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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    6 q' `( T, _/ g2 u8 c6 w5 {! D- a6 ~书籍:《R语言与数据挖掘》
    0 A1 V& b. c- ?* _#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat5 u* z+ f9 \3 L; I
    library(reshape)
    ( R8 S: x6 [4 n: H( C0 E& d) n, `CO25 k6 v% c4 [( I% t' y
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))1 E; K; M0 |- U& A' S

    * s/ k. E# x  r& [#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    5 k3 v% y+ L, D" M4 C- P3 J2 h> anyNA(CO2)7 Z+ s. ?" b. n# a+ g/ L
    [1] FALSE
    5 R7 y' r/ t" h2 W) @" K. G#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]  T4 Z  D; w9 j: D
    ; G1 ^6 h2 w/ {! w9 G
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)/ b  t6 _9 \* R* H0 _, M( O
    #篇幅问题删除部分输出数据
    - }/ B; \9 Z1 Y2 S: q2 a> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小3 U; p: y; H  Z; H$ k; L$ K' H
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    % D3 `$ U4 x% h' I" N& A  ][13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4) Q, ^! x: g2 L, }
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    1 N9 D6 `# }4 |, M: Z7 x[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    + C( N, E1 q3 H& c[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    : j$ R# M& Z  ]0 N1 [( V4 b$ N> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)1 M* v1 f6 s0 e) l
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    . K" o7 m8 f5 Y( Z! i4 N[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    & S8 y8 j6 U# T[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8. K( O& R$ L$ t4 L4 V
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9$ |+ j( p0 @2 g+ g; V5 k. x+ a
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    ; w3 ^$ H8 a, d& M) d0 z, r* H! c8 V5 ^! g
    > CO2[order(CO2$uptake),]: d" d+ f: ]) K$ U/ d
       Plant        Type      Treat conc uptake
    7 K6 _9 {/ L# J* B2 o71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7+ {( @' ^# r3 T) V
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
    6 q2 P7 Y- l+ B9 e64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.56 V, j0 q0 `  h- a" P" z
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    8 s6 P+ R* e/ s) }/ ~78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6- q& k. O. w) d8 I& L' o0 T, r
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    . ]% U; s) P; A, ]* r+ R
    1 k2 G- u( F) ?4 U# E' K" t2 f0 \> CO2[order(-CO2$uptake),]$ ^+ X; k0 o) N% ]! K2 x. Z
       Plant        Type      Treat conc uptake+ e9 G; ?$ S$ s! h5 I1 Y
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    2 a/ \$ |0 U6 P; T14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    9 C) n9 X9 i( A20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.98 q& y6 x4 m9 {, u6 N; F% D+ J2 ^* E7 |
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.91 H: N  y5 n, G, o: S; m$ B5 U( |
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    : e( R$ ?8 K0 _1 g' D% ^2 z1 D* p* s6 s, e. W3 b/ Q) ]
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
      r* o0 J- ?# [9 Q- j9 g; v$ Gn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    $ |( G# h6 o, C9 W* _(sample1 <- CO2[n == 1,])
    : |* ^$ v8 }" W% S2 C(sample2 <- CO2[n == 2,])$ y0 {1 V+ N$ A" J# L
    0 A1 Z, m# v# ?" g
    #(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值% j7 c$ }8 s: j8 t
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean), o+ x# V; o* Q0 w; Q, V( K0 u

    - Q, K6 V7 Y3 x6 I+ ~#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值+ `  K) I  J0 T  g& a. H7 D: K
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)  f7 L) k% n8 q1 H* N# I: w5 O
    * a/ J2 l0 Z. V! X
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    & m; L; W! `, R- D" [: glapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
    9 P8 v! m, `' d% F# [0 Y- S/ ^" x
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中' g4 y' L7 V( M. z* v! X" l" H
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
      |$ o3 X, B  U8 J- l7 nPlant_Qn# O/ A, h1 h- F$ e+ B/ A, p% M
    / N6 G! z2 d+ F' d& o' Q% u
    #(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“; z) }3 J% |3 }) `

    1 J8 P$ t: \& g5 D1 L# P+ L+ m( ^# v. @: A1 J/ @9 i
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度: w: L, _) g- O* b0 B1 H
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    7 h' o( j% J  K3 ?; K+ ]' M' @+ ggsub("[t]","t",CO2$Plant)% L+ Q: S6 C7 M6 {2 Z& ~

    % G  s" c* `- `5 p, j) |library(fBasics)
    * f+ C  E4 f0 d$ z5 p7 i# kstat <- function(x)- n/ X3 {( t/ g# x
    {
    9 t) d) y' ?! W# F: G  if(!is.numeric(x))
    & Y( o  s8 ^3 v# w5 x  {
    " n" g- U& k8 _9 g$ {# H    stop("the input data must be numeric!\n"), b. T* m% g+ {# T' Y! p
      }
    3 r! t% B$ F, k$ [1 \' t. I$ `6 K  if(length(x) == 1)$ u: {. `7 |9 W1 z9 k
      {
    5 ]- C4 A( y$ _" A9 E( U5 @    stop("can not compute sd for one number!\n")) V$ j( P' \$ ~  y7 \: B
      }
    5 s4 N8 ~( _! u2 P7 q$ z  max1 <- max(x)
    ' [9 I. G4 j, @! R! a  min1 <- min(x)8 C) W5 j( M; G, M' q! v0 K% r
      mean1 <- mean(x)
    ( u  h1 T. A' R; I, e  skewness1 <- skewness(x)
    , L7 F  l; Q+ u* I& o1 ~6 v  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    % `$ Q+ ?' b8 {; Y( G5 E  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    " c/ x. [* D, C) c  return(answer)
    8 v0 v5 D/ A+ Y3 C1 \6 C}+ J/ h/ ?& z7 X# y* P8 r" D' ~- C: k

    % F2 ]7 N# [! t9 F& h  {6 l  It <- rt(100,2)2 z7 D- z7 H( Z3 |% e; ]! X
    stat(t)
    ; C" X0 `7 X: x, b
    & ~* `. S% w( h# o
    6 j( u, v; X4 J' u( {
    $ r/ W4 _- P5 g) Y$ T# h! {% [9 |
    # `: M1 z# c" H' m
    zan
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