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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型7 z" I5 a# Z9 q: m  m
    常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。4 I1 X# a. L# g" h5 l. `/ D
    , P/ {) L  E. ], B( i) \7 \
    * F8 _4 {5 E2 O9 B4 n2 o
    6 c- Z6 r5 [4 R
    例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
    - J& R" b& R7 ]( k6 t: e# K. y" |$ V, z
    (a)假设
    1 Y/ i8 x0 N' c/ }令n = 0,1,2,...。
    ( N' g( N9 g+ \. [$ e  ^7 b
    & [9 H) C! A+ W9 f# C- V! i, S* B( M$ M* \) X
    " `  z6 @# j# `+ P- E7 `: c
    3 t3 G* j: `2 O, m. O3 B
    8 p/ d) ~5 f+ o- ~
    (b)建模# ]( w: C4 x( Y* z/ Q+ |

    6 C7 V, [8 P! Y7 p
    & z$ \' U/ f. h+ ]8 j; z: x4 |+ q" C; z8 K

    4 n3 }! @/ E- m0 e5 V8 O) c4 w
    9 ~; U, `! @7 r% F
    & _2 ]8 Z' E0 q/ B/ J编写如下 Matlab 程序:$ d$ R+ _/ k. K) P4 q9 ]+ B, I; L; E
    * m/ |4 ^' a$ L
    syms n a0 b0 c0
    ; N) g, e" n- [1 SM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');( x. F% T  f/ }$ @# F. M9 F
    [p,lamda]=eig(M);! F. U9 t1 l2 ?$ X4 O) ^' e  h4 Y( x) P
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];5 }% E8 b; c1 k9 M7 x4 O
    x=simple(x)
    4 c  p! c4 L( B% ^
    4 a( t; Q. T$ C0 D, c
    , V' E3 V: h4 v5 B0 U7 B! K* }! N1 L5 w& w8 y5 j" y6 ~

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:


    3 ]/ V8 G; m) Y. I, Jsyms n a0 b0 c03 I& m" E; m" \* M+ m* Z: w
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');2 w) I( v( V/ n" ^% q6 u- A- O
    [p,lamda]=eig(M);& {9 f, T) S' }+ z% H: C6 ?- J; G
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];  m+ U( t' K9 F9 m8 j8 I: c
    x=simple(x) 8 u0 \4 @# l# H1 `
    5 g0 G# p1 ^% Y" V
    . K9 b. ?3 E5 f; {' C( j- @" z
    4 x# r/ o. W0 V2 r6 f+ \0 ^* S
    2 常染色体隐性病模型
    7 ~) \  \; q$ N- G# r现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。2 L+ A9 g7 Y% v
    2 y3 B1 ?) |6 d. D; u
    (a)假设
    ( @5 F8 {% G9 S) N+ {/ `8 p! _% Y' _(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    1 U2 E4 y9 x& J5 Y
    & O% k. T( z  N4 u" H  \/ D* m7 @* v: {% ?9 k; R5 _, H9 }. F( |$ p
    ( k4 H) \( q) p+ K1 d- `' ]
    (b)建模
    9 t% W1 d; h8 f) `; h- I! Q  y! X' r9 y' Y2 d. ~

    1 z, v. q2 w9 Z, |# E7 n) O$ `% Z% e) Y& S5 q9 d4 b$ `. r

    ! a4 A; ^% U( u5 X/ m5 ~  i
    3 W5 T5 m, k8 L2 o
    ' e+ \% ~( c: _1 ?( @. W% O0 T(c)模型讨论' t3 A% V/ k) C( n: H- A7 C
    研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
    0 B+ q% s) k* ^( z5 ~% g. h  H% c& H0 G/ @6 {6 {: ]% \

    / z7 U; o5 d! q# o0 M' e. o- d: W* {9 q/ _# n8 s: e; @6 V0 K3 V
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。
    ! f) c, o* a, P
    6 L9 R, `  o* g7 h2 S- V* @3   X − 链遗传模型0 a! U, r$ F! l% R, c6 ?
    X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。0 }* r- P7 X2 q

    5 [3 p  e" p3 k' u) B(a)假设6 J+ r) s5 ^, n) V! U
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    ( q; [- k; ~5 c- C9 o  E+ o
    - Y) }+ u2 d4 `) V9 G(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    / L" v$ U' V: ~" r1 v- J  T3 b. }) X7 X- Y0 D: G* W7 f- r

    * D. P7 h% g* Q  l) y) N
    & m* |4 d: F  Y8 n% l
    6 T- A* O  X$ O& i5 l
    # G2 Y3 T2 q. p3 r
    9 A, I3 c9 ]( F# c
    : r& W& T' V7 L2 G/ B$ u2 ?! \" J2 r0 f( C) o& B5 l& X
    编写如下 Matlab 程序:
    - X6 O" [4 N5 g6 }' }/ S, u! G' V% h$ w9 A+ a( x, ~3 \1 v. B5 ?
    syms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
    5 G2 S6 H6 v) J6 l7 XM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;
    : L% e6 }7 {# y6 [% I; \ 0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];8 S9 G$ p1 V* F& d8 o, P
    M=sym(M);
    9 U( u# A& `/ s& v* K) Z" o[p,lamda]=eig(M);0 i$ Q! C, t  L3 K- X- u$ a; k3 r+ c1 u
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];
    2 r6 w8 J3 @# l, N$ ix=simple(x)
    ; b$ p, S! C% i7 Y# r
    * P6 j$ a3 ^6 K* f' ?& r# @# }由上述程序计算结果可以看出
    1 n* t1 b& w7 z: ?0 L* M& h! B4 r, E( S# d
    # X+ N4 C* h$ O. }/ `! J; R! a' b
    4 w1 {& m' _  u! L& D
    习 题0 [, }, k% x3 ~% ^) u' ?! M
    1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    1 q8 `% W7 Y/ z8 m
    : {- O" P5 |2 t% y# U2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    - E0 i9 A. r* Z+ v+ y$ q: [1 t' m% N3 g
    3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。 % Z! ^  o& `. a& ^3 u1 \

    1 o' @. X* a' I* z4 P1 k8 G6 _
    $ X8 a, S$ }, s7 C; g
    0 M! |7 N$ @1 C' Z- d" v' L9 X6 h# J& a1 Y) R; m, c2 H
    ————————————————
    ' l4 E4 G) W* x* x/ C版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。: I+ I# B4 y1 c
    原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596
    9 b9 B7 ~6 U7 J. a5 k( S) q5 K  G# O8 F+ F& c5 I/ \5 ^2 J
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