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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。
. u6 [* p3 o" M, v5 y' e6 O+ h; }2 I- Q6 B7 j7 B) v

/ v" y/ S) G2 a5 W/ \9 ]; |; ~' D一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。. s& ]/ S* V- @
  m. w& I! K  E! p9 _! Q  p2 ?: Z
但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。/ z, y% }7 C( \
针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?' u! E6 u# P6 F8 X# k) P0 s7 Q) S
1 e- ~- {% u& L: j7 E# k# s" X
通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。+ y  q& V* z; A# f2 T

% y& k& h8 i( `$ V, J. ^; `受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
2 m  T4 H: {  S) C2 {如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:# q+ e! L8 Z; ]1 u
(1) y1= x1    简单回归3 V' _8 @1 s; U( I2 a+ z3 Q
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)7 p8 P; W5 k. H6 p1 r/ P, ^, Q
(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)3 W% ^0 j$ m5 C
(4) y1= a   单因素方差分析
' `3 y" |2 h/ G8 V( S' c(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析2 r1 l  B# _3 v. c( T- ~7 D
(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析: ~& T  b: H  T+ q8 [4 U* H
(7) y1= a x1   协方差分析( v3 J! W( _; g6 _/ l% l5 ]
(8) y3= a   单因素logistic回归6 t3 N6 a0 d8 q1 o) X1 A9 R
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归' P, M/ {8 i' m: ~! [
(10) y3(time) =a   单因素cox回归5 l$ b, E1 m$ i9 |* [) ]! g  X
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归) j" Y7 t# x% l! x9 v

) J* P) _* N- B1 O1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例8 N. G3 q+ j0 U; J6 |1 A) p% V
  p. _" Y7 ]  K8 z6 A- o0 R
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。; D) d0 m' m' _, L7 W
# v8 k0 H5 W! Z
但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
# \3 N! \; X$ i% P; W, Q4 `7 Q! `$ v3 T& l9 A" t2 C' ?1 \9 C$ f
再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。
* J$ D4 w- C; W1 J1 L: q% ]' H' f& q0 [) T  p( F% C' r
附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较
* o0 A8 w; j/ S. I% n, k. u   data drugtest;
9 Q- w4 E. d0 U# @      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
. n* Y1 h* B- K$ w, d9 ]      datalines; % M- ^! {+ y( `; g5 t4 b6 j
   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
4 c/ n- H9 ^9 I, U0 ?% x* y   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0 ' Z5 }  f$ H9 z7 [! j6 j$ D: P: _# k- W& E
   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18
2 D  h1 m6 d# g! K' Z   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9 ( H7 z7 t  e. K. F- A/ B
   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23 ( c5 m6 E4 o( ~5 V
   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20 , y6 D1 o* _0 X! }+ r/ W
   ; 6 {2 Y. d% _& R6 k

; `' ~) w" h% C3 }2 ^0 p- D% v# X# @   proc glm; $ ]; ]  B2 u4 j' Y: `& R
      class Drug; 0 {. Q8 \5 d' f) T; J1 ~
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution;
7 e1 G) J4 |# v' ?      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans;   @0 ]  s9 H+ l0 I/ [' _7 d
   run;
' I8 W' n) s# z
0 T4 E# `) K! A0 o( H9 }8 m   proc genmod data=drugtest; ! Z# [  C  [& I" u' l0 K9 Q2 K
      class Drug; ( k% R2 D7 b# ?5 M7 @- F
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1;
$ I& B, U, D! _& T7 c9 F- ^7 t   run;
: ]; A2 ^3 _' U6 b
8 L2 {! K7 U. q  r0 D- a2 f9 k   proc print data=adjmeans;
, s0 ?( C, h* b3 P& Z0 a+ N   run;
1 f8 e. q3 P8 x. w; o0 b% g* O% R5 M+ D6 e" n8 S6 k. i

6 T: j0 ]: `5 S5 O
4 F2 v" i( t$ L5 l( Y9 F! `
zan
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6 k" L) }$ U( ~# [/ U学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒, U6 }' r3 F+ P% M! }' B7 v
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    1 u6 g7 |! X2 R( V学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件5 i/ @/ @& D  o4 v: @8 @2 k4 U
    ”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,/ |" C3 O/ d; z. [( {) a& ]
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    [LV.1]初来乍到

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    @

    9 K' b! i- f& c3 A$ Q深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。
    # m4 Q$ e' p/ ^+ Z貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。
    3 n% Q! ?- i) s# P
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