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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码8 L3 f. e4 |4 r8 r( n
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维1 ]9 f5 e3 h B$ E$ d
- function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
$ a S5 u; z# b; s- k - %% 偏最小二乘回归的通用程序
- G1 D( o! r& h* b: \ - % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此
8 _9 N7 g# h5 @7 Q+ }! s; o6 Z. F - %% 输入参数列表& D4 O$ Q$ {( ?9 i: l# {
- % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长
3 |1 }; ~5 G4 q* l$ I4 h* ~ - % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分! u3 m2 y, P6 ]
- % x 验证集光谱矩阵3 J3 d: C, p/ A
- % y 验证集浓度矩阵$ D) H3 K' N: Z5 z3 z( [
- % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定6 X+ Q* l; }4 |( ?% b$ R
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定# n9 q$ V* {$ T4 G, x
- %% 输出参数列表
9 F1 Y3 Q) A5 g5 ~ [ I\" Z - % y5 x对应的预测值(y为真实值)
3 |4 S1 U m, ]/ D3 v - % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y
; I0 \ M5 s1 j1 t0 C - % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|: @1 j+ ^: } F( Z5 j6 x8 @+ P
- ) h5 p9 O) @, Q, a
- %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理, q$ J# Y( f5 S9 v\" x9 J/ J% o
- [n,k]=size(X);+ A+ l7 Z- ]* U* ^' R4 W( ~
- m=size(Y,2);; F$ T: [; r0 X3 r$ J
- Xx=[X;x];1 _4 q# Z7 d0 u! X; C\" Y1 x
- Yy=[Y;y];
, q3 U+ R0 U/ d; k1 g5 m# J$ h - xmin=zeros(1,k);/ c+ V B5 w# X) s/ T- M% h7 g
- xmax=zeros(1,k);
# O) H) |, G. j* ~ - for j=1:k5 b u7 [\" I/ j0 H# H/ Y
- xmin(j)=min(Xx(:,j));( h- J/ |6 w- V+ N9 S8 c; Q
- xmax(j)=max(Xx(:,j));! a' }# i3 K$ |) u1 D8 z
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));6 d2 R0 o) F1 x8 Q
- end
\" ^; T: T- `$ F - ymin=zeros(1,m);3 M! h+ {8 ^+ A3 m+ i% ]% F
- ymax=zeros(1,m);
0 M) n4 g Z4 _ - for j=1:m0 H4 r* i6 G5 Q. b* L6 ^* e
- ymin(j)=min(Yy(:,j));
/ l3 ?+ J3 t1 o9 N* j/ B - ymax(j)=max(Yy(:,j)); r9 |! A& |, c/ l5 k
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
/ U1 p5 Y* ], l2 N( M, X+ i: [ - end. g/ y/ o: Y2 Y1 B% b( X
- X1=Xx(1:n,:);
+ P3 G, s3 k3 L1 N$ ~$ D/ j - x1=Xx((n+1):end,:);
+ Y2 W! p4 Z& T+ u8 [2 T) N/ [ - Y1=Yy(1:n,:);
$ u0 d( A1 p- M1 ` x, y. s9 ?% y6 g - y1=Yy((n+1):end,:);
4 V; b5 K: d- p1 e2 e5 y - ) V\" V9 d8 p; N2 l8 f7 a3 U1 o
- %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间8 z% @( v2 S+ L: X! ^\" V2 \5 T6 q
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);& _) G5 ]3 n# A\" l- l' Z9 P
- [CY,SY,LY]=princomp(Y1);1 Y0 u, t- L5 t\" I: k
- CX=CX(:,1:p);, d9 {9 J3 q0 z) D, B
- CY=CY(:,1:q);
5 Y* S3 f7 E* ?, P0 r! U% ]+ s8 R/ q- R - X2=X1*CX;2 ]\" v\" I; s' ?, C\" k
- Y2=Y1*CY;
/ ^% \; H, u; s5 ?3 e9 { - x2=x1*CX;\" ?4 e7 s7 n8 w* h. f, k0 `
- y2=y1*CY;1 {0 E3 D4 b/ \. s. J( H
-
4 r1 f; N2 N& {1 o# D' a - %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
2 z1 p' d/ {, j( B, H - B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整
* @5 q7 B1 {- n# ~5 V* O! C -
, o0 S\" H) `, G: `# y/ S# u1 y: J - %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
: F' y2 m, d9 a% p - y3=x2*B;
/ C2 B8 {; f* r) M3 L1 y2 N2 c - - g+ C) a4 K* Y
- %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4
\" [2 x. Z% P7 o0 \5 s! ~ - y4=y3*pinv(CY);
- [$ e3 d, c+ [% ^ \- w0 B -
# n9 w$ c) R2 p L - %% 第六步:将y4反归一化得到y5
! x& j& P+ m\" F! A - for j=1:m8 P5 \/ m1 x$ X, ^
- y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);; Z\" {8 i, Z% _0 v
- end
1 a' Y- R, j! I' K - # @6 [2 E( f( U8 j3 l5 `
- %% 第七步:计算误差/ l! c\" w P* m! J# R
- e1=y5-y;
- K: r Z3 X0 g; g6 S* I$ b - e2=abs((y5-y)./y);
5 i( | g4 Y# M# V! l -
8 S; t1 w! r! }& f/ ^# `) C* G - function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)
% i\" e# A$ Y& J ] - %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
# q7 u. F1 b! Y\" r& a5 w - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本8 Q$ c# v' [, r/ W3 O- a
- %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
1 p5 {4 g3 T7 l5 } - %%: y5 ^% o2 ~9 T- Q\" c1 Z
- [n,k]=size(X); t# G\" [$ J6 \! A+ ]9 g0 X
- m=size(Y,2);
W% o\" j' ?, U s - pmax=n-1;
) I0 v, X, [0 \\" ` - q=m;
9 Z2 F+ S, N( A. M\" b - ERROR=zeros(1,pmax);
8 n& A* {& b* U6 p - PRESS=zeros(1,pmax);
\ E9 @3 U! K! q. c5 W' F - SECV=zeros(1,pmax);
! r2 z7 R, y+ ]# X - SEC=zeros(1,pmax);7 @% \+ y/ ~9 M, J0 @1 x; p2 l
- XX=X;
$ |0 d+ f% l5 w - YY=Y;
1 ?\" K3 s1 K& j' s8 y - N=size(XX,1);
8 z/ P: c5 \3 E* X8 I4 W0 l - for p=1:pmax
\" C9 ^* d4 M7 D\" g( @% ` - disp(p);
# d3 z3 A+ s7 I' }; U5 x - Err1=zeros(1,N);%绝对误差& n1 \/ d8 V3 n: i* }
- Err2=zeros(1,N);%相对误差/ m) x0 V# W* J6 u* V
- for i=1:N% Q, s& G; t9 i8 d0 h0 }8 u. g0 j
- disp(i);
( }- ?! P4 c( m, Q8 R. j7 { - if i==1
1 f6 }; X9 G3 X8 R+ H8 b - x=XX(1,:);2 {; \# z3 a) ^: ?
- y=YY(1,:);2 l! i/ @0 Y1 v; @5 U/ i. X
- X=XX(2:N,:);( W; t1 X\" n( T5 ^1 V& C
- Y=YY(2:N,:);9 Y4 E' S) F\" X4 l6 S
- elseif i==N7 w( d- a9 j e) ^4 V G
- x=XX(N,:);
* Q) T C$ {5 ?5 ^' I; Q - y=YY(N,:);( {$ U. ]$ ^1 `/ T0 O) l
- X=XX(1:(N-1),:);
1 |$ m+ s3 O\" |0 W0 @ - Y=YY(1:(N-1),:);
N( u! E6 a. t1 E$ @. s - else
/ j& A2 E/ u' r\" k1 X) j - x=XX(i,:);
0 H\" |. N' ^4 d - y=YY(i,:);
' v. c: o( c) r2 R - X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];2 V; O$ b\" T$ v/ O
- Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
; y1 R' O8 \, d( ~3 m - end
1 s3 _0 b$ f+ [3 q- h - [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);
/ ?- ~' x* }4 ~9 X* p' L) H - Err1(i)=e1;
( m& N, ?! U6 m4 b' T - Err2(i)=e2;
7 H& @2 j$ n4 I0 g. F ^% M: ^6 B - end1 i- R3 @7 @) n0 N* l' A
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
\3 ?( g1 E# U9 r1 | - PRESS(p)=sum(Err1.^2);4 p3 w/ M, ` W. x9 h6 \7 o
- SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
2 h7 U/ _. @, i0 a6 U - SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));4 `. Y% G) T. p\" y9 p
- end
+ {4 j* J: Q4 k( Q\" F\" `2 ? - %%
4 R/ f- Z0 S) V% t- g; Q4 @6 z$ Q; n - [CX,SX,LX]=princomp(X);\" U5 R. k( a% D1 O/ ]- V- G8 V
- S=SX(:,1:p);
4 _- K+ ?; b. W7 t& }6 X( T - MD=zeros(1,n);( L) @7 {* v& X
- for j=1:n
6 {9 j2 f& f5 Z. v, Z0 { - s=S(j,:);0 {- i# g( I: A# Q4 J/ ]4 U
- MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
3 i) Y% A: y! t& z - end
[9 ~\" \; S5 l. g
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, m( i4 i: D, l) S5 H) y4 E. V9 [: q |
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