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偏最小二乘法&matlab实现

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    发表于 2011-1-31 15:01 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    请问有谁弄过偏最小二乘法吗?有程序和具体例子提供不?感激不尽。
    zan
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    1. 偏最小二乘法的Matlab源码0 A% w5 Y1 @) K! `( V0 v
    2.     所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维1 X. q5 x8 c4 V: X1 `* X. Q
    3. function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
      \" y' |& R9 i7 u7 R+ v; K3 E
    4. %% 偏最小二乘回归的通用程序# e  y) ~2 D' E2 K9 U! z- _8 w+ x
    5. %  注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此9 a7 I  N6 L3 @; e
    6. %% 输入参数列表/ E7 w! x  K\" a5 `( x
    7. % X        校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长9 f5 s0 G9 l& X; ^\" L. M
    8. % Y        校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分9 {/ j7 X\" v1 @# k
    9. % x        验证集光谱矩阵
      5 Q8 o0 N1 J* G0 n
    10. % y        验证集浓度矩阵
      . A* |\" M# Y' }$ f9 w4 \
    11. % p        X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定8 x2 ], W8 X( Q\" A; V6 x
    12. % q        Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定0 a& s& T/ ?\" h% I7 H/ r% n/ c
    13. %% 输出参数列表' X% ~* I9 l0 n
    14. % y5       x对应的预测值(y为真实值)$ J/ B& q0 r! [: j8 b# p
    15. % e1       预测绝对误差,定义为e1=y5-y  p8 m# c! ^/ P0 `0 H
    16. % e2       预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|8 ~5 `. U) I4 i( D- E5 ?+ Z$ r- _
    17. 8 {$ l' B% W. N) N
    18. %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理5 B8 G4 @) Q5 D1 h) a$ M# S' O% b
    19. [n,k]=size(X);
      9 [1 [4 n  I0 B' F
    20. m=size(Y,2);
      % w( T! `0 @& z) P7 Q
    21. Xx=[X;x];
      , K/ }: Q3 O' Q$ l3 }% d
    22. Yy=[Y;y];
      3 f9 d, V  U\" Z3 o
    23. xmin=zeros(1,k);) Q# o. s/ |! \5 ]0 t- R' G$ I
    24. xmax=zeros(1,k);
      4 ]# @3 j\" O: A) `1 C: ^
    25. for j=1:k
      & B\" g2 `# U3 j# d, i9 E$ U5 I
    26.     xmin(j)=min(Xx(:,j));
      7 P8 P9 N$ ?3 t3 u; o) }5 ?0 {5 a3 V
    27.     xmax(j)=max(Xx(:,j));
      & k- @) d5 m+ x7 p  a% a) g
    28.     Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
      - O  R& E/ @; _( z4 V# u
    29. end9 H- u+ k, d! z$ P
    30. ymin=zeros(1,m);4 f$ h6 {. b% X
    31. ymax=zeros(1,m);/ I4 Z& `; G( ?) f. b+ W% E
    32. for j=1:m0 {/ L! {! C5 J0 V0 q& U- b
    33.     ymin(j)=min(Yy(:,j));% Y: _; Z+ Q1 B' S
    34.     ymax(j)=max(Yy(:,j));  N$ s4 v/ Z9 x
    35.     Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
      7 t# M8 b, `/ P
    36. end5 @- w0 o. b$ z) x
    37. X1=Xx(1:n,:);. J\" d% _& y# d  z, X3 A
    38. x1=Xx((n+1):end,:);
      ; ]; P- X; S1 D4 A$ |
    39. Y1=Yy(1:n,:);: V$ t1 Y) A' @% O* X' Q
    40. y1=Yy((n+1):end,:);7 b- v0 J7 S1 Z$ w! e, |  n* }
    41. 6 C) o/ a; Q+ _1 [6 t9 z& u, w
    42. %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间
      ' C6 K  R, x! z9 h
    43. [CX,SX,LX]=princomp(X1);2 R( U6 V; R8 l\" A  T, R4 C
    44. [CY,SY,LY]=princomp(Y1);7 r* C2 M' {. E7 R
    45. CX=CX(:,1:p);
      ' T1 E) T5 ^3 {7 a! h
    46. CY=CY(:,1:q);
        j3 s7 m2 L. X; D! @% O. k- m
    47. X2=X1*CX;& B' D\" j8 k$ V( P9 x( B% G2 q* J
    48. Y2=Y1*CY;, j: L0 @- D  N& U6 z\" K; w
    49. x2=x1*CX;
      # |  j# F' g8 @; F
    50. y2=y1*CY;2 l: t4 B/ Z/ r: c( z
    51. 2 Y$ D: p\" X% v8 E( K4 V
    52. %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归4 t! |! v+ H) r; ]# E
    53. B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整6 `6 R2 o) z( d8 [0 {- k3 E
    54. \" L2 `3 I8 a. F# x2 t/ F4 c# N
    55. %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
      4 D! b+ T% q9 N* Z0 Y
    56. y3=x2*B;
      % ~& h8 U' g  Z  U/ a6 l2 o
    57. 2 P7 p3 F2 R* P' E
    58. %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4
      + w7 e. a, e& s% R9 u8 K7 c
    59. y4=y3*pinv(CY);
      5 E/ ]7 G7 M  N6 S8 y2 R$ A
    60. 0 }* O, d+ ^) L6 _
    61. %% 第六步:将y4反归一化得到y5
      ) }! q) g  S( o# \9 q
    62. for j=1:m
      % w$ {- y8 |! ]; K' u
    63.     y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);
      & \/ a3 n4 a7 x7 D5 b) m( ^
    64. end
      $ {6 ^- B# `/ U! R) v; o: O, l
    65. * s7 m; p. [4 `# H: }0 _& q& n4 o! u
    66. %% 第七步:计算误差
      & N3 a/ \1 G8 B8 r4 n0 J
    67. e1=y5-y;
      ' E, [7 ]9 V/ @  E2 r8 G& T1 L
    68. e2=abs((y5-y)./y);6 A- G& q6 c5 ^, I+ g5 G

    69. 5 y; U) c( n9 ^( Y# _
    70. function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)
      ! [0 j  ^7 j; g* O$ P6 k; u
    71. %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
      / S3 n( |! C( o# ?( p( p) x
    72. %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本1 ^' l1 u* D3 y/ R
    73. %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
      6 d% e2 t4 i9 Y
    74. %%( g: j9 Q1 V$ O' M
    75. [n,k]=size(X);
      / n$ }8 }9 l+ [6 |3 I
    76. m=size(Y,2);
      2 P, B( P$ k3 p7 ^1 Z4 F
    77. pmax=n-1;
      ! J* i6 f  Z2 i% l( _: n
    78. q=m;
      0 g' r/ K+ A3 I2 q4 w/ G  T
    79. ERROR=zeros(1,pmax);! K4 {3 t) U8 d( E- G
    80. PRESS=zeros(1,pmax);* J9 w3 z, q9 x
    81. SECV=zeros(1,pmax);' `! C0 [8 f* @6 V
    82. SEC=zeros(1,pmax);
      3 m( Z. j' d. _
    83. XX=X;$ ^+ e) |; V3 I. {
    84. YY=Y;4 A& Y+ S4 f, k6 `' j: W
    85. N=size(XX,1);
      # s6 h0 d* J! m( J5 F
    86. for p=1:pmax
      3 _% [- d+ k  j: o2 K$ V4 H/ u
    87.     disp(p);\" m; A4 w. Y. m) {8 f7 h) K
    88.     Err1=zeros(1,N);%绝对误差+ c) Z% C4 Q/ _6 r/ P6 f  ]: N
    89.     Err2=zeros(1,N);%相对误差
      4 R% b' H( o' o  w! z\" ~
    90.     for i=1:N
      * g2 G, ?* U: E; \6 X
    91.         disp(i);2 f! c3 N) Y; G  k2 M0 }
    92.         if i==1  L: q1 s9 W2 y  h* z- P
    93.             x=XX(1,:);
      ) s7 n6 e* p% n# k7 o\" U0 _3 h
    94.             y=YY(1,:);0 V  h+ o, e8 Z9 x2 L1 c4 m
    95.             X=XX(2:N,:);+ t- r9 n& d1 P* g9 w6 x
    96.             Y=YY(2:N,:);7 }7 b0 f9 G' q
    97.         elseif i==N( K3 p6 g- p. w% @+ _- C# y, v
    98.             x=XX(N,:);) e8 s( t5 A  G. K, O. y
    99.             y=YY(N,:);) `1 m) f  |8 j* P
    100.             X=XX(1:(N-1),:);
      - e8 n/ ~! j5 W
    101.             Y=YY(1:(N-1),:);# F; q2 w1 \  j' c+ l3 b' w
    102.         else
      ( f# o- _% f7 \
    103.             x=XX(i,:);
      : k: l8 {. ^2 I
    104.             y=YY(i,:);7 ^. |9 t! f! D
    105.             X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];3 Q% b; J& |0 p% a5 R9 g  j
    106.             Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];7 }8 Z8 F+ M8 C* n* J' E
    107.         end
      \" U  h0 }2 u8 a5 l
    108.         [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);; b0 _; c\" Y\" r2 Q
    109.         Err1(i)=e1;  ^4 r. n  }' e# r. N/ p$ i* `
    110.         Err2(i)=e2;  {- u; n$ }1 I$ C, a
    111.     end1 L# `9 z* F2 s% O
    112.     ERROR(p)=sum(Err2)/N;7 @  q: ~\" b2 a' W7 n0 f! E
    113.     PRESS(p)=sum(Err1.^2);
      ' F; G) z' v5 Z
    114.     SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
      1 l+ s0 b\" l/ k9 c& u6 S
    115.     SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
      7 N  l8 v6 ]. K- @6 z6 I/ ~( R
    116. end. g. P$ C7 ^- f9 O+ B
    117. %%% l. W% T5 M4 p1 t) H3 t! ]+ ^
    118. [CX,SX,LX]=princomp(X);/ c: U; u3 w2 o( @
    119. S=SX(:,1:p);
      7 T% Z( F% v+ I- y7 W
    120. MD=zeros(1,n);5 |* i6 n8 s3 _: T, }7 A
    121. for j=1:n' T: S: v  y8 t% d( N) H% w
    122.     s=S(j,:);\" A/ E8 N' c- n4 k5 V5 x# h4 D
    123.     MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
      \" M7 n+ l0 d5 Z; B# @  ]9 g5 H
    124. end6 x: _7 d6 Z, i  k* G! \4 u
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    0 N; ]: w  L  D, z" \
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    9 e, c8 ^1 k" F+ T
    & |" p: }  T; Y3 a2 |0 h谢谢你啊。你真是太即使了。但是你能不能把你的代码发到我的邮箱呢?我复制了结果都是乱码。241733089@qq.com
    ; @- N" y+ @: _6 T3 L我想用这个程序做关于客户忠诚度的预测,不知道你有接触过吗?
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    回复 maizhonghai 的帖子4 t/ {: N2 \3 w
      r$ d( l. m/ b4 z8 d( i
    未命名.jpg 1 N9 W3 O+ l5 i5 {4 k

    & P* Q, N: d  t2 O6 n$ t1 \请点击复制代码,然后粘贴到写字板,不要粘贴到记事本) X- O$ W  o  |8 `
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    ( \/ e4 }# ]" j+ E& [
    6 {, {' T% ~& z9 x7 a喔,好的谢谢。我看下里面是多少个M文件先。有疑问再问你。非常谢谢
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    回复 厚积薄发 的帖子* q, |( n& X, y' |, b+ {
    , f, p& E0 c8 Y+ t
    你好,你里面好像没个function都紧接着几步。是不是都是归类为一个m文件?
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    8 G3 U8 B0 N  L2 e
    6 N6 C7 C$ R0 u2 u" J* }; X* k/ H你好,我不知道你原题的X x Y y是个什么矩阵。不是很懂用这个程序。好人。你帮忙下嘛
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