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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    # c" ?& G: R7 {9 X5 p常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。, T4 r" v7 N7 S8 u: s2 l$ B
    ; C) r6 E  o7 \; C9 s4 A

    # H2 l* d7 u- J( r. J% X6 p) y
    $ t. ^0 w8 M; ]  ^% Z' w# n例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
      H: U. d$ A' V* B
    5 |* @3 |% J$ r7 y8 ~  G$ P# e(a)假设/ F; Q  G* z. o8 r+ j" v
    令n = 0,1,2,...。 1 y% Y8 D7 |7 I. [

    - S/ h  H& K; g6 ?8 y/ l
    * C' S% o% q" e5 J5 [/ H
    6 n# p" l/ n8 Q* s+ t; r
    ; n9 y0 U# b) f" E+ K7 G, f9 v
    ; R' h* ^. K9 }6 C0 t% H(b)建模
    ( X/ o1 l( u7 l/ ~2 h6 o8 c( a$ v
    2 W  c7 l. E* z* L; K, w) W- s0 p! |
    ( ?5 E1 u! r3 J8 h% j' R6 j% Z
    9 E- b( r  }4 {" G
    ( q/ A/ r8 b4 c/ M4 |0 G9 v7 `

    & k9 M* A* J) y编写如下 Matlab 程序:# i& f9 m$ j/ h& j% j4 y, }& V
    " a# I. }& L4 N
    syms n a0 b0 c0" [/ D$ _8 Y0 E! I: P. N9 m9 h
    M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');5 u: O, M) U8 O5 N
    [p,lamda]=eig(M);! G3 ?7 W& ?1 o
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];- {5 f, K6 f; Q. x6 Q8 l
    x=simple(x) ' p% b& M  U/ x, r9 E

    ; K3 l0 q" H' Z- j* S4 k. B# E% v4 L
    5 @/ N" u/ W  T& r9 g

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:


    + S9 g2 u4 {/ a. K1 M" y% Y% ksyms n a0 b0 c0
    # K1 X: o  N, g0 a# S# KM=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');
    ! z' K2 V1 k' |5 ^+ V  p[p,lamda]=eig(M);
    " u2 I' \+ _4 E1 @- p" L) }$ @x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];% G6 P7 {$ a% K9 K; h0 f
    x=simple(x) + ~3 z5 o5 \# X/ C, P: a

    $ U; y0 j9 T) n4 r  d
    % Q5 [, W8 d9 p- W  `
    9 V) u7 g# s8 V1 z; B) x2 V2 常染色体隐性病模型
    : d) D7 ]; k; h9 o) E8 f% I现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。
    ' |/ J) s% |3 [# d
    0 m7 p5 v4 `7 _* h1 X3 I1 O% s(a)假设5 a8 j4 b# \8 }: O
    (i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。4 }" g, D/ `0 A1 |3 z9 B  m- V
    ' Q( }% j9 Y, [: O: }5 }- |
    : w* [# }  T% [  G
    5 g% N; O% F0 }3 Z2 G2 y9 H
    (b)建模4 V+ A! W! K8 m% h: b0 P
    4 C3 p2 ?( a" d2 g4 S9 ~0 v$ ?6 _% s

    - D: |8 g. B. K0 j( C
    $ e# w; D1 p) E5 \* P0 m& K; L/ K3 ^& l" E6 ~% M3 ~9 \6 g
    & q( O# z  Q9 k5 r8 s8 y0 t
    ; P0 o1 \1 ]( s. ^* y- H. a
    (c)模型讨论
    3 N( B. ?0 a" B研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为9 T/ d; t: d" N) @$ p; X
    ( r( \4 M6 U; Z( n, b& Q

    4 P* J$ W7 S& @( H" ?! ~- b6 C
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。+ f( m+ T$ I+ S4 I" m4 C( e1 t. r
    0 [/ ^- g8 w6 r; ?
    3   X − 链遗传模型6 P/ X( N% y: g
    X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。; f+ J/ Z8 A2 m# J; \; G5 [
    + |- G3 {1 Y: ]
    (a)假设
      `( g! f7 v9 B# M, {8 _* B9 L  f(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    : u2 k7 T! C2 M
    8 d7 y; `$ C  t$ Q(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。# Y0 X. E7 p, G
    3 U6 @1 h+ `+ C. V

    $ ]0 V; ]/ `; l& M" D/ ]# v' o7 ^) q; d" c4 {2 b

    ; }* g7 ?) _, d: x( J
    3 m: _) Q( ~) A. R% F/ y. O# g  _+ \6 x6 s2 M( T7 H, u! ~- P
    - f0 Q( |9 ~) F, S& B/ l
    ' e( V" E0 U& Z$ S
    编写如下 Matlab 程序:6 c/ O& V' C+ v* Q, b
    7 Z7 ?. b( D( ]8 G/ p, D+ J
    syms n a0 b0 c0 d0 e0 f0, N! W% r$ A, C) B/ [
    M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;! ~' a# t* S( }. ?
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];- [3 P7 d( J  m4 s
    M=sym(M);& v% Q- X7 g( e4 `& w
    [p,lamda]=eig(M);
    , [0 E  |9 w! |9 R8 b, ^x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];% w! s2 c* c% v
    x=simple(x) / }! j+ X$ l6 r* x& T2 g

    * ^  D& r3 Y$ t; h8 g8 d3 z由上述程序计算结果可以看出
    . ]) p: w" E% b& v
    0 d& A/ k8 \, s  z) X' `2 O" W4 _9 `, I8 ^0 D1 V4 v1 C
    + c7 q1 @! j9 }/ J
    习 题* n5 b5 P7 t% b2 f  g
    1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。/ G- `: w# B* k6 O* n
    # B) `5 g; ^) r& N
    2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    8 P% ]0 w% t) Y: }7 g8 j0 P" ]3 n
    6 M3 ~0 ~& A2 V+ Y0 d3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。 : s# q3 @9 W% {. H: m0 Y
    6 ?, G, V/ P: |' k$ ]
    * I8 u1 |& ?. l& g* o* m0 X- T
    : }5 x( Z8 z: l3 k+ k- X4 g
    3 u) T' O: m$ |7 y+ p) D7 \' u' j
    ————————————————; m% A" G" m" j  [7 [$ D
    版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    ! v! l. N+ }9 o原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596
    - k. U/ y( u7 D0 }4 R8 i5 X
    6 A5 p4 m) F( I; N: u9 [( |& {$ ]6 g6 f+ g; @/ M
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