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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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签到天数: 198 天 [LV.7]常住居民III
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R语言绘制二维密度图二维密度图显示了两个数值变量之间的关系,一个在x轴上表示,另一个在Y轴上表示,与散点图类似,然后计算二维空间中特定区域内的观测数,并用颜色梯度表示。二维密度图有几种类型,以下主要展示二维直方图和Hexbin图的绘图代码。
' V5 v: z A8 [+ b1 m0 _/ V" [, F& n/ Z
R语言|绘制二维直方图
9 x# ]$ ?( ?" G7 D对于2d直方图,plot区域被划分为多个正方形,调用geombin2d()函数,它提供了一个bins参数,用于控制要显示的bins数量。
/ }6 k; e/ @4 g# R( z% C) n% f3 M7 p4 N
1.先绘制基础的散点图;1 { f! V0 T: {' q
##二维直方图
2 V" `8 |& B+ N1 |) R8 @2 f# Library
) Y1 }5 P8 [, x! O( llibrary(tidyverse)
# F* |2 j. P. o7 O1 H, ~library(ggplot2)
, `) E" a4 d4 N
$ ^+ p6 T7 w. e" g |4 S: z# 读取数据2 T q8 k+ I" ?; }5 [
a <- data.frame( x=rnorm(20000, 10, 1.9), y=rnorm(20000, 10, 1.2) ), G" O% R, d# p% h& e
b <- data.frame( x=rnorm(20000, 14.5, 1.9), y=rnorm(20000, 14.5, 1.9) )
H, E8 U( W8 _: c. f% Jc <- data.frame( x=rnorm(20000, 9.5, 1.9), y=rnorm(20000, 15.5, 1.9) )/ h' B6 J: Q: J* \! V
data <- rbind(a,b,c)
2 U0 {: h0 d# N, E
c+ p% a9 w* I* ]$ u4 [#绘制基础的散点图
* O4 v, W) i+ E- Z$ w1 D! w/ iggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +
# j0 l9 q; T1 ] geom_point() a2 ^! W2 o$ e& Q! R8 F; D3 Q2 o
2 `' B$ j& a, x7 h7 [" P6 c
. `- v0 s! ^2 a
/ n2 ?8 R0 _5 x2.绘制二维直方图。9 q5 s- ~( W' a
####二维直方图可使用geom_bin2d()函数绘制- T' s8 p2 F$ L- [1 R* j/ z
#二维直方图默认选项
/ J# [: G/ ]9 g+ Y9 o$ ?# R5 D8 wggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +1 i6 L) u7 P: S- A/ d3 t
geom_bin2d() +
) O+ f9 Z- w! m4 M+ X theme_bw()& ]' s5 h9 A* l: w4 o0 T& s* \( c
1 c+ G& _4 h& i% j& j
# Bin大小控制与调色板- w: |' H9 B& o: ]2 a( G
ggplot(data, aes(x=x, y=y) ) +
}/ Y7 k( E* M geom_bin2d(bins = 70) +# O/ O$ W0 e1 l' C3 F; p; p2 w
scale_fill_continuous(type = "viridis") +- ~" n/ }/ L9 b8 d8 T
theme_bw()% {$ J+ b4 [ Y) X3 R* N
![]()
/ _+ I) w5 A, h) r3 Z- m' h7 g$ A
$ |) P! q+ P( F4 v9 a1 x5 sR语言|绘制Hexbin图 当显示大型数据集时,散点图很难解释,因为点不可避免地会被覆盖,并且可能不被单独识别出来。hexbin图中将地块划分为多个六边形,图中阴影部分代替了条形图的高度。图形是通过R的hexbin包绘制的。 # b$ \/ \6 C7 z' T2 u
# Packages1 j: {$ P; k. m2 D: U9 a9 K
library(hexbin)
- F, `3 C3 s, p j7 T! L8 s& ~library(RColorBrewer)
! `' X2 |' [ K! m$ V
' T }0 D; }' u/ Y. w# Create data
' w6 R/ R% V7 e6 f i. R- N4 J4 I9 Ex <- rnorm(mean=1.5, 5000)7 C, K/ J: W6 o2 x+ }
y <- rnorm(mean=1.6, 5000)
2 l1 i" t4 @+ M7 i4 l, s# k3 V
; G) Z1 f7 ^0 j( b/ i8 G# Make the plot# \" f2 m; d. c1 Q1 H! c1 _
bin<-hexbin(x, y, xbins=40)& p: X7 a. {& T' J. A, ]; \: Y
my_colors=colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))
( h' S7 L2 r ^& }plot(bin, main="" , colramp=my_colors , legend=F )
" X' w/ Z( H3 n T$ a - R* m& C S* v% G% @/ v; x
2 G# i% r- R3 t3 p
+ _! W* U3 b: M$ b& G |
zan
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