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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
8 K. D) w- [$ x* [0 X
3 w: {1 }, U8 Y a1 x: D1.函数定义:
8 o) U |. p n0 q
) W6 k4 o* ~+ a+ W$ q1 W- x( @/ w; J4 B+ M$ y9 t5 d
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
! }9 b5 ?4 U0 ~1 p* h$ h J
- D* a8 d4 Z7 k- ~# T) ~% `
: Y( |" D6 t( N3.数据读取与标准化:4 \# o# m3 ^% I
7 J5 r: o. ?7 z; L
8 X6 T8 B4 `; G) l
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
: M4 F4 Q- M) J7 s5 L' `& O6 V6 g+ S5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。' R6 H3 u6 E/ D7 [
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。4 ]- N, D* m ?
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。8 P6 X! ` b9 [
3 L$ T0 Z/ k2 V5 g3 I
: j) C( S& H* R8.求解相关系数:
6 |: L9 {: R0 D L9 w8 n
/ R8 H2 h u3 z% Q) z" K3 \: `$ r$ T3 }
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
9 r* [! [$ i7 K
; n0 |# X( u B! k% g
2 {, b- K# c' g; ~5 g% `( S10.计算特征值和特征向量:7 n1 x9 J0 W z
; j# y5 @6 C2 J3 o! u, w( |; J+ ?' \
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。; g5 E4 I: U9 ?4 @% X w
1 {7 T4 a$ F% p% p$ b, R
# D; g' c9 R- _0 g9 [# \! L& K
12.提取特征值和计算贡献率:
" E$ d* A; A- h
1 U7 d6 n4 X8 n8 h2 ~+ ]3 P U! `/ f& h. F' a+ z# m
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
6 X7 M1 `6 m! d, O! O5 i# }14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。 e) d1 ]6 m1 v4 _% Z6 U
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
. z" O9 s! n3 A7 H, m! o& Z$ [16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。$ A0 o/ u- q6 g" v9 R% y. P
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。3 H) }2 F: L5 l3 Q' k( u: M% B" h
, A* A: }" l0 o$ z! |
# c7 |! L1 X5 A
18.确定保留主成分的数量:) r1 _! e. k8 w2 [3 O, D' f
$ c3 @, v& l5 Q4 H5 U3 @- D0 p: M& P3 G$ K& E
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。6 P# ~) i, i! q& d* }
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
1 M3 `) U+ K, I8 t4 ^9 l# r3 Y9 r! a% c$ ~7 l: T
# d1 O/ G) R+ Q2 S! `
21.提取主成分对应的特征向量:
8 c- Y3 {0 B; C# l; C e3 z
+ Y! G( a6 j' ^: o) T' [ C
' @( k' s2 Y5 a5 E22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。4 R; _! q, t+ |; X* _
( e* H. H3 v5 m& }- [. T' U+ j- r
23.计算在主成分上的数据得分:, z% {0 e( l' l
4 ]' U. a: @1 n, H3 h7 n' R9 J4 X
4 N! Y" X7 B7 f24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。7 d- h, R: u& w% q! c
2 T% Z3 X$ p8 F+ |该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。% i6 |! o' H2 c( i* C, X
- W" v1 Q3 }9 y/ v; F, N8 K
* d$ c' k' Q2 k/ i* H( q
0 }! @! }, {& A/ d+ ~4 F2 g
' K1 t% H# B0 q4 V5 l! ?: l( P! ~+ Z- y# J+ H. \0 H J0 o8 A
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PCA.m
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zan
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