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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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发表于 2021-11-24 16:50
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录$ N+ l M J1 A# Y- b" \
书籍:《R语言与数据挖掘》/ p& u( C X: K9 z) B6 M
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat6 ?2 X1 h$ N7 m ~ d2 x0 Y/ n
library(reshape)
* W( ?3 f0 a% I* E) v0 H7 S# S: k8 q- bCO2; z+ b1 M/ u+ L- U- Q
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))" j1 B5 H! G$ S# Z
+ Y' N/ N, X V$ E$ j
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行5 T ?1 C z* \# t5 H$ a$ Q
> anyNA(CO2)
0 Q. W+ y$ ~, O: C# V. K* O! H- F9 c[1] FALSE% ]7 t. x2 U: {3 J U) F
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]5 q! P1 B$ B" g. t; X7 ]1 K
' U5 P) c/ q" |. V) s' l* F+ o#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)+ N: s. o# I" ?! X
#篇幅问题删除部分输出数据3 v$ S4 l% D' j6 v8 R h
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
# _( ^& O: _6 U' }1 n [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
9 f, {& Z7 G ]" y& F/ m( a[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4% Y* C6 V! D' h
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
, O& s8 W3 w) q3 n[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
/ S; ^) I7 S: v3 X6 r! _[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
1 D, @, }7 E' `2 Q> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)+ H1 X- W$ j% O; B. Q0 \$ G# B- F
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6& r" R S$ ? i) g. k& o$ G
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.19 m6 Q3 k$ l9 C1 @( c+ a5 H0 B+ \
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
0 E9 Z8 [- G( f7 f% A/ h2 ^3 y[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.93 s- Y% k/ u' Z/ V' y+ w
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.36 p% w- g# |4 R( z1 c7 O- Y; ^" x* E
2 v9 g/ j; _$ K> CO2[order(CO2$uptake),]" ^& b4 B* k4 \; A5 n. T7 C
Plant Type Treat conc uptake% _% p! Z& D2 T/ F. v/ z$ D! A
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7- L+ L0 L c$ r6 \) S% I
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
W: d% [% }6 ]64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
% c/ K- Z9 Q! A& I, q4 f5 ]43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6) ~5 j6 H0 V. R1 G' f
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
; _4 ^1 Y- d3 L- F5 s% A57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3
7 U$ }, D& [5 [* F) I' Z* ^' F. W X8 e( w
> CO2[order(-CO2$uptake),]# D, k% A9 U- c }
Plant Type Treat conc uptake1 \ X3 h5 o7 d+ W
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
, J. A# N5 D1 e9 N8 m14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
$ @( ^1 h/ f( m6 o6 J c0 R7 K4 t7 b20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
5 D% w% u7 E1 ~9 S9 y' x& Z* C19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
/ r( S: X( c2 E7 C( j2 U35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
& n! g% x3 e1 } y6 m( c4 }& _; O' H% p
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4. _9 C* n+ G0 c* Z8 G
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
2 S+ s: Q* P8 j(sample1 <- CO2[n == 1,])
; w2 ^1 E- f$ N, ^(sample2 <- CO2[n == 2,])( V* T6 h, i' z0 }& D1 @) B
' a2 \- W0 ?4 k; M6 `1 P# l#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值2 |, k6 Y- ~ Y/ A4 X! r: Z2 L6 }8 m) @
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)) k7 N+ ]' V) [6 Z1 |
( |, T5 b6 n' n7 y) W- [5 `* a
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
5 _% I& Y* _* ?1 z9 m4 ?, Q. waggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)8 z8 S, Z# J7 H3 @
$ y% r7 k6 v9 a- b3 q/ @
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值6 y1 t% ^2 g. w5 V+ _9 e+ u
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean). l" c6 b" O% Q# ?$ R
' `$ m3 w7 G7 P0 z4 [) _: h#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
1 E# t& N1 @9 ~8 x9 @1 [! @ ^: KPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
& C: [( o& n5 F! y/ NPlant_Qn6 `, {( r8 y9 C) e
2 P, P* \% l* I* ?3 q2 {1 I
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“4 Z- q3 b+ N4 K+ ]$ s( l, e
( r% s3 A/ E2 I
0 z/ Y- w" i7 T' \#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
3 c- N$ @( O6 x#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……1 \ `/ c" N" J( n1 _7 E3 K
gsub("[t]","t",CO2$Plant)
* E! S( {) p$ A; m
$ _, t- G6 o' _5 p! xlibrary(fBasics), P; z) m$ K( d* X
stat <- function(x)
+ l Y: u# ?# t{) T# m6 X! M% u) x- A! H$ {: Z
if(!is.numeric(x))3 v3 b& n" r7 b$ h% E( D. v8 |9 x
{" m# \" s: l) o4 ^
stop("the input data must be numeric!\n")# A3 Y/ b2 a2 {( g. |' w
}
5 c" {7 Z% J' Y$ O l q: C# ~ if(length(x) == 1)
, J* Y& a/ m: D3 b+ l {9 q4 V: y1 x6 g2 d! E
stop("can not compute sd for one number!\n")# S. k$ g* `8 i! z4 W( f% u3 U) P
}8 ^8 d! c2 Z6 S. u
max1 <- max(x)3 }' Z7 @3 A( f. Q. C& D5 k
min1 <- min(x)
! C+ O. s# u- l& C$ q+ K1 N mean1 <- mean(x)5 {, v1 g: h' c# o$ n% C
skewness1 <- skewness(x)/ T/ h- l" Q& V' l: e1 F
kurtosis1 <- kurtosis(x)9 z! A. O" X" l1 F
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)9 f" M( O, |7 B. T+ p' K
return(answer)
% N) d9 U. B* M6 T0 J7 `; _}
8 k& k! d& G- U S8 s! \! A
/ d2 y( G8 G, V# ?0 Y; {- pt <- rt(100,2)9 z& ~ r; E: c
stat(t)6 C" \3 N9 E, Q( ?
8 C: p5 a! F% g2 }
3 ^/ d0 |6 ?$ h& y1 m- R+ C1 a" x* `
7 F. ^& d4 f& Y+ K8 R/ h* Q0 ^ |
zan
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