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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
    发表于 2021-11-24 16:50 |显示全部楼层
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录$ N+ l  M  J1 A# Y- b" \
    书籍:《R语言与数据挖掘》/ p& u( C  X: K9 z) B6 M
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat6 ?2 X1 h$ N7 m  ~  d2 x0 Y/ n
    library(reshape)
    * W( ?3 f0 a% I* E) v0 H7 S# S: k8 q- bCO2; z+ b1 M/ u+ L- U- Q
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))" j1 B5 H! G$ S# Z
    + Y' N/ N, X  V$ E$ j
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行5 T  ?1 C  z* \# t5 H$ a$ Q
    > anyNA(CO2)
    0 Q. W+ y$ ~, O: C# V. K* O! H- F9 c[1] FALSE% ]7 t. x2 U: {3 J  U) F
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]5 q! P1 B$ B" g. t; X7 ]1 K

    ' U5 P) c/ q" |. V) s' l* F+ o#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)+ N: s. o# I" ?! X
    #篇幅问题删除部分输出数据3 v$ S4 l% D' j6 v8 R  h
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    # _( ^& O: _6 U' }1 n [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    9 f, {& Z7 G  ]" y& F/ m( a[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4% Y* C6 V! D' h
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    , O& s8 W3 w) q3 n[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    / S; ^) I7 S: v3 X6 r! _[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    1 D, @, }7 E' `2 Q> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)+ H1 X- W$ j% O; B. Q0 \$ G# B- F
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6& r" R  S$ ?  i) g. k& o$ G
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.19 m6 Q3 k$ l9 C1 @( c+ a5 H0 B+ \
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    0 E9 Z8 [- G( f7 f% A/ h2 ^3 y[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.93 s- Y% k/ u' Z/ V' y+ w
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.36 p% w- g# |4 R( z1 c7 O- Y; ^" x* E

    2 v9 g/ j; _$ K> CO2[order(CO2$uptake),]" ^& b4 B* k4 \; A5 n. T7 C
       Plant        Type      Treat conc uptake% _% p! Z& D2 T/ F. v/ z$ D! A
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7- L+ L0 L  c$ r6 \) S% I
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
      W: d% [% }6 ]64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    % c/ K- Z9 Q! A& I, q4 f5 ]43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6) ~5 j6 H0 V. R1 G' f
    78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    ; _4 ^1 Y- d3 L- F5 s% A57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    7 U$ }, D& [5 [* F) I' Z* ^' F. W  X8 e( w
    > CO2[order(-CO2$uptake),]# D, k% A9 U- c  }
       Plant        Type      Treat conc uptake1 \  X3 h5 o7 d+ W
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    , J. A# N5 D1 e9 N8 m14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    $ @( ^1 h/ f( m6 o6 J  c0 R7 K4 t7 b20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    5 D% w% u7 E1 ~9 S9 y' x& Z* C19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    / r( S: X( c2 E7 C( j2 U35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    & n! g% x3 e1 }  y6 m( c4 }& _; O' H% p
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4. _9 C* n+ G0 c* Z8 G
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    2 S+ s: Q* P8 j(sample1 <- CO2[n == 1,])
    ; w2 ^1 E- f$ N, ^(sample2 <- CO2[n == 2,])( V* T6 h, i' z0 }& D1 @) B

    ' a2 \- W0 ?4 k; M6 `1 P# l#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值2 |, k6 Y- ~  Y/ A4 X! r: Z2 L6 }8 m) @
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)) k7 N+ ]' V) [6 Z1 |
    ( |, T5 b6 n' n7 y) W- [5 `* a
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    5 _% I& Y* _* ?1 z9 m4 ?, Q. waggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)8 z8 S, Z# J7 H3 @
    $ y% r7 k6 v9 a- b3 q/ @
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值6 y1 t% ^2 g. w5 V+ _9 e+ u
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean). l" c6 b" O% Q# ?$ R

    ' `$ m3 w7 G7 P0 z4 [) _: h#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    1 E# t& N1 @9 ~8 x9 @1 [! @  ^: KPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    & C: [( o& n5 F! y/ NPlant_Qn6 `, {( r8 y9 C) e
    2 P, P* \% l* I* ?3 q2 {1 I
    #(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“4 Z- q3 b+ N4 K+ ]$ s( l, e
    ( r% s3 A/ E2 I

    0 z/ Y- w" i7 T' \#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
    3 c- N$ @( O6 x#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……1 \  `/ c" N" J( n1 _7 E3 K
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    * E! S( {) p$ A; m
    $ _, t- G6 o' _5 p! xlibrary(fBasics), P; z) m$ K( d* X
    stat <- function(x)
    + l  Y: u# ?# t{) T# m6 X! M% u) x- A! H$ {: Z
      if(!is.numeric(x))3 v3 b& n" r7 b$ h% E( D. v8 |9 x
      {" m# \" s: l) o4 ^
        stop("the input data must be numeric!\n")# A3 Y/ b2 a2 {( g. |' w
      }
    5 c" {7 Z% J' Y$ O  l  q: C# ~  if(length(x) == 1)
    , J* Y& a/ m: D3 b+ l  {9 q4 V: y1 x6 g2 d! E
        stop("can not compute sd for one number!\n")# S. k$ g* `8 i! z4 W( f% u3 U) P
      }8 ^8 d! c2 Z6 S. u
      max1 <- max(x)3 }' Z7 @3 A( f. Q. C& D5 k
      min1 <- min(x)
    ! C+ O. s# u- l& C$ q+ K1 N  mean1 <- mean(x)5 {, v1 g: h' c# o$ n% C
      skewness1 <- skewness(x)/ T/ h- l" Q& V' l: e1 F
      kurtosis1 <- kurtosis(x)9 z! A. O" X" l1 F
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)9 f" M( O, |7 B. T+ p' K
      return(answer)
    % N) d9 U. B* M6 T0 J7 `; _}
    8 k& k! d& G- U  S8 s! \! A
    / d2 y( G8 G, V# ?0 Y; {- pt <- rt(100,2)9 z& ~  r; E: c
    stat(t)6 C" \3 N9 E, Q( ?

    8 C: p5 a! F% g2 }
    3 ^/ d0 |6 ?$ h& y1 m- R+ C1 a" x* `

    7 F. ^& d4 f& Y+ K8 R/ h* Q0 ^
    zan
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