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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。6 M7 L: p  ], |) U
/ m5 w2 D6 S4 e+ E1 f0 J

9 f4 j" |0 `8 [% @一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。' I, `% V. w, ~0 S1 F" S' X* ?. A+ j

# ?0 t' Z: p- z/ @但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。
3 U) Q* ^$ G; w' G针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
. D" H& q( S5 w
' Q% D/ F, E1 k+ K% l: c通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。
* i* ~) i" P: B8 ]3 N8 F# F0 R
受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):% @; J4 q' d: d7 h# e
如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:
4 L$ P3 `" b* V5 {(1) y1= x1    简单回归  t" ?! [  E* V& ?
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)
. P8 T3 }8 `$ I' q(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)
+ |  Y5 r/ }# Z8 p0 n0 u(4) y1= a   单因素方差分析' R, ?- J' l3 [% B7 H5 o, |3 O
(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析
7 |  v' m3 c- n) p8 ^(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析
! s! ]/ `' J+ M, M) N(7) y1= a x1   协方差分析6 f+ q* J. e3 |8 _
(8) y3= a   单因素logistic回归+ N6 @( h7 I4 D4 m' f/ C
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归
8 D5 Q5 M& C6 o/ D, V6 _5 l(10) y3(time) =a   单因素cox回归3 R/ N% S, J( k2 n. k" ~/ D$ Q1 t
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归" D! i* S' R6 L$ W5 S9 F
* K+ G) B7 V( I- a
1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例0 c7 G! h3 d2 m3 @0 I) _$ T
( o& j: @; `8 f4 {
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。6 m* S, g0 h/ t% d4 A
8 D4 d* e: \# y
但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
. Q* W6 Y* c! d2 T! w
$ ]& ~' U2 }+ \, l4 q  B2 J( f  R再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。7 T, z- _$ B# X
: a% y! f! V" D' e4 O, d
附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较
$ `" F; L1 H4 q+ k   data drugtest; , j$ {% J# a) {4 G: C( q% T
      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@; 0 \, U/ m! a  o: |/ y1 T
      datalines;
; p3 C# ~# }5 r& g4 |9 @   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
* t" J- X1 ~- W, E$ p6 N# x& G   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0
7 \+ S2 w- q$ Z   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18
( u5 x4 C/ U+ m( q   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9
3 Y3 z0 l0 _5 t$ T# s- q   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23
4 P% _) a  i! F9 i$ E1 L2 w   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20
  s+ N/ `8 U) L2 Y: g   ;
/ \4 n$ E5 f- T2 Q1 j. _; G" Z
) I# y: u, e; }( K7 J! x   proc glm; ' E( b1 ~5 e  q8 E+ Z
      class Drug;
, l4 |% h3 M& K0 X) m3 f2 @      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution; * @+ N* G7 Z& d
      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans; " N1 `0 k7 Y, ?: @# b5 c7 A
   run;
0 K- |& A, }! v0 C1 D' |
6 [0 @7 f0 ]$ o   proc genmod data=drugtest;
$ s+ u# e' @/ J7 V3 i# i4 B9 i      class Drug; % ~$ t7 {) t+ h; J0 L& h& |2 t
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1;
' S+ {; Q4 B& T- }9 ~" c  I   run; % d/ l% i4 `6 M- c1 g! F) D+ ~

  c: R, m" Z4 @0 T8 t   proc print data=adjmeans; 0 y  l" g3 ^6 I7 P( h
   run;
& n' T+ |* c. m3 W: C
5 J9 ]7 g( u' F6 ^. Q- ^
0 t6 K$ y5 T) X9 v8 n! |( a# ~, _2 x0 ]- O9 \: B& C
zan
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飘过
+ T2 M7 M; b% }7 }) P' a
学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒+ S. I+ G+ Z+ b4 }" c+ U
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    拒绝一切

    9 w. Z1 i4 k+ Y0 ]学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件9 p% q$ ?2 W( J
    ”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,# `# s; M- M+ r4 o9 C8 b; h
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    2015-4-1 17:42
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @
    2 D0 @7 s# I2 w  }; h/ a
    深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。' N. x( J. m1 D5 T" e" _' J
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。9 @6 y7 J3 P- X/ H; n* Z' ?) ?
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