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数学建模中的传染病模型及其编程求解

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    1#
    发表于 2020-5-17 09:59 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta |邮箱已经成功绑定
    问题的提出' I4 K$ x' x  ]) L, z% \$ _
    医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。
    8 a- }* ]. Q6 h$ x
    ) d( t9 u$ t( t( Y  i  g指数模型
    / f2 l- J9 \/ t  u# @/ D# c) ]& Z定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算8 o) o3 Y; a5 a
    i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t7 q+ c0 Q$ J/ ?
    i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
    3 y, N; q# |; [2 N0 ]$ ~
    7 y5 J! D" c9 N. x将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式. d9 j# T1 d3 y- L
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t4 Q8 _" B  d9 s; n% @: m/ L
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt$ U. D" t; L/ a. \
    ; Y1 K/ n9 k& m
    以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。' a  @6 J) N9 _$ F9 Z) Q

    + A% Y2 {- A4 A; y. o9 D/ u% Nimport matplotlib.pyplot as plt$ @3 ?. t% \5 x  x' ~7 u
    %matplotlib inline5 k1 o5 n: e% l7 Q2 {+ N5 x" n( U& H( `6 r
    deltaT = 0.01) D9 J; v1 y/ O
    lamb = 21 r* q$ ]! F4 v
    i_list = []
    4 }/ ?/ K7 D: |+ h0 ji0 = 0.08; # 初始有8%的人患病3 w4 j$ M" ^3 Y+ E
    i_list.append(i0)
    6 N3 Z" P  [" B+ zTot_Time = 10. h- c7 H9 i+ {# A9 r. J4 ~& J
    TotStep = int(Tot_Time/deltaT)# b) p2 D" U- h0 _) E0 H$ g. {& O
    ## 3 P  e+ b9 K4 v6 g1 o: `3 d+ F
    for i in range(TotStep):" j" C! G1 V& Y5 ]4 }; Q
        i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT
    0 H! [6 a# J' y- L6 p    i_list.append(i_new)" u& v) i4 G/ m/ N! X! H
    plt.plot(i_list)% y+ u9 g  [& E( z1 [9 a
    6 |- d9 o. F0 L
    将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
    / Z0 o) N8 \: R+ V. l3 D& o6 |& i
      N, Z) v$ P9 a2 p4 r9 X+ B  u
    ( R; ?( g- z- {) V: W1 w实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。
    0 c* z% a) K) I, T9 @% R$ L( N2 `8 x; y  \
    SI模型! z! w0 ~+ N9 E
    现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:7 f8 b# Z6 m0 ]* t/ l; @1 r$ R

    ' _4 N7 |5 ?5 T$ @! k/ ]在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)% ], g* O+ |+ ~( Y3 H
    每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率& @5 U& m0 j& e8 e/ E, P
    仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算$ i7 _4 g% k8 K4 g% {" S5 E" |( v
    # o& H3 I! A, s, ?2 ]9 l
    N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
    5 i6 B7 e, C4 }) a; u: GN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt
    6 k1 Z' Z: L; O3 }& p/ ]3 K" n
    ( n. A; [3 i, A: L消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
    6 w& F' L, w* A" H7 `0 o) Ui(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
    - T/ m5 G/ i0 S  {$ B* c' x5 Ui(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt
      h- H( s4 ~5 k5 d& P. S9 n2 q! z$ J9 n- u, ?2 Y! e: r
    同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:
    9 R7 I1 c% u8 A$ x  J
    ( h+ ?9 m, c: U  G. V: N7 \  Dimport matplotlib.pyplot as plt( h* G7 _0 C( `- e, \
    %matplotlib inline
    + _/ q6 t0 q3 h& e2 [8 z) BdeltaT = 0.019 G% {7 V& ^$ B: D
    lamb = 2
    ) ]1 W/ l; k/ q5 ii_list = []  a% H; h& d& {/ @7 q
    s_list = []
    ; Z# K! F5 I  n: Li0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
      O2 ]' Z# P, u2 c* w- Hi_list.append(i0): [' ?  U, U; k4 _  V5 C; L  i
    s_list.append(1 - i0)8 \0 S) g+ @/ h4 ?8 {
    Tot_Time =5
    ' c' B, W- x) c0 o" S% N5 uTotStep = int(Tot_Time/deltaT)# E9 s/ L# o1 s- j
    ##
    8 d6 T6 T4 j6 Qfor i in range(TotStep):
    ' j8 F" y8 C1 W  o    i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
    8 D. V# m& V( k, t: n5 J. n    i_list.append(i_new)5 i8 c2 |' A2 P, ]/ j
        s_list.append(1- i_new)
    5 M8 C4 B$ [6 r" j0 w- }Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]
    , @5 B/ i6 a5 u! q9 F1 L# Fplt.plot(Time,i_list)
    ) g! M. ^1 j4 b$ E0 R: Xplt.plot(Time,s_list)
    1 T4 D& ?$ D4 ]1 d+ W) f$ splt.title("SI",fontsize = 20): D3 w; O+ R6 L+ B2 p
    plt.xlabel("Time")$ W) |  k" {( D: k1 L
    plt.ylabel('i(t)')
    $ t0 E: ?: c. V9 n! S5 t* P) k4 R5 ]; Q
    从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
    9 |  W6 {2 \8 j' B! V
    ' @' i. ~6 g8 j. g% n# d然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
    % x4 }4 Z# F! E" g' y+ W' @/ J————————————————; _- G* [. m5 J! A- E) o  |
    版权声明:本文为CSDN博主「任公子ha」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    / n+ R1 ^! L0 v! y原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/93918383. V5 |  U) I0 Q2 c1 Y" B, E& e+ b0 S

    ) \9 T/ D  I4 `; q- i. G2 l  K# p2 _0 y& C, C. o! a; E% ^% b
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