  N( Z5 d6 |6 e   ; + g% G+ t4 V' f5 O7 B& a; o' p" M
' e) n% Q- F* U
   proc glm;
- ^/ p8 u" }2 \3 _$ s) p5 a      class Drug;
$ x8 K1 I6 N' o  y7 ?2 z      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution; ' m, q5 v: E- A
      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans; 4 }' G! Q0 o, ]0 e) `- g9 ^/ X
   run;
' d$ h8 U5 |6 I( ]5 v! v3 m3 q6 w6 M+ k/ x# I% G3 D
   proc genmod data=drugtest; ; y. K- A; g0 s
      class Drug; 7 O( d5 X/ y7 D
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1; " e; I+ d; ?; I9 r
   run;
7 ^0 q6 e5 ^/ h" U* B8 i; M  y6 B4 Q1 F( s
   proc print data=adjmeans;
; ~  _  q+ D$ Z4 S  O3 s+ w   run;& ]6 Z# \! z' a9 y6 S

4 |9 B7 c2 L7 I5 s
! ]! F0 [8 w7 Y/ K. A" ~1 \" Z" w( _- G0 b3 l
zan
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飘过
0 F8 D& N/ s: N+ p! u  u
学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒
( K& Q- j9 Y6 v- q4 O& p! h& q6 C
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    拒绝一切

    ) M% L! N6 x; F8 R. ], u& N3 s学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件
    1 s- D/ p0 K# T% K”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,. y9 f' H- E* n
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @
    # A5 n: O9 d' {1 {
    深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。& [  t- W+ J! Z( g  k
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。
    9 X( ]/ O7 C% N* F' r0 x) e
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