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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    * A; M: Q/ h" h+ Z. Y! J常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。
    6 [  _9 C& L0 \: y8 q
    8 S% B0 {' ^) R* l7 y" {- x
    0 I; i3 ?2 r0 T  c, K
    ( i. z) w% R1 j4 _: B例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
    ! w( r  H' N5 s) L" h6 G$ `& ?) O
    : d) L: W! d/ W* a0 ?: Q/ P(a)假设! R6 V& M: @1 z$ I
    令n = 0,1,2,...。 ( c& T) O' k2 J! r" f" ?/ N+ B
    : }! s, J! Y$ }6 O

    7 z. z. T# }. N8 G' _# I: |. U1 N; i8 ]# G2 q
    5 B& J0 y- b4 ~5 {

    9 ]: q" [+ E/ ^( ]" ?1 l(b)建模
    2 U& R2 K8 |; M9 N( _# l: p' C0 \4 y1 `
    . s  U6 [# S" u/ u- p

    7 @8 L7 k1 p1 v2 b: A3 b) }# B; _6 s9 y& H  }% J2 Q1 K

    . B7 [2 q' q0 k$ Z0 d+ z8 [& t, ?4 r% u4 |/ z
    编写如下 Matlab 程序:( l; [5 n* n- a9 V/ o! ?
    ! ~3 ^- U3 S7 [0 H" X5 X
    syms n a0 b0 c0
    ( S2 ~5 s7 S+ jM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');3 G* j9 C8 j" B3 x
    [p,lamda]=eig(M);) q% r9 Q/ \+ D
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];, U& G+ l* Z" u
    x=simple(x)
    . p" s4 M1 Q/ e; S, |2 h
    1 x( L+ s) O- i2 H$ E  K+ f
      T: @! H# I$ x# I" U( |' D  l4 f# v

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:

    5 V1 f7 v6 n3 [& a, U7 `3 o. P9 A
    syms n a0 b0 c0
    . d- m2 B' M$ E& G7 @* hM=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');( r2 ^% V7 W+ s+ l* W1 F
    [p,lamda]=eig(M);
    ! |4 o* D0 {" D7 w# i+ M' Jx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    8 b1 m/ w9 b9 a0 kx=simple(x) 1 E: V6 F: A& N' [* N. d1 g
    / r, R( F$ T* T- T/ H" [, d5 J
    ( ~' ^3 [- U. `  t4 G% ~2 H

    : P3 ]& T1 ]8 s2 常染色体隐性病模型
    8 i' r$ o4 w- [1 R1 B现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。7 s7 `7 ~; Q1 K& `# H

    1 \: k7 ]5 g" ?: d3 Z6 F(a)假设' R6 [2 T8 M' R* u+ q3 m% X9 l) F
    (i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。4 c$ ~& I0 H7 R

    " X4 o5 M; h* Z' W' b3 [- J4 P+ w  b9 X1 u( @) N/ g! u

    & Y$ J6 `( U& i; C9 \. a (b)建模
    ) h9 R* g# v: @  n- R5 P/ f' k, C1 X
    3 \: _5 W! T0 ^7 q. g4 r

    4 i4 |0 U; X; P" W, d" u9 r, W" J" H6 Y. l$ i: ]. s
    % l- p; h: m, R/ z* S0 B# b- p' z

    4 r- N* m* r) G+ ?5 \(c)模型讨论% y- w- d' S( m- C
    研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
    ) n8 q: B3 Y* B* Y
    0 a" G! c* N6 B6 ]2 B; C/ a# N0 Z' A! j

    8 t6 {2 ^3 E4 ^( _下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。# m1 q( Y& G; R: D" |3 ]( ]3 P3 T
    ) u+ U# {, R: r% A3 l. H' Z
    3   X − 链遗传模型
    ) f  J* S5 z  ]8 O: ]; Y' xX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。4 b7 r; {) H  S# v

    + Q4 k/ d5 o9 x6 l(a)假设$ [; p9 D, u6 e1 t; e6 N% y
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    ' }* _, U, o$ O) }! C; A. Q( D. f: ]* J
    (ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    / o1 j) w) X" V9 @0 \3 {3 z" L% _; O3 T2 a6 z2 s* s% y' N4 u
    , M& e0 [1 n& p6 a( s( i- W1 x
    6 \! S" y5 A+ |6 r: v: g

    7 o. {1 g) l- f8 n  b  o6 X# }* A7 b5 H, R! N% @  Y

    4 x; e8 Y/ x" p) U& Y- f% a$ p% ]4 q' l: \- s, w

      H% a# E/ g9 o0 O1 n) \编写如下 Matlab 程序:
    ) ]# q+ S2 H0 n5 P2 p7 M, I% H7 ]; y! G/ @( T: g, `
    syms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
    + p' ~; G) E4 R; K6 T, {% vM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;, a* ~! z6 Q5 c$ t4 W9 H
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];& n7 ~0 V4 e+ T2 g; A) Z
    M=sym(M);
    * b. T& g5 S, ?6 G% s[p,lamda]=eig(M);; a1 `# ~3 M, b. J) s, d+ c
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];) ]! n( K; o2 S$ k5 u+ Y
    x=simple(x) / E+ ]/ @" ^& @, }
    & ]6 k& w* a2 B: z/ W
    由上述程序计算结果可以看出
    # g2 P. z0 e" |2 ]$ m' W8 X% W
    , L" a7 a& A0 Q3 t% B$ Q3 `$ O' o) O* L' p) s9 v" t
    1 R) x9 X$ J- l
    习 题1 ^0 H+ g# P. X$ C
    1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。* r5 B, P- W( g- R& O$ U$ q

    $ K" ^# f4 W5 d9 N" x- V- k3 m2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    1 }- g9 Y$ k' c! ]8 D, c
    & a: m9 c7 r# G* F6 w' b" Q4 Z3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
    2 e9 V: y( W$ ]4 }# P5 p
    7 Z6 P/ ?; b7 ?0 _+ H6 H: j1 |( R$ L

    1 r" v# A+ q0 ]5 g/ I. Q: c" C/ w4 A. j/ z. f* G
    ————————————————
    ( V3 D! k( F) N) V0 H( m版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    6 b. R' t1 o! C- t: |( A' p原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596$ h+ j& J2 {, |: ]2 m+ r3 j
    , Y) |4 K& j: E0 h

    : c' \! i# o; u: N
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