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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。5 D4 E  S8 S0 Z2 H, x/ \
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。6 K8 o% x1 U, l
主成分分析的步骤如下:
7 q& V, ?: k5 b/ B3 S/ ]" P+ t+ K
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
4 c; e! B- I" A' r' q% n2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。  ^: M" A% ~/ f( \$ j1 R
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。: i$ d4 K' \0 P
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
. i0 k0 |( m8 p( C4 A5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。  h0 K- ?$ |0 ^6 B$ _# R

! H" H9 ~& l: j2 [6 x! h, i主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。+ c4 `; A/ U' U' F: q/ f

# t5 L& U) U; @8 {, V逐行解释代码的含义:( n, X0 Y! `. A
import numpy as np! Q2 d9 ~/ H6 f6 a( [* \
import pandas as pd
; V. v% T9 i* \3 H! e: Hfrom sklearn.decomposition import PCA
6 j/ r& o. ~. o) i; Y
$ I5 s+ |$ t* l; d这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
. W$ t1 F; K) g# d# `4 T! ^df = pd.DataFrame({
" q' j8 M' _; T- V    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],; k  F- v. V' r5 F* w( T
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],9 }, H6 S8 k( t- Y- p, ^6 A& E, ^
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]
, L- t+ m3 V, E7 d6 d})5 o9 c" M. Q+ |; \8 x
( r7 N0 l2 v/ f9 B1 C  g! `  Z
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。" x( y( z5 x+ r, l7 v2 d# h
model = PCA().fit(np.array(df))+ p. \! t* N9 w! C2 |% j: C9 R

% ?% v( r0 I4 B/ `' {; l( q8 t7 L" s这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。) E  {) k' U7 q
print('特征值:', model.explained_variance_)
/ T  d4 u( t6 ?' [# Oprint('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
7 d( r; O" g$ Z) X7 Bprint('各主成分的系数:', model.components_)
' p" A) j8 h5 C* F' I2 t  v
# a/ u  y6 V5 S这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:, [$ L) b) I8 w# @

0 B5 Z" O; T5 ?0 O1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
; _+ k* l; F: W' N. L2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。- B! a( e# v* M6 [
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。$ q1 B6 p1 m4 P/ I

+ S) Y- F% h9 c% ~- l; I- ^pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))
( p* P9 }$ G% f! m; Z" `pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']
4 q% M8 U) M4 d: s- P$ o) Wpca_df# H0 j5 F2 c7 p# e2 P
4 d# n( c$ H9 {! ~
这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。
# U" F4 g0 X+ D- G8 @0 a# F希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。& O8 ~9 B6 F/ T3 m- b
, T* w6 s  i; F+ S; ^9 h

, @6 e- c. i* l

29.pca.py

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