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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
- H5 I0 V/ s" m  D2 ~! P
, F8 ]- b9 e- J8 t4 h. @/ i2 h" M1.函数定义:0 ?3 }$ w* J4 H2 F- _
! h1 v$ S* I% X$ o$ r+ o8 M9 B) |

' s9 v3 W4 |9 K. n7 Z2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
+ ]4 X- e* {+ G$ h* a2 ]7 N; S; a4 P3 ~( z( q8 Y) p1 A
! A% w  X! a4 j7 y+ o# R1 G
3.数据读取与标准化:
  c1 f1 y7 d3 T1 Q% F* Z( d2 i" j) q+ n% \; ?$ e, W( ?

# r6 T8 m# f/ M4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
; ]" I% k" I3 J# K5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。
; w# u! A$ v! x6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。1 j& V5 M% i% F! z4 H2 t* [" |
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
  x- S) ]; s+ o, `$ H5 w( E5 T# u! r# G7 O" p" r6 `
# K4 G0 ^, v, R/ c" y$ ^% K
8.求解相关系数:' C  P, p- G4 ~* w& [' a# @
- S  r0 O# m3 _0 t

9 w- E8 ?* f: `9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。( `' N& C9 ?+ {4 h8 W& J. h

8 h. P: Z. R2 e2 I, B8 x. y/ K& q; f% q; q
10.计算特征值和特征向量:
+ U, }' `2 \" m
9 g! n2 O$ W1 T. X8 \2 J' H, D; J/ D
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。0 l3 Z# ]' E/ q. u0 F
& A6 p8 u8 `. Z9 _" X

+ i2 f8 ~, V7 ~' H8 \0 [) E% j5 z12.提取特征值和计算贡献率:, {9 q* q3 f# V2 h3 e
2 k1 _! H4 g4 X- L* Y8 T( F6 Y0 l9 w+ C

* X6 K$ R( }# G3 U3 d13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
$ N+ v1 U# C7 i8 p% a' W7 d14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
0 {  j$ \! P5 u+ o15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。8 ?1 G* _4 m/ c" ^- Q5 v' b5 ?
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。- k3 y( `0 |* E/ K. i4 s
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。
9 e* ^/ o/ p, U) u/ v  w3 m2 s1 Q, p+ O
6 j5 }- B6 [( g
18.确定保留主成分的数量:; M0 k$ c( F/ p: d

. N' S/ G+ p! d2 _( B1 L; I/ i7 f: n7 j/ t  Z% x
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
  I2 x$ ]4 L' o: T5 b) M20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
8 _) p( b' {5 H  J7 C
% [# G% s0 p4 Y9 `- D, ~2 r8 A% C2 g1 U% ?2 A$ Q
21.提取主成分对应的特征向量:
0 r& I8 l- d  \% X% l) s- I: f$ V3 E1 G7 V

" e" F# r) H) d- K* j) T22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。& Y+ @0 \$ V( i. z0 ~# T1 d. h

' b1 T7 M6 p5 e% a, ]1 _% F
: t3 @" C" L% h# f( k23.计算在主成分上的数据得分:" d2 z4 B+ p: T: s/ L
2 D$ M7 B; O5 `6 R' l

* U* p/ G- W, v- r, }8 e5 z5 z24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。# [+ S5 I6 T1 L9 T

3 P" ]' D% I* P该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
! b- L/ U* n, l  V1 j( o3 N, j8 C: d  _9 h, P

3 e2 s6 o; Z2 O" Q
, V, }1 O  T# P
) L: C$ m* M! N& \$ a6 F# h& R: u/ X3 B( v) l/ ]- r7 o

PCA.m

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