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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    function main()2 \/ ], p7 s. n( |# @6 i
    %*************主成份分析************# `+ E# K% I9 {( ]
    %
    + w! G* D# z/ J! E%see also
    8 T/ b  q0 H" M* S6 b%7 N2 f2 N+ c4 p( [" M
    %读入文件数据- U: {0 G0 S2 ?5 u' u& U- H
    X=load('data.txt'); # J* _  |/ f. ^6 X, C  `: f* Y' o  r
    %==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================: O) s# h  z# K. t5 k
    %标准化处理
    7 N, T- D. w; z2 X[p,n]=size(X);
    $ m( t* s% O$ l+ @for j=1:n
    5 T, [8 y0 ?8 D6 |3 i  L1 N) O    mju(j)=mean(X(:,j));  o7 |: C$ T) \* |. p1 \
        sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));
    / {' [0 K7 t! zend; Z( p7 L( N) E' x0 }
    for i=1:p
    . j) Z  E6 h6 K1 K. w0 D    for j=1:n
    ( ]! E' M0 Z# J1 ~  Z3 I        Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j);
    . A* k1 r4 |0 y! j, D1 ?4 F    end
    + K  `  w$ D7 i! h: ~6 S8 |end9 Q3 a( [" X5 W1 {* Y. [
    sigmaY=cov(Y);
    2 B" a4 C" n, V, o%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量2 l# e9 U( v9 E* S2 q+ E2 X8 H3 a
    [T,lambda]=eig(sigmaY);
    9 g; z5 k4 J0 g2 D  F1 |disp('特征根(由小到大):');
    $ _9 l2 ]( n5 b  H1 ?6 ~disp(lambda);- i. y1 z. x$ Y, J
    disp('特征向量:');
    " @7 k5 i( }; y  odisp(T);
    5 O) T1 |& {% n1 H' Z$ S" v0 [%方差贡献率;累计方差贡献率" e6 h6 J: U9 \
    Xsum=sum(sum(lambda,2),1);
    ; E% Z9 z9 P* x& O- Afor i=1:n
    $ I7 Y+ R: u& _( o' o    fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;
      @% w) V) Y; r2 Y8 O1 ^) p% z: xend
    6 C( \# O& G* m. k( O( o9 nfor i=1:n* S+ p4 p% K0 G
        psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    & L! ~; L7 q$ Nend
    5 J9 u7 \  }3 K, h( W/ r" ~disp('方差贡献率:');
    ' S4 V: x2 C% w1 Z2 J8 vdisp(fai);
    ! r. f- z$ J9 c! }0 G; Vdisp('累计方差贡献率:');
    1 p$ f1 Y) n: u1 Gdisp(psai);
    1 ~% A( F+ ?  Y8 j9 @%综合评价....略* q" i  k' X! E3 Q. O

    9 v% ~4 D8 j: j$ [
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    ! D" j! `: s* V' f' i
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