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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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签到天数: 74 天 [LV.6]常住居民II
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问题的提出2 b- F& M. O) o( r4 z1 V, D2 H5 P ]8 Y
医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。# k/ i& D% x) q3 c9 p( I
7 M6 T2 ?( K$ U5 e2 L( g/ y7 i9 J指数模型
, [# {% ]. L* Z& ?6 [- ^" k4 G; k+ k* t定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
* A( Z; O- p g! ~9 |$ pi(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t
- O. M' r9 Z% i& {; f6 o$ [i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
d% Z( [" c5 n- l+ Q
6 B& V: d0 q5 e- a5 f; ]0 {1 B将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式% t# _, `+ M$ S
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t
$ _4 l% k( ^$ W: \3 z$ oi(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt
3 ~9 T4 w" w1 R3 u( p3 Z
; u2 |% ^9 t; u3 `7 h2 V以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。" B' N( n2 u& m& q5 f2 _9 T6 U
( {/ t' P: w5 ^. N% }3 V5 P; j
import matplotlib.pyplot as plt/ ?% F5 _7 s6 ~: l3 D+ ?5 N9 X3 D* b
%matplotlib inline
/ T: i' q+ j$ h; bdeltaT = 0.01
- G1 Y/ H0 C$ z. b8 ylamb = 2
! l5 [8 {+ h9 x4 {; T+ @i_list = []
- V& H# s' C# K& [i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病6 C" r" V3 e% Z6 w
i_list.append(i0)
. X( k9 x) ?0 v. ]: a' RTot_Time = 10* n( k" ~! I+ X" A/ A
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)% N: o- B g* h- I# Q+ M- G$ N
##
7 U: u/ J1 h+ \* Nfor i in range(TotStep):9 C3 c0 `: R% T9 h# [( V7 f% d8 `. ?
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT
1 G' L' `' I8 [5 n i_list.append(i_new)
. W' w7 Y/ b T5 y, mplt.plot(i_list)
# K1 V+ E1 j1 E! d4 m- v- H! |- S- ~+ ?5 G& ?2 d7 T0 h9 f
将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?; N% o, D/ h: ^ s) s
* j8 _; s) D- P0 [2 M, i7 P6 ~
+ ~% z- O! Z4 J4 B3 C5 G实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。0 P* x+ ^1 G% m' h; G3 G, s
$ l; l9 o% E- f4 S
SI模型
' W/ F) s5 G9 a6 g9 a- x$ y0 d现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:
3 s0 m) ]% n; A0 k
# B G1 V! C! Z. d# l在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)
2 O( p" |- y( P) V2 K每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率1 V1 ^- `) b& W( h
仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算# R4 v( w r& v) ?3 d- N! [, Q& i/ q. d( ~
0 S/ c& ~8 v v% O7 v6 w7 C
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
2 u* k( X' x; z* g, ^2 QN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt$ D4 F9 m' Y7 s; m) f+ |
0 ~" s9 [" U0 I2 i消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
0 H% n: C1 _* {/ @i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t- ?. r- N- u. H' Y' f
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt3 @9 Y$ S& }" a" C5 N; q+ m! C! l
: L% l `. g. T同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:, I( w% ^8 x) v
9 Y6 R) @; m! Y& K
import matplotlib.pyplot as plt
0 k) ^4 C R, k3 l5 z: e* s%matplotlib inline$ J* t) h7 y& F: r2 Q
deltaT = 0.01( `& `; _9 \1 w) L) F
lamb = 2
) [* f$ i, U, N4 m! O: h4 ~i_list = []! }1 N3 P( n( q/ o
s_list = []
; m1 o- e2 d4 v+ ]" S4 d t% {, `i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病0 U( h" u1 U5 Z0 }5 V
i_list.append(i0): @+ E2 j* V+ F- Z" e' Z0 Y
s_list.append(1 - i0)
1 h. E" u! N+ P8 NTot_Time =5
& f) x' n1 G7 v7 d3 s2 iTotStep = int(Tot_Time/deltaT)
7 T, J% m4 i' H! j8 A* G2 t## 9 [0 O& ?3 e' p$ `2 M
for i in range(TotStep):/ t1 h; L+ r( `" S
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]7 S4 P; U5 K- I3 [
i_list.append(i_new)
, W3 _8 g; O; K3 z" Q s_list.append(1- i_new)% [+ f- M2 N0 _' f G. V
Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]+ M/ K; s( V3 F3 a3 H$ `8 x; T
plt.plot(Time,i_list)
9 @; V9 ~$ T6 M% M& Wplt.plot(Time,s_list): n* G( Z1 b4 d$ z
plt.title("SI",fontsize = 20)# x Q' e# G" s0 A. v9 S3 |9 q' m6 m
plt.xlabel("Time")% U# N r/ B: l- v0 K5 J. a% u; p
plt.ylabel('i(t)')
* @/ a2 z4 k4 S7 E F' Z7 L* r
, i9 u4 `2 @. y从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
* J5 F& x6 I0 n7 {" @1 ^- W6 ~8 `7 z" M4 m( b- c" @' S
然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。4 g% v3 z+ v7 z* Q+ c
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) F) F+ o( ]# E- B- ^版权声明:本文为CSDN博主「任公子ha」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。+ n; E! T9 P5 o' W8 l
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8 Q" \: L3 Y5 S( I" u
( S: c/ i! o2 C( Y A( K1 w7 A, G9 B* `1 S: x4 a
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