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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
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    function main()
    8 {8 P6 P5 [% h1 ^%*************主成份分析************3 u' s% Z7 Q* F: _
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    %see also
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    %读入文件数据
    3 U8 z" i0 M6 v; R0 p+ W7 }  TX=load('data.txt');
    ( q. `* J; Q: `( \- N2 O6 z2 e%==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================
    * F5 ]/ V/ I* Y2 x%标准化处理$ z( B/ h3 `/ P( z7 |* w; c/ k
    [p,n]=size(X);
    - W) Q: y  X# `: R% dfor j=1:n5 D- s$ E: o9 t% e3 a/ `
        mju(j)=mean(X(:,j));" s8 e. F- z- h6 {$ J8 A
        sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));/ F7 s$ F& J% e+ n5 r
    end
    0 R% T' Z; z& Bfor i=1:p+ N/ W7 N# _; P4 }0 ]+ {4 q
        for j=1:n
    ' I( \) X: _/ |4 M# Z        Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j); 6 S' \5 i0 o7 L
        end) s* [9 Z+ Q% @; C; ?: K
    end" N/ R2 [' @& x2 o1 c" a# ^* X
    sigmaY=cov(Y);
    + t, x0 t! k- z5 a0 {' X%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量- P9 M6 M8 y: ~8 o7 m. Z& p' `& `5 A( u
    [T,lambda]=eig(sigmaY);
    , B; x0 l. t2 w0 Z' d/ adisp('特征根(由小到大):');
    , R8 n+ K3 I8 o3 B3 |disp(lambda);
    5 x$ ]# ^% ^- C1 idisp('特征向量:');* @9 c4 u2 s4 i% h( U6 {
    disp(T);! T& h5 j2 M2 M0 _9 O
    %方差贡献率;累计方差贡献率' \) O& |1 Y; K, ~8 E
    Xsum=sum(sum(lambda,2),1);0 w' H! f3 I9 j) T. p
    for i=1:n
    9 y8 J+ p  z$ i! _. _' q* S# b    fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;
    3 M" Y' v" |1 S" B" n: \end+ s% l( D, I) S
    for i=1:n$ l% a5 I  ]8 i: D7 Y
        psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    ; g4 W! o: z5 M$ ]0 X9 h2 u4 d; Tend
    - j) O, d& m3 D5 s3 L; @! b4 zdisp('方差贡献率:');0 i0 o: A/ i8 \1 h; I
    disp(fai);
    : m& M' c7 t' Q) E6 edisp('累计方差贡献率:');
    + E6 X) s: Z# S% A# _, ?8 q" ?2 Jdisp(psai);
    / N. F. B7 q: E8 _4 q4 \" e%综合评价....略% z; e& f+ Z8 G0 i! U' o* n) v1 o# m

    6 V& ]$ L/ Z4 g) L3 N
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