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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录1 Q; S. N& X' k9 A# O6 I* p
书籍:《R语言与数据挖掘》; q3 p) \' g' `3 @
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
7 l% e3 a5 h3 ` _. [* Glibrary(reshape)9 J# {8 [; r, t
CO2" J' G( O' R9 P/ H9 v* O9 G
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat")) A/ Q- n: c3 l- p" L; F
6 n: u2 b, w! }- l3 G7 Y
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行9 y; r0 k3 F+ L) X1 p. x$ ]
> anyNA(CO2)
$ X+ [2 @1 t- U. e1 G$ y: S4 `[1] FALSE
, E2 b$ v. Z4 v$ j2 H#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]" i6 V4 u5 [8 r7 M r4 m
' Q5 n* d) H; q& |) n# c' M( E4 t#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)1 w3 i) ?1 }' L0 \) A& b9 j
#篇幅问题删除部分输出数据
4 B) v" u) j0 `# b% P! z> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小/ g+ N# I, q: ~9 a0 @
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
g9 `+ y9 d1 T% y1 g& F: s1 m[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
+ E) }/ J- U. o. i[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.12 p/ L( N! R" r# g
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2. Q3 F: t( ?' V3 f$ P
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.97 Q8 ^2 A0 g/ i* N1 U# R
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)$ ]. b0 }+ W' S0 s5 k' |9 z5 X+ Z( n
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6# w; L0 @; d5 P+ {7 g8 U& z
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1" j% q& F0 N% J
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
3 J1 y: e( i# ` n[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9( ?+ h, u& o" T* W
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3- }8 ^$ ^2 z1 x8 |3 w! I G
6 B" L# n" t- y/ y' h6 H
> CO2[order(CO2$uptake),]* m( [ B9 q5 E* \) \$ e
Plant Type Treat conc uptake9 E- B4 e7 c" G' J5 m0 h6 W: |
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
. y* }. H/ A$ {0 W* Q& c( b1 j/ o29 Qc2 Quebec chilled 95 9.30 w% I) Y' c7 J% G- ^( \5 _( m
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
: P: r* m( x" w S43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6$ J. T) A: M' c! h
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
# F$ Z' }( d D9 _( m* r" q$ z, k57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3! Z# r! R b+ e( ^" x; z+ E
4 X; Y& s. ^" \0 w# D" `% Y
> CO2[order(-CO2$uptake),] p; N1 o$ f# X! x0 L; A9 [
Plant Type Treat conc uptake6 q- i$ H+ Z' O }4 @( b/ Y/ K K
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.53 e1 z3 O6 f4 j# @
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3( `1 H7 B( d* ?3 q
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
# U$ ?, X( z' q' w `19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
7 W9 L% v( h' V- F e35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
1 d( g* M/ O1 f8 j, o8 }( h. X. c' K0 G7 P, Q! ^
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
" y% Y: B$ M K# y& v1 mn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))1 ], I* R) \! B( D+ e- A
(sample1 <- CO2[n == 1,])
) _! Q& G. H& A, W; _; ~(sample2 <- CO2[n == 2,])" ]7 o2 J) |9 E) w( t
, ~$ }* ~& a! e4 v#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
! g& {! U/ Z) [* @tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)) J1 {- F* w6 D% }$ ]+ I
8 y4 M8 P3 N( M$ s#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
3 j- F; z1 b4 C9 C; T0 j9 X5 j1 kaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
. ^4 @& o1 ?5 W) r8 S& F/ u: N( _# M0 k
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
5 ^& Q( Z3 k; z; F9 S: B2 j; Clapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)9 P$ m/ H! O" b9 z; a/ Z/ x
; s" B8 G/ \. L* q
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
- w( M. A4 c5 F3 k& b h* FPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
3 e- @1 ~2 X9 R) f& D APlant_Qn# v* \" c" Y* n, m( Y# \/ b
0 F" D' d0 H) J#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“, {6 O/ J7 m# t
/ m' g: ^6 N0 A) b* A9 a# @/ O+ m
7 {( E- o" e$ k! v' K
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
+ | P3 z* k2 j3 ^9 B% C#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……7 \* b5 Y. y3 p. i) e+ U
gsub("[t]","t",CO2$Plant)
' D1 A# k2 ^: T2 ~) z" J8 s% b2 r0 @- K3 ]; ]- B' Y7 Q/ |# A
library(fBasics)
! u9 f( |! R- D7 Mstat <- function(x)
/ R2 T9 t$ ]& i9 e{6 p8 t$ y1 h% y
if(!is.numeric(x))
/ j/ e6 X9 b, L# J- h: }, v {
) ?1 a+ D& j; r( \0 Q; k1 L% l/ p stop("the input data must be numeric!\n")1 ~9 M, t& y% U5 `) {; N
}
0 D1 C" s: y* p' I if(length(x) == 1)
m) l# ?0 J3 I* y) f- J {
+ }: s P8 K% \6 | stop("can not compute sd for one number!\n")
0 L W& s) H6 P! W' W: `$ g }
8 x' R4 b* ?' S9 X) v max1 <- max(x)4 F7 o: b* \) E0 U
min1 <- min(x)8 W8 g1 B9 L. I; X5 H7 A
mean1 <- mean(x)
, ]" G+ J/ I% M# c. e skewness1 <- skewness(x)
4 k: e" e* N. A kurtosis1 <- kurtosis(x)
3 h9 N( u. l( K! ~5 I% Y1 e5 `# x answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
0 q+ X' p3 a1 S5 M* `" u" z% p return(answer)$ `" O0 R+ n% b( a, d
}2 l: X- [. O: i+ p
8 |" e8 }! c( E2 l! F
t <- rt(100,2)
2 h' |3 N5 m6 g$ ~) L( B, Wstat(t)
0 J' u/ C7 Z6 E
7 ~& Q* O# |# l Z, u( l6 y0 b( F; y$ s& M2 E2 Z( C
! b( [+ T( o' t" ~" W+ R A: ? @4 {- ^3 B. s
|
zan
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