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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
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    function main()! F: a+ S% v, ~0 [$ Z" w
    %*************主成份分析************
      g4 k( V( C" r+ |+ Q, [%0 }; v- G9 N$ r
    %see also ( P* L9 \( H1 n
    %
    $ Y+ S; {0 _! j) P%读入文件数据
    . U- t9 a( }2 W& u4 Z# nX=load('data.txt'); + e+ V% P5 X+ j, b, \
    %==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================5 |; f/ g4 A: ?
    %标准化处理
    % ]0 U+ u# C, N* M- p; Z[p,n]=size(X);
    0 X; Z+ ^, ~! ?, P0 ffor j=1:n
    8 T3 j9 s: e' v7 i& K# ?2 r    mju(j)=mean(X(:,j));
    3 r1 b1 Y6 w! b- B, W3 d: d' S" H% f    sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));
    1 @- ]/ o# D$ C" m' \end
    $ `4 \9 ^/ i5 W- L7 p4 h& xfor i=1:p
    " \! G7 U* {' x, U* [/ t    for j=1:n1 W7 s! R0 n+ m5 W* P
            Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j);
    ) k" U& d9 q- Z. J5 c    end
    ! X8 W( L; w' c, K2 w% ~2 Mend
    6 u9 Z7 q9 H1 r4 P: ]0 ksigmaY=cov(Y);
    $ A9 n+ s3 Y7 W# e, Z+ U. T: d%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量6 \* h4 A$ |# F
    [T,lambda]=eig(sigmaY);
    6 s& P& b" A+ m6 R1 Ldisp('特征根(由小到大):');
    * l4 d5 J( }3 T# N. v. T% jdisp(lambda);
    : _; a! J$ I" ^9 [disp('特征向量:');3 D4 X" S% M& J
    disp(T);
    & }4 t$ L) s% J( ~5 |/ x" Z%方差贡献率;累计方差贡献率
    $ N7 f/ Y1 h1 I9 SXsum=sum(sum(lambda,2),1);
    / A) ^4 b7 d# x+ f9 b, Tfor i=1:n
    1 e% b! R& X( }; Z: I! W! B0 ?" [: L    fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;
    5 g/ {" K8 q7 Qend! D: V0 b" u3 {/ A( L( n5 b7 u% ?
    for i=1:n4 E$ E( v. m& g$ @) v& e( w
        psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    6 j- V, ?7 g2 ], f1 B" ?end' U' e, |; i/ p/ P8 [* k" z, d
    disp('方差贡献率:');
    % r! c. Y" n/ S. wdisp(fai);. G4 _7 R9 |: r! Y7 Q; w
    disp('累计方差贡献率:');$ {& X& k& }+ M/ @! ~! T
    disp(psai);
      T3 ]7 f! _* @+ N% |- b' J+ {%综合评价....略$ r8 p  \4 n& Y3 r0 K
    # u  l; e: r- H( l5 I# }! \2 i; T. N
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