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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    8 d4 [$ b& _" p0 U& b, J书籍:《R语言与数据挖掘》
    & M% r; P1 C: _9 h  t. u. C#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
    / c1 H- P6 W  B5 ], J% elibrary(reshape)  m$ d2 e( x- y9 b4 R% Y
    CO2
    + }* T- X# ~$ \4 s/ |CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    8 ^' s5 i0 _. s" j
    5 v2 f0 C' w* T7 \#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    ( ^9 T9 s- {; H; u/ @9 c- P- C> anyNA(CO2)
    / _/ ?4 g' a4 `% Q[1] FALSE2 R/ c- n( `9 m1 q% i* k
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    $ T- e* J: V1 G* O' f9 S& k7 u' c7 Y' c
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    + k: e) W. k: s/ E- j# d, o#篇幅问题删除部分输出数据
    - A/ _5 y- }/ J, {+ i7 |> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小6 Y2 j+ c$ ?4 \- B& }8 k  Y8 f
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    / v# u$ m3 y- v- Z0 ?[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    5 R2 _( m5 g' F8 a[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    ) N- R* [& _9 Z: d[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    & v( B1 ?# o! @' A. b7 k' v[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9  C" K" }3 m! ^" K
    > sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    6 ?+ K$ m! o8 s1 ]5 t- M [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    * Q2 {3 o) C8 X2 G( g4 d# t6 q[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    % V! i; i+ S3 h[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8# a/ u$ g- x$ I
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.91 L; ?3 z8 J# s/ h3 A
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    0 b5 i; Z% y% C4 M" B: o; A# b$ _& b( n" F
    > CO2[order(CO2$uptake),]( C; A/ g* i# ^. E/ M0 d
       Plant        Type      Treat conc uptake$ T& H. s: a( ]- o
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    ' S+ F' N% N) y- g! a/ g4 x29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.34 M& J  {' G* J  k! u/ a  L, n
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    9 Q) J( H8 G; }$ P  z, U43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    ) H5 [# T, p" ]78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    : r% y" B8 _+ w. s1 G* Y3 C57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    * N" X4 ?- S( B6 w3 v2 n( O; l& Q4 D4 i, N& K( X7 U
    > CO2[order(-CO2$uptake),]1 q8 P; s. i7 C2 @1 r! c9 k# z
       Plant        Type      Treat conc uptake
    4 z, X7 m2 P: t0 X+ i; ~; @4 Y8 H+ c21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5/ ]+ W" @! [& b$ N8 ~% |6 ^& V
    14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    " R' B- h/ o: T. j20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9$ ^2 }$ W( t1 d; W; G
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    2 k+ ]4 x; B/ k8 X  ~35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    4 p+ k  l! y. q3 i3 T( D8 o; S5 y- R: O! y) a& E
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4% O. h: ?' f' Q5 j6 P9 I: L
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))/ O, u0 E* T0 Q6 U( g2 h) L
    (sample1 <- CO2[n == 1,])
    + m) J# `- ~5 V; \1 o(sample2 <- CO2[n == 2,])
    0 |; C- n! A8 V+ b3 u( [2 X$ g  |
    ! @0 n0 m/ A2 q4 ?  _9 n" D#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值* l; M" I& v$ u# X  j! C8 s
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    2 `. o) [4 G9 {# i- g5 L$ p7 a, N, K  H: J8 Z7 s7 s
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值8 B; `" o' G5 V. Z( P
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
      Z+ V, P3 S/ R" t$ ^
    * s2 D6 E% ]3 F5 h6 m#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    5 `- s' Y; C& H0 a* |! Jlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
    2 ^5 S( [4 P( |3 U( q* X( v) N' ]
    : V4 b5 ~# m6 n& F" i. c4 ]#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中7 l' \+ e# \3 T- ]
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    8 F/ |$ R) k. m$ x, ?Plant_Qn
    2 I0 q. K( o. u' X( v2 u
    # m/ J1 C2 u. {+ n#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“! u# w6 W  L8 {4 s6 o
    ! u7 f# U* g0 W9 n' d, L
    5 }: m) ^8 _: l; ]4 O: Y
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度) _; q- p' R) W) T! g) a2 S
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    0 Q0 [( K+ s, f1 t2 ngsub("[t]","t",CO2$Plant)
    # T' I. q" g2 F2 X; r' d8 J" A9 Q
    library(fBasics)0 @$ [7 L, F' c( A7 F& E
    stat <- function(x)# x" C/ y. ~9 w% y+ g
    {1 c6 q( ?! o( j! j- ~
      if(!is.numeric(x))
    . H4 A, Z  d& n1 X  {
    # k$ R$ A3 P; B& r  z7 }/ w: {& O/ y    stop("the input data must be numeric!\n")
    2 K9 S" ~$ J% L9 A# c% o  }
    7 W! D' j+ F( l( Q+ n* o  if(length(x) == 1)' e3 G% x7 _) {0 c+ U3 p! W9 [: D0 ]
      {
    # f: q6 R8 t2 Y" m% f5 [- n    stop("can not compute sd for one number!\n"). Z" p6 |: P3 ^; u8 F3 m& C/ G+ E
      }
    ' ~4 E  [! k# k: G. {4 m/ M  max1 <- max(x)
    # o1 ]! h8 N5 N6 n# ?4 U" `( M  min1 <- min(x)
    - n8 e0 K' f& G6 Y+ p* z  mean1 <- mean(x)
    3 X( U* p( N6 n' I7 v  skewness1 <- skewness(x)
    & s4 X: X3 A7 A- @' j  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    2 Y- o% E2 e2 V8 O) e- }  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1): D$ O3 r) Z0 D% ^! F
      return(answer)
    : U, ~" R, D, s2 [/ l* u9 {/ E}
    ( R* l' ~' Q, d
    " u2 ~1 t4 x; B) C8 P6 Rt <- rt(100,2)
    3 E3 u  ^: z5 qstat(t)
    0 l) e+ c, w0 E/ G3 J/ k# G6 P& u/ s* c8 V$ L4 i. F! y; ]& [- o

    4 z4 V# P3 z# w4 z, k2 |( s* T# j) l8 T" z  U# `2 s/ a4 p' w: b+ K
    & G* l* p, W% Y: @
    zan
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