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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
; R9 Q c) ?9 v* D+ L( l书籍:《R语言与数据挖掘》* P2 C! r& v; y
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat9 l% V* ~3 u! Z4 j& e, x. T
library(reshape)
: C, p2 q( r, Q& v7 F8 [7 jCO2( ~$ i& X! T9 A
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
0 d# Y9 i0 g! l+ w- X: n( J' O# y9 ^1 W1 Z/ L1 n2 |7 M
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
3 J1 _6 M6 u' M3 H y6 }> anyNA(CO2); f6 m9 y5 @# T
[1] FALSE
' h) {3 b6 c+ H4 N, P6 U' P& O/ W#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
3 [& B0 f; n. E4 W1 o3 N" Z9 R* z: D' G1 a. M, O
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
% `3 Y% R3 d4 ]8 a7 ?#篇幅问题删除部分输出数据( j" K" T: T9 r4 z2 }# \" ~; @
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
% b. O9 D/ `/ y) m7 V2 N0 p9 s [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
- _/ c! m Z o( S: W; b: d v[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4" A0 C/ t$ b( {5 M8 O# t
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1+ j3 H: \3 H, C. n) ~" y
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
: N1 z/ e. k: } w! C[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
% s2 c' T# O1 n& M> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)# W3 ]: c( A2 o, B$ X5 a8 P4 \
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
/ h* T5 c& x1 z: N/ J1 @[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1+ Z+ |) r; C* W
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
: b4 u ?* D f2 L2 C2 w[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
' k6 H, f. \/ n1 L! h5 D[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
, @% l2 j# Y- s2 u( H
4 ^( N+ x8 L! L$ X W> CO2[order(CO2$uptake),], Z1 w8 V5 f* I& g# L& K
Plant Type Treat conc uptake
+ v, E) ^5 m! t) _& b8 W71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.78 O- W+ O. A1 ]8 Y1 }; T4 b2 s
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
9 S6 B/ Y7 w& I: m8 K, R64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
! c& W. o1 ], ~ [" [9 M! r43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6; ?8 ~" c" W: K$ T( z L* ?, g9 |# y6 W
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
& j4 V U5 e4 W5 `6 G57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3) F0 t4 d) e& F9 H
4 {/ n/ `5 f5 D8 Z; _> CO2[order(-CO2$uptake),]
' X. Z! F8 a5 o( K# N0 z: K- L6 n Plant Type Treat conc uptake
4 c7 K5 e/ s/ @& G7 Y/ p21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.50 x8 z9 d+ x' W$ w: c" J
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3: W+ |5 x/ i: H+ B* [' D
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.94 y! i1 V9 c+ ]3 T0 [
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
8 W+ [" w( O% ]5 a2 @4 [; T' ~35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
/ L* S p5 a2 \& ]! F. j1 [( W9 y7 l% |. Z
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
a0 }, j. \0 D5 _8 I5 g. S, ^! {- cn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
& C3 X$ s* P* q* _ {(sample1 <- CO2[n == 1,]). a, I9 Q$ M& w
(sample2 <- CO2[n == 2,])
! `7 @* M0 t2 a# O
& m* k& z) T) r. C$ h1 A& ^#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值3 S7 ^; V' t+ t9 W# ^ |
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)1 X( q5 N2 z/ c) p8 K
4 A% \" ?4 O- Q8 W$ J5 w, ?: M
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值" v/ N5 D) x: B1 G M ~2 |$ q
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
$ ~7 X8 i: J3 V( ^; t: T# | U- B3 o# ~- v# r# o2 w
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值2 W# k' f% H; D0 j2 l
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)3 b' J1 d8 N3 j: K4 u! C! E
H- b9 P4 E( F; ?#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
+ ? k; `% y; l8 y" y' ]* b1 N) LPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)2 ~4 A# a6 W) q0 ~
Plant_Qn: n1 }# T7 }' E+ O0 w9 q, u
5 m* Y7 t: e( @( y7 N#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
- _- N6 U' H3 B9 }3 |( v" o; I! a
8 T ^( t- s7 x i
) D( G+ {# d9 j3 j! W! ^) l#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度8 j5 L+ f1 }$ U: r0 A
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
8 h1 \$ s5 [8 w9 O/ c* P/ W' jgsub("[t]","t",CO2$Plant)$ Q3 `7 M4 F" M0 L& d* O1 b
' X/ L' V3 Z, d
library(fBasics)
! R/ u g6 B3 [% j8 f4 Y1 I9 X/ mstat <- function(x)
# b* A0 |6 y7 x% v, U+ U{" `- [/ P1 I J7 f& r) W& |
if(!is.numeric(x))' Z+ B! g/ v) m0 c" f6 P
{
8 e) u: U5 Y) [+ e* n, g8 w stop("the input data must be numeric!\n")
) I" X* r( r9 q. ?. u5 o& E' n }( P, l( _5 v) Q( e# o
if(length(x) == 1)# r. Q/ Z) p0 r+ E
{2 A6 Z& n2 D w7 ]' Q$ F( J1 [
stop("can not compute sd for one number!\n")
/ j! {3 F( S+ U! B$ }! R" L$ L @9 c1 Y }1 q. x$ |0 _7 S3 T
max1 <- max(x)
) K0 W0 I8 E/ X min1 <- min(x)) P6 R" ?/ u* Z# y
mean1 <- mean(x)- a/ O; ? i8 |8 J
skewness1 <- skewness(x)- ~' L0 c+ l6 ^8 ?& @: ^% Z0 N( U# J8 \
kurtosis1 <- kurtosis(x)
# O5 y) ]+ U1 R+ V- v0 j answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
+ N) G) H; s% y5 a& \ return(answer)1 l2 {6 B4 B9 u% \4 E) m6 K8 A m
}
8 H7 d* \5 ~$ w6 B6 `: T% H0 a8 R; r( B, f$ G# _, p
t <- rt(100,2), G' T0 Q* v: U
stat(t)
2 D7 P: H4 q# ~2 e
2 e. G# Y8 [$ i, H! o3 j- G$ p! e2 t
+ \! S4 ~# T2 K" A0 S% h
3 s8 `+ O% M' m2 q/ [9 r0 ~3 D, o |
zan
|