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数学建模中的传染病模型及其编程求解

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    发表于 2020-5-17 09:59 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta |邮箱已经成功绑定
    问题的提出9 ?! D* a7 W4 C
    医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。8 Z1 n( _  d8 ^3 k; a( z5 P
    * Y6 g  C3 I2 O5 _, Q9 g2 |
    指数模型+ r3 X, r: `) X$ y6 D9 e. Q5 [: u
    定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算4 [- O; _5 i' B0 o; a9 x
    i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t5 n1 l7 `0 M2 g: o% c* c* E. s
    i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
    0 V2 Q$ [) a, `- J& a# _0 l" U  D
    将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式! D# g7 Y+ u2 C' u% ~- E
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t9 J" }9 [& A. s% a1 ]
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt2 e" w3 T7 q8 i2 N1 e7 D9 b
    + o- Y' U- ~# T7 C+ B
    以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。
    4 G  C$ M! Z# d+ x6 x! V9 R& k1 @. F2 {7 X5 }
    import matplotlib.pyplot as plt
    0 k3 h' [/ P5 f9 e1 _%matplotlib inline
    # K0 \  B4 b9 T( ^9 Y, BdeltaT = 0.01: W& c- u! {( [8 V  {
    lamb = 29 R! z0 j. X5 k7 \4 U* Y
    i_list = []5 T. [% \7 k! d: ^! _; s
    i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
    , l; Z) Y# X  H7 V+ A; Ai_list.append(i0)9 x  n9 J7 p, i+ T; Y) v8 k
    Tot_Time = 10
    8 R7 C( _. T( ?" D8 b5 m0 @TotStep = int(Tot_Time/deltaT)# n7 o6 A) z) U) E; O; z/ \- M
    ##
    9 K+ e# C* c$ j2 E6 ffor i in range(TotStep):
    : w) d' `) {' q" Y3 Z  A    i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT) k) v  D2 n4 y# r. c! b6 ^
        i_list.append(i_new)8 S) b- Q) [( h8 l
    plt.plot(i_list)
    + X0 D! a$ V& k; J0 _
    & L2 k% m2 e& O8 B! C将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
    ! I# C$ O$ v# y2 V, a$ X7 ?1 J3 w' H9 y3 z! h7 ~9 Y* V  K  C

    ; R2 ]/ w0 F' a* B. b3 y4 ?实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。: M! `; T+ a+ G  N$ p7 ]$ @

    * v3 \- i4 P3 E; U! p% {0 y* CSI模型; N$ O; c& r$ I% P
    现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:
    2 r* b4 E# J; y4 `0 {( ]
    / A6 I3 `+ x: ^- L  k在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t), K: Z% b( D8 r, |9 U! s  C8 K3 Q
    每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率
    , G) [, {' T  ^" d  [仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算2 h) k2 Q/ e8 L! I! n. Q5 f
    % `0 W5 d" ~) X1 f1 e
    N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t- Z+ N9 O, }9 a6 ]) L
    N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt( p# X$ U0 n8 O, |# x! b$ L! O
    ) s) P; U+ _3 }: B
    消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式- s! `8 a% B0 i5 c4 I8 B% U
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t1 p& O( P. a# y5 V: i  q% Q
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt! X( t, e1 i( C8 a
    $ \) H0 t1 C; S) O8 v8 Y6 A* c2 e
    同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:( |: N/ p+ H, I0 G# I
    6 S) h- M% l6 W' t+ k+ e
    import matplotlib.pyplot as plt3 a, v4 ?4 U; i% t$ I  u8 ^
    %matplotlib inline9 d3 m6 |( e; k- n, `& h
    deltaT = 0.01
      I  U8 i9 n* Y/ nlamb = 2+ ?& x% O6 f7 `* Y
    i_list = []2 H5 e: w1 A- H/ B* I: Z
    s_list = []
    ) S( ^3 e' C  E" }# w8 l0 h" vi0 = 0.08; # 初始有8%的人患病9 @( V9 P5 k3 v2 s; w' U
    i_list.append(i0)
    1 I1 [# {" K: [* l) }8 F) I$ ws_list.append(1 - i0)
    0 Y0 D. ]) O. R$ w( rTot_Time =5
    % |' E# M9 M3 I6 zTotStep = int(Tot_Time/deltaT)
    + _2 u% E) Q8 n##
    0 ?/ N7 r! S0 jfor i in range(TotStep):
    ; d0 R& N* e9 A3 i    i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
    $ [/ y9 h) i$ p  f7 A" J: t0 K    i_list.append(i_new)
    ) k0 J$ J% [* A/ y    s_list.append(1- i_new), l. ^+ q! z2 z2 f/ N) z/ r
    Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]: ~* L2 w  n, n" D2 k, K
    plt.plot(Time,i_list)
    - Q9 T1 J. F0 W% g, Y3 mplt.plot(Time,s_list)1 U; Y0 b4 ]6 ?* R: v2 v
    plt.title("SI",fontsize = 20)$ W( k5 V! g) R+ _/ H, b
    plt.xlabel("Time")
    ( H. G, ^: w+ P$ z" u! vplt.ylabel('i(t)')
    + _& y2 @  @2 z! z6 [" v* T  C
    2 }8 ?  Y! D' S, C1 u7 o从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
    9 g2 @, K2 g& c) H0 j
    $ I% l% X8 ?4 V) L然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。8 ]2 r& j9 G3 X5 ]! s! a
    ————————————————
    6 ]1 c2 }" z5 V2 O& k- A; p1 n版权声明:本文为CSDN博主「任公子ha」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。/ e0 r$ o/ C7 d# w5 X& o' e
    原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/93918383  [# X, Q  O  @3 h4 w

    ) P; d- Y5 S$ c5 x: E" a9 o$ C! o, C6 @. V/ [- X
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