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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
9 G& x4 Y- r. ^/ A! c
- J3 I5 v+ N3 T" V3 v6 p' ]# u# Q1.函数定义:
  F8 u7 ^1 X; x+ u1 n* e: v6 E1 x( x  d, h

. e, S& R) R0 b2 T" @7 R! f) Z! h2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。6 q/ G9 p" \, N$ }! p4 L. R

$ x+ }! U8 ~' Q0 [. D  }2 {
$ M+ q  g3 {3 U  r; ^( W+ v: r( h3.数据读取与标准化:5 Q! {# {( n$ V& h: o
" r6 R: t+ \2 N% o9 r# B: d
, I4 G1 h9 U3 v
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
9 q1 N8 d1 |3 B( j8 b$ G" i5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。
  x" w* l% e- P9 W9 p5 E2 p7 s6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
3 q5 k0 {- H9 l; k4 w7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。% E: N3 b" \6 T; P( y" f: r  `2 J4 r' J

' ~$ i+ E- T; x; `0 @0 ~6 Q1 @7 F
0 t& j  U: ~. T3 A. {; [8.求解相关系数:% L- ]! e8 ~& f/ a7 b3 \% ~

$ c5 T4 r* Q3 T) o; m
- C* C5 M& L' U; f( V! U. a# c* @9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。* O  X3 f' X2 l; `6 U; o

# {% K# {: N. w% d* Q# Y9 a: {1 `
( R, m" u7 @: e10.计算特征值和特征向量:
* G: q0 J8 t! M" x" {# K4 R6 r, X  Q( d& }
) c7 [" v$ i- g# i
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
$ X1 s; V7 l% @, E  d2 l$ {
6 K( y2 ~6 V; ~+ B
  e# l7 f  u% `; l8 u# h12.提取特征值和计算贡献率:
, J, _. I* _) _
) i7 _/ i% R" M4 S7 K8 N% W, B8 h
" h' T$ F+ E  v6 Y13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
! k2 h0 q: P( T9 Z. I* g14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。: o. E  k1 D, x+ V' |5 O
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。/ R. p1 Q1 h' I
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
. _* ]2 J7 O) L/ G2 O17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。
' _" c0 y: C7 S$ O2 \1 q, P9 ~! u( t4 v3 S- s# d; u
; e5 z7 f& {% M0 d9 x* ?5 z
18.确定保留主成分的数量:
2 }: K, |; {& F7 b9 L# z) I" \
/ R+ a. K2 z1 m4 X- b2 J* u# d* b/ p6 w5 i
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
5 d; N/ u& I! Z, {20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。1 z' m; ^- y" i* q8 X' o

  s# z! S- _3 v
' s4 W2 B. e2 ?  ?21.提取主成分对应的特征向量:  S" y; j5 R. y  y1 S7 l

" _# e! l0 [, u& G6 {7 n" I$ \8 b+ C8 d& B! e
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
0 B1 A8 k( d" T" J: e6 K; [  y3 y- z, {7 F: Z; l) u( z

0 C: i7 D' j4 l+ H0 h4 X23.计算在主成分上的数据得分:
4 H5 j3 p! j# r. t; b
, X' e. J6 o+ `& C# I
- q1 C3 b, \- m- d2 G24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。/ ]( k) C) j. ?" |9 e/ ^/ d% R

% m) m8 E" _8 G! a该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。& D" ]6 Y% M6 p7 P/ G( e
( \; g- i# ~" K, R: F
: {7 @% x. P) y) _1 m( V1 m

3 X9 e( O( p- Y0 f
8 S' u' _( t8 g0 I# Q5 S
# L# M( _& h/ p1 M4 O0 o- @

PCA.m

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