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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?: m0 ?0 Z4 l! C) V

    ( J" x3 S. c" J) K3 v1 U! M按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。% A4 M$ v3 Q" b/ d: R8 ~6 @0 m

    : p6 C- h0 N/ \: {% x8 t对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。
    ' |" P1 o( Z* H- `% G" m: W( d% p# z; n4 y" ]$ I
    大家有什么看法,愿畅所欲言。
    ; y/ J) \* u/ W
    zan
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑 ( }# h. q! L* T1 M# p
    1 M( h2 k# R/ X7 l
    我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?
    $ V2 B( C# S/ l7 I/ e' d
    & ~9 H# I) p( S# T2 ~脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    3 h- @5 Z6 {2 S3 j, o; ]6 [
    - N4 l# r+ f+ t$ G9 ~我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。
      ]4 `# Y4 V1 a7 Y% ]6 Q* A5 g" S
    5 U. d' H8 _( x  D4 I4 P: O以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。5 X3 B/ [( \* Q2 S, S( Z

    # y1 R- n: E* r" }# M- [这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      5 _6 \1 f4 L: X2 w! B6 n+ F4 m
    2. clc) h3 v$ Z3 t6 i) B$ w
    3. tic/ y7 C6 z' F( ^0 T1 \; J
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵  i0 T- P: t$ w* v% \
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:9 L6 z2 ]1 y/ m$ o9 x
    6. for m = 1:1000 006 e, Q% R- x3 q1 T8 u8 D$ @
    7.     a = rand(5,7);
      ! |, d* w0 G! ?6 V* D\" [+ @7 X+ _
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化4 n2 R* n2 {1 d, D+ Z
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);
      ) Y: H! H. h1 n5 }2 o
    10. end
      , [& o' n0 C' c1 q
    11. k% P7 I) z! I3 \, K7 C
    12. toc
    复制代码

    $ u8 p$ f' I' N9 U* \$ L" e6 DForcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?- `% k1 f+ w9 W
    1. !using["math","sys"];: Z& E% l0 |. r3 g. B  s; B
    2. mvar:
    3. / t1 P3 t. y8 Y
    4. t0=clock(),4 `) y9 m- O. }+ p) X# z
    5. oo{k=zeros[5,5]},
    6. , r\\" _' `7 `9 `* P2 |1 e5 C( G( s
    7. i=0,((i++)<100000).while{
    8. . m4 F( L6 u! B1 N7 L+ p
    9.   oo{2 w! `& h$ L- {3 y* \
    10.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    11. \\" s3 F. Y9 z/ N8 Z$ E5 S+ ~
    12.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]
    13. 5 B3 K0 E: {- t5 ^8 P
    14.   }. O- E* [- i2 ]0 L9 N* t$ X
    15. },
    16. - o% o$ J. \8 D# f. g+ R
    17. k.outm(),
    18. & P# P: |3 ]5 V6 |; W/ a! O2 I
    19. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。
    " y, C9 I0 H! I4 n4 K, |- g
      @, J, S  B- n6 }4 }Forcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?* ~% ~2 W; N( b8 d1 b- i' u
    1. !using["math","sys"];1 F5 D) h# y# }8 s: v1 E+ F* Z
    2. (:t0,k,i,a,b)=& @- W& I# }1 T
    3. {' i5 M) W% I9 C' C
    4.   t0=clock(),
    5. ) U' \6 D) m* a7 K
    6.   oo{k=zeros[5,5]},
    7. $ ~5 U! D& [8 o! d' R
    8.   i=0,((i++)<100000).while{
    9. , p8 {9 Y: _3 \, Q/ L
    10.     oo{
    11. 2 ~: ~/ R# D9 [1 X6 ]
    12.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    13. 1 I- n1 X* d* _0 d; ]
    14.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)
    15. $ C0 a  t* n% i: e
    16.     }7 s, c. I$ V. J6 F( X) y8 `
    17.   },
    18. 4 R8 M' M* }) P- }, ^2 Z* }. s
    19.   k.outm(),9 L2 k5 y. V& j7 d
    20.   [clock()-t0]/1000
    21. + `) h/ x  e$ g2 l' T% Q: J
    22. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。; k" F* p0 R4 ^9 C( P6 d  N
    % g! }. L/ K. K9 G# h
    例子2:
    0 ?2 y$ ]! t8 F) D) K- |* D  N一段程序的Forcal实现:
    + i, R# o* k" I3 {& k. Z% x( E
    1. //用C++代码描述为:7 e9 H  O- W# _& L8 t  N
    2. s=0.0;  \" D, H; {# u5 v' c, {4 F+ f
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  , E4 U3 ~1 O2 \, m+ _! ]' c* f0 z
    4. {' t3 V9 t8 _' a5 t3 H
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)' m# z6 S5 ^. R1 o
    6.   {
      & `3 g$ L3 K  X\" m
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));! E( T0 s( \4 r0 d) n
    8.   }4 W, m1 l  z0 ^* Q
    9. }  
    复制代码
    结果:
    & F$ B% X9 h# Z: A* V2 s: ~1008606.649474413 C: Y, F+ i, `! V0 `. i+ h4 q
    0.609 //时间) I  a/ Z5 p( J' H/ e5 R! e$ X
    , S, L0 |6 g0 s/ s, u6 }& r
    这个matlab程序段是网友yycs001给出的。" U" h4 ]% z& ?0 w8 J
    1. %file speedtest.m; g7 q, D. b) f# b\" Z
    2. function speedtest
      & F+ G3 f! n) {2 A2 K1 o2 o
    3. format long
      7 \- _/ k4 z/ l+ o# m! J( y
    4. tic. V. j  {. Q- C. k4 a+ _
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);; d, b7 L& F! h1 `) i0 O
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))8 U4 D3 X& P0 w\" g4 H: @' s
    7. toc
    复制代码
    6 S* I( N; C3 t6 n4 X+ l" S
    Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码3 r! M2 @5 {3 s$ u) z8 e7 g1 l! @1 g* F
    1. !using["math","sys"];
    2. 5 t9 P* h! {( p, g- d
    3. mvar:3 b2 b* U5 W, Z; l$ B
    4. t=clock(),
    5. \\" }9 C* p) S4 r2 k7 C
    6. oo{
    7. 0 E7 b3 a  x' a
    8.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],! t1 x; Q* b  x, s8 z  x
    9.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]
    10. + S3 a+ V  e4 m; w: s/ w  k
    11. };: M$ Z  Z' g, b/ L% l
    12. [clock()-t]/1000;
    结果:& j0 B% C* @6 i8 V+ p
    1008606.64947441; W6 {/ L7 R' g6 N% [6 |
    0.625 //时间! l3 ~; v0 l1 p! l/ V$ M: s2 `

    ) D9 H9 J) [" m- ~1 w; d或者这个,与上面效率差别不大:
    4 S+ @$ X- Z& y9 {% y0 m" _
    1. !using["math","sys"];! G% E# Q) P# Q( _3 ~
    2. mvar:
    3. 7 z/ r/ F# n+ _
    4. t=clock(),
    5. . l8 F4 ?4 U& R% |
    6. oo{
    7. 3 E% y* P# U. Y7 u
    8.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],  l- Y. v4 s. l3 O/ b
    9.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]
    10. 8 N* X; M5 N* j- o% O: U) q
    11. };
    12. * w; e. t3 B' s. \% }, a1 ^  {* e
    13. [clock()-t]/1000;
    & s0 K, P' _1 s; _8 R
    Forcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码& U6 C' F, v4 q6 b8 d: u- S2 F
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))); ( k9 f; `* n5 ]% l
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:
    * h; X$ `" u1 A$ D1008606.649474413 V) S* x5 Z- s
    0.719 //时间6 M! T1 W' C) G1 D* |

    ) c" J2 E5 t7 S0 H1 I. U, zForcal代码3:while循环
    # b  }8 e, [" v) t% q
    1. mvar:  L6 c/ z: m& |7 O
    2. t=sys::clock();! k4 r. B1 G+ ]( [: W; \% j3 a
    3. s=0,x=0,
      ) S) a0 Z2 E0 p! v0 u- X9 |
    4. while{x<=1,  //while循环算法;
      / w6 c0 _' t! V( o\" W4 T7 p. c
    5.    y=1, . n# D+ Q6 F: @2 U5 `* u# n
    6.    while{y<=2, ) i5 z, {5 o2 q
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))), 3 A; K4 y# E, q0 P\" D7 M6 S
    8.        y=y+0.0009 & T/ `: A6 a5 a9 I4 \
    9.       }, * O/ t# q& d\" s\" t3 ~/ A2 @
    10.    x=x+0.0011
      9 S7 [9 I1 _+ R+ F( @3 M
    11. }, 8 C6 L$ v7 T\" C. r  y/ N
    12. s;; }' M  F9 o# w
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:
    ! n8 S& \8 w& y1008606.64947441
    ! U1 J& o$ ~2 m" T2 T  L4 T4 X6 e0.734 //时间2 a( g2 ^+ e7 L8 w8 N

    5 w+ }/ {5 w8 r, y" D, z# ~+ G大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar
    8 T9 T' {% C( N. n+ Z
    7 D& L+ d' W/ d2 }注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。1 `( K# `4 M( C' B
    " v6 z. N) o3 t, b; h3 P
    例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。9 \7 o1 S( n/ K; a

    ' x  G& X6 v, P: o  R9 N- P+ E例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。
      |4 h% e" S) h# o" A
    ! }, g8 w& J% l! T& ]( ~% R如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。/ `( n8 a. F5 N: F3 b0 h
    ) w: t% o+ \: L( H9 @
    如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。' P2 u  j7 o# h6 \4 b
    " g( s. Z$ q8 I+ ^: t
    顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。

    7 g% T  G9 Z! N0 E; |& @# t7 I
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html# i% B: Q6 _/ d4 X$ ]7 @

    $ w# @. ^2 {# D! @2 i7 g. D9 ^我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2727-1-1.html
    , C( ]3 W" `2 E- i( Y/ i& }' Q. P
    # [: W% `# [: C, D4 R7 P' R" W关于最快速的矩阵乘实现的讨论。
    3 t  z( T8 A. l& {; m% w
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