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TA的每日心情 | 开心 2021-8-11 17:59 |
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签到天数: 17 天 [LV.4]偶尔看看III 网络挑战赛参赛者 网络挑战赛参赛者 - 自我介绍
- 本人女,毕业于内蒙古科技大学,担任文职专业,毕业专业英语。
 群组: 2018美赛大象算法课程 群组: 2018美赛护航培训课程 群组: 2019年 数学中国站长建 群组: 2019年数据分析师课程 群组: 2018年大象老师国赛优 |
基于Python实现的遗传算法求TSP问题遗传算法求TSP问题
* _3 o0 n% W8 {3 J目录$ w. u. k9 v) j4 |
人工智能第四次实验报告 1) J. L0 m$ S+ Z
遗传算法求TSP问题 1! o H, {# c) |; J
一 、问题背景 1
+ [7 Y# k6 q- n C! a& G/ X1.1 遗传算法简介 1
* v, O: L- U# y! g& M I1.2 遗传算法基本要素 2! |- f; O" h# Z1 {& z
1.3 遗传算法一般步骤 2. U2 M1 W4 o' ^ a3 l
二 、程序说明 38 p% W# Z9 f0 w/ v% ]
2.3 选择初始群体 4
1 o* q; P0 A- R- E& V9 p I7 ?% V2.4 适应度函数 44 B8 r; W4 f. V$ L% ]% z& {
2.5 遗传操作 4) R! {7 h, t9 H) _) }2 Q$ i
2.6 迭代过程 4
6 K' M, N; R6 C( X0 k! z. j三 、程序测试 5
9 ~5 k. J; {% ~3.1 求解不同规模的TSP问题的算法性能 5: c/ C' [- Z" Z% h- Q% V4 z/ G0 Z
3.2 种群规模对算法结果的影响 5& K3 O7 G4 n" [5 ]# `7 J' m+ J$ ?7 b2 s
3.3 交叉概率对算法结果的影响 6/ N' j1 ?0 x7 r1 J+ e1 B
3.4 变异概率对算法结果的影响 7
5 Z$ R! }4 t. G0 G" }8 |2 z3.5 交叉概率和变异概率对算法结果的影响 7! D9 j/ a1 V8 k9 O
四 、算法改进 8" n% l0 q6 a4 Y H
4.1 块逆转变异策略 80 B# a- _( e# V' H Z1 x* [
4.2 锦标赛选择法 9
0 m' S; q- n4 l; V' b五 、实验总结 102 F, ?4 d3 H6 l; g$ |5 D
一 、问题背景1 y* m: I/ ^0 E) I
1.1遗传算法简介/ G% v, ]) E. W8 E2 D
遗传算法是一种进化算法,基于自然选择和生物遗传等生物进化机制的一种搜索算法,其通过选 择、重组和变异三种操作实现优化问题的求解。它的本质是从原问题的一组解出发改进到另一组较好的 解,再从这组改进的解出发进一步改进。在搜索过程中,它利用结构和随机的信息,是满足目标的决策 获得最大的生存可能,是一种概率型算法。" w! D, H3 ]7 ]9 n1 |% F C# l
遗传算法主要借用生物中“适者生存”的原则,在遗传算法中,染色体对应的是数据或数组,通常由 一维的串结构数据来表示。串上的各个位置对应一个基因座,而各个位置上所取的值对等位基因。遗传 算法处理的是基因型个体,一定数量的个体组成了群体。群体的规模就是个体的数目。不同个体对环境 的适应度不同,适应度打的个体被选择进行遗传操作产生新个体。本文转载自http://www.biyezuopin.vip/onews.asp?id=16719每次选择两个染色体进行产生一组新 染色体,染色体也可能发生变异,得到下一代群体。) U V" o) j7 I" G* Q
1.2遗传算法基本要素# J; t' ~7 P* n3 K' _
1.参数编码:可以采用位串编码、实数编码、多参数级联编码等5 \! N7 y& X9 x! c
2.设定初始群体:8 P, d1 r# q" p, |% p7 Y
1.启发 / 非启发给定一组解作为初始群体
$ Q- a# K2 @- J2.确定初始群体的规模
1 w7 g2 r0 R: a; }6 w6 a" q0 s3.设定适应度函数:将目标函数映射为适应度函数,可以进行尺度变换来保证非负、归一等特性0 K7 V- p+ ]' _9 Y, \
4.设定遗传操作:1 M5 X/ x2 ~ V
1.选择:从当前群体选出一系列优良个体,让他们产生后代个体9 q* C8 [% J _3 G9 j+ F, |
2.交叉:两个个体的基因进行交叉重组来获得新个体/ b1 F2 g+ N/ o! K+ Q
3.变异:随机变动个体串基因座上的某些基因4 [0 Y$ C# f# W9 n H5 A
5.设定控制参数:例如变异概率、交叉程度、迭代上限等。
7 X- Y4 f* z& N) @9 `1 c' f$ S% C7 Z. J
import numpy as np
# b/ O5 B% ^' e& f( m$ T; limport random
; b0 P) M- _7 ^; d( nimport matplotlib.pyplot as plt
6 I$ g" K8 r& Q1 Ximport copy
! w' Z* R- [* |( i! T* iimport time
7 `9 c$ f8 b" F0 t; G
* a/ a7 S. I1 F3 a6 |* efrom matplotlib.ticker import MultipleLocator6 V7 Z+ k- ` p( e6 L; Z
from scipy.interpolate import interpolate
f- d( @& f# ?6 G7 Q8 b( M$ N9 ]. K/ e' d# W' q/ P
CITY_NUM = 20% ?% _/ X2 N# c0 r7 l0 s
City_Map = 100 * np.random.rand(CITY_NUM, 2)
* U( a; p# T, w5 I1 U! U+ Z. f6 u# [& d4 {3 O
DNA_SIZE = CITY_NUM #编码长度" m f! M3 A2 }8 E6 \( d0 N
POP_SIZE = 100 #种群大小! |( t9 `% ]0 j$ q$ P+ q) U
CROSS_RATE = 0.6 #交叉率
$ b3 K: E) q# a. d# E4 j* h8 RMUTA_RATE = 0.2 #变异率 C4 n! {0 u! Q1 V9 ~! i2 X' `
Iterations = 1000 #迭代次数, j$ S8 d- ?" X. F2 u+ Q' `
% I0 s# i) _4 P1 c$ O7 P# 根据DNA的路线计算距离
! E5 d" T" b5 x! k9 e/ j" F) Y ldef distance(DNA):1 s0 j, J: U% Q
dis = 09 v2 n- J0 i) P$ g5 c
temp = City_Map[DNA[0]]
# e i: y0 j$ k6 A, J# w. A2 B. L7 D for i in DNA[1:]:- z9 Z$ D3 c: r! h$ Y' ?
dis = dis + ((City_Map[0]-temp[0])**2+(City_Map[1]-temp[1])**2)**0.5% j. j) O+ _2 v0 e
temp = City_Map
: y' D2 T* N- q4 A8 V" O: N- v return dis+((temp[0]-City_Map[DNA[0]][0])**2+(temp[1]-City_Map[DNA[0]][1])**2)**0.5; o2 n1 e, f1 m) Z' E
8 [" ~' {) c3 m# | u I
# 计算种群适应度,这里适应度用距离的倒数表示
( G7 x+ T/ x: k3 U {2 o( Zdef getfitness(pop):
9 s+ [( s7 C. X- x2 u; @8 O# Y } temp = []4 p( q* D+ d' K$ b
for i in range(len(pop)):1 V4 l2 i9 e% z+ _- R
temp.append(1/(distance(pop))); E" P7 E( I1 W# \4 C, R2 r# J
return temp-np.min(temp) + 0.000001
9 D0 p- ?, T; j% w5 l9 c: Z* { h4 `. p. J% o. Y5 y: w
# 选择:根据适应度选择,以赌轮盘的形式,适应度越大的个体被选中的概率越大9 ?# {5 c% C6 X( `: p# A% n Z
def select(pop, fitness):/ O7 v5 X$ u8 F# B' r
s = fitness.sum()
, P2 _& p$ {; {, V% y% I" T temp = np.random.choice(np.arange(len(pop)), size=POP_SIZE, replace=True,p=(fitness/s))) g) [0 r! g R& G
p = []3 n% L2 F1 Q( X: t
for i in temp:3 a! ~& |6 V6 L2 }! b
p.append(pop)
7 D- `0 Y' }6 ~! h7 r return p
( {8 o5 ~, h9 e8 }- D
3 ]/ [% d, M, Y. Y* Q& g+ x# 4.2 选择:锦标赛选择法$ o4 S4 Q' {4 o y1 ^7 V7 Y" W& `
def selectII(pop, fitness):
$ \5 [. _+ m% B# w p = []8 U% T. T4 Z8 t! H# Z4 X& E5 i
for i in range(POP_SIZE):
5 s+ r: B, o. h# P temp1 = np.random.randint(POP_SIZE)$ p1 j- ^6 ]- F
temp2 = np.random.randint(POP_SIZE)
$ E$ x0 M/ d; |# O+ H$ _1 P# B DNA1 = pop[temp1]
, Q# G. o+ u, o ]. b8 z$ z/ } DNA2 = pop[temp2]$ R5 R# S9 @, d% Z
if fitness[temp1] > fitness[temp2]:
) F% A' @; n$ I p.append(DNA1)' f/ t. ^& f" t2 O; J: I9 z8 e3 T
else:( v$ i/ @1 F ~' N6 ?. P/ J
p.append(DNA2)
+ M V# J; ?, ^% g return p: ~4 J) I1 K/ r: S ~3 X# i) r& D
4 ?" O, d8 }. e+ a+ g
# 变异:选择两个位置互换其中的城市编号
8 b3 o- V3 j$ ]& F! Zdef mutation(DNA, MUTA_RATE):
3 R0 S& i6 x* Z9 U, F! M5 M, s* ` if np.random.rand() < MUTA_RATE: # 以MUTA_RATE的概率进行变异, }, \ @) h2 j0 E5 m" f; L
# 随机产生两个实数,代表要变异基因的位置,确保两个位置不同,将2个所选位置进行互换
' H3 a! N7 t9 G i mutate_point1 = np.random.randint(0, DNA_SIZE)* i# h2 e, j' y: C+ P4 J6 w1 K
mutate_point2 = np.random.randint(0,DNA_SIZE)( v4 o7 f7 O5 T; a
while(mutate_point1 == mutate_point2):
8 S! |: h$ I- s8 r/ W. ^ q0 f7 j mutate_point2 = np.random.randint(0,DNA_SIZE)& S) n3 T; u+ Z4 o/ z
DNA[mutate_point1],DNA[mutate_point2] = DNA[mutate_point2],DNA[mutate_point1]6 Z- P# s; U" i# U' v, D J5 _
# V/ h5 ]+ I L2 E1 i$ _
# 4.1 变异:在父代中随机选择两个点,然后反转之间的部分
2 r: Q' D, {0 j$ @% g5 \7 C9 `5 gdef mutationII(DNA, MUTA_RATE):. K( F3 P, R( _ z+ P+ ?
if np.random.rand() < MUTA_RATE:5 i% h+ R- b8 J; s# m+ V5 J
mutate_point1 = np.random.randint(0, DNA_SIZE)
+ A" R1 T& Q( K! M- Y# A mutate_point2 = np.random.randint(0, DNA_SIZE)# [7 x. u* Q( h3 _ O( o
while (mutate_point1 == mutate_point2):
- w% w$ I6 B( o' N mutate_point2 = np.random.randint(0, DNA_SIZE)- G% M4 `8 k+ F9 C
if(mutate_point1 > mutate_point2):
8 a6 Y: [5 H* x P8 k3 k5 ^ mutate_point1, mutate_point2 = mutate_point2, mutate_point18 _3 I: k& \3 _; x
DNA[mutate_point1:mutate_point2].reverse()+ `' Q, ^/ c s6 v8 O" H6 S
$ f! ]* z* E! t) i) B
# 4.1 变异:调用 I 和 II$ V" [. y2 ~/ G g* R; D
def mutationIII(DNA, MUTA_RATE):
8 k+ A7 e" i% h" h, K- D1 [5 J mutationII(DNA, MUTA_RATE)
1 C) U# o) j" I+ R0 X5 Y8 M: ~' j mutation(DNA, MUTA_RATE)
# b0 a$ a6 L1 y+ Z# C; {
, I$ Z3 h$ _' \6 U7 N6 {# 交叉变异3 @8 ]( D/ Z8 h- _- p" W6 j3 ~
# muta = 1时变异调用 mutation;
( \$ E7 K& ^* Q+ n5 @8 j7 ?# muta = 2时变异调用 mutationII;8 s! n7 H6 H& }% C$ f4 y' h, M
# muta = 3时变异调用 mutationIII
. S H- B0 s$ Z4 ?0 S ydef crossmuta(pop, CROSS_RATE, muta=1):
+ O" t+ s8 ]9 x3 } new_pop = []
+ V& i: l2 v* P4 O for i in range(len(pop)): # 遍历种群中的每一个个体,将该个体作为父代" j1 J+ M) l6 ?
n = np.random.rand(), _% @, X8 B9 r0 o5 z! P% {
if n >= CROSS_RATE: # 大于交叉概率时不发生变异,该子代直接进入下一代- A0 P2 X. Z3 h) Z3 N3 B$ x! E
temp = pop.copy()
7 O3 d" r( W3 B: f& a6 Y new_pop.append(temp)
$ \! g9 Y$ E" R O. i% s # 小于交叉概率时发生变异
1 d+ U9 ~9 a, |8 J/ q7 c if n < CROSS_RATE:
/ r" E4 O0 m( C& U8 _9 j # 选取种群中另一个个体进行交叉* ?6 u7 m2 q2 f( d9 w" {) R! w( S$ }
list1 = pop.copy()3 O" L3 O1 z! y& L$ B$ k
list2 = pop[np.random.randint(POP_SIZE)].copy()8 s c; u7 u- e
status = True& [1 ~6 ]8 T: o+ q# Z$ z' P
# 产生2个不相等的节点,中间部分作为交叉段,采用部分匹配交叉
* M6 ]: E7 I4 m+ { while status:
$ O9 U% t( z( J" Q- _. k k1 = random.randint(0, len(list1) - 1)
$ x4 U3 W" [' }2 |) }; x$ y k2 = random.randint(0, len(list2) - 1)
% A! G4 I8 @, D' N. z7 R# G if k1 < k2:6 Q$ C. ^) d+ J, B2 X
status = False2 M4 ~ Q7 h+ l! W3 Z/ u& U6 m4 z
1 `' v) ]4 ]3 V& r k11 = k1
# L' p* N" X: _( Z( ]
; U( ^) E2 j* N. S # 两个DNA中待交叉的片段
; }$ g3 K! |6 S* P fragment1 = list1[k1: k2]
9 F" s. C$ e7 x- _" H8 s fragment2 = list2[k1: k2]
, W, j- P; }# u% q( n7 }
1 s$ s( m% w& h- H # 交换片段后的DNA
3 t v* w& y& l& q3 o% X% q: k list1[k1: k2] = fragment2
# ^; A9 Z+ F( u. @+ y0 c a list2[k1: k2] = fragment1
; ?; |, y! v. K5 O9 V6 D
. g e. l ~+ M+ I3 G # left1就是 list1除去交叉片段后剩下的DNA片段
- a: D% G% C/ u# `* |6 Y del list1[k1: k2]. F5 n. {3 F* t
left1 = list1
v3 Z0 t7 s. Y9 s2 v$ R4 w; u8 {0 {- o) f1 M3 l/ H" V: x
offspring1 = []1 i" Y6 U# \8 h% O
for pos in left1:
6 Z4 ^' B# ]: N5 d # 如果 left1 中有与待插入的新片段相同的城市编号
2 M: b* l. Z- N" h/ m1 A2 f if pos in fragment2:
" G1 ]& u5 _$ q' @3 k, v3 w5 J \ # 找出这个相同的城市编号在在原DNA同位置编号的位置的城市编号
5 v; [5 W; s; U3 {6 \$ \* O* u # 循环查找,直至这个城市编号不再待插入的片段中
3 t% ?, n( }- }! L pos = fragment1[fragment2.index(pos)]
6 g" e- e' M( K* z$ t; V while pos in fragment2:
: N* g. I( N; S4 h! {# A pos = fragment1[fragment2.index(pos)]
$ w; \& P% t: R" v* b/ T4 Y; @ # 修改原DNA片段中该位置的城市编号为这个新城市编号* S" P) \( U7 b) Q* l
offspring1.append(pos)4 ] I8 o. y1 m$ | n) ]
continue
9 M& z! D$ A' d% b/ e( A& k- h offspring1.append(pos)
/ J& ?3 u, M0 a0 O3 E% O for i in range(0, len(fragment2)):
) b' W' Z6 i9 }- \ I offspring1.insert(k11, fragment2)
' ~1 Z6 _: U* R k11 += 10 F+ b& U W; V( W( g' {: k- v
temp = offspring1.copy()
: Z7 _9 e8 j5 G # 根据 type 的值选择一种变异策略5 H% l* i1 _' U+ F% D1 P
if muta == 1:4 ]) s: B9 X+ v8 {
mutation(temp, MUTA_RATE)! m4 V; h* x2 t$ t9 i, e* t
elif muta == 2:4 y5 q- B# T# K5 I6 ~6 h- y
mutationII(temp, MUTA_RATE)
8 [% n; b# [) M: m- |! b elif muta == 3:4 z. G ^' Z# V- t( e
mutationIII(temp, MUTA_RATE)7 o9 b5 Y- ?" U, l: n
# 把部分匹配交叉后形成的合法个体加入到下一代种群2 W" V7 j. z2 X9 ~7 h6 w
new_pop.append(temp)/ b' e9 U- V6 S$ W
1 t+ r0 _, w& V) i, w
return new_pop$ Z4 F$ x3 g! O2 ~7 E1 o
2 B" I* I: N/ c. ddef print_info(pop):
9 e' S! k2 k' a! e" R- ]2 r3 f8 @ fitness = getfitness(pop)
) ?; {+ E5 x$ J, r6 m maxfitness = np.argmax(fitness) # 得到种群中最大适应度个体的索引
( S+ e0 k* n' r$ n' e+ q! P# o print("最优的基因型:", pop[maxfitness])
1 G9 a& i' |- g1 `8 f# {2 R2 D7 C print("最短距离:",distance(pop[maxfitness]))7 v( ]) z+ `" e2 A
# 按最优结果顺序把地图上的点加入到best_map列表中
# z% v' |7 N, b best_map = []1 v" \9 y, U+ ]
for i in pop[maxfitness]:
3 P8 Z* U4 D5 y* x0 M+ G0 g4 b+ ` best_map.append(City_Map)
! [& t; y e0 D8 f% O: }0 f% } best_map.append(City_Map[pop[maxfitness][0]])' U6 o0 T0 `/ C' V* C, n
X = np.array((best_map))[:,0]* I* H+ H l6 [% N! S5 n+ z
Y = np.array((best_map))[:,1]
* C% e A* ~8 l. Q3 I # 绘制地图以及路线& e+ \: a( z3 g4 o
plt.figure(); v. m8 o, K. N0 U8 f. U' C
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']( r9 t" J: V+ q- b8 A' d) y
plt.scatter(X,Y)
* k& L! t2 B! `; D# G6 l: Y: j for dot in range(len(X)-1):
. U* k X( m# d( c+ l" y$ w plt.annotate(pop[maxfitness][dot],xy=(X[dot],Y[dot]),xytext = (X[dot],Y[dot]))
$ H+ S8 m7 h" t& W, e$ t4 f plt.annotate('start',xy=(X[0],Y[0]),xytext = (X[0]+1,Y[0]))
; X4 z( A; R% W7 u( | plt.plot(X,Y)
' _- }7 N5 s3 l3 b& Q5 J G7 d& C6 K' @* K
# 3.2 种群规模对算法结果的影响
9 U( {# P1 c0 j+ g& S$ @def pop_size_test():
G$ K! V& Y4 K global POP_SIZE
$ y* `2 q9 s3 V2 x ITE = 3 # 每个值测试多次求平均数以降低随机误差
0 ~6 i5 K. }6 N3 s& T i_list = [10, 50, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000]
* x; u/ J; c1 F9 I8 a# s b_list = []+ m- C$ B, ^! h( Z. D4 ]1 K
t_list = []
5 [0 d. D! l0 I& h9 o for i in i_list:- f" x' M5 L2 U# l- A7 i
print(i)" X: m% B3 F0 L1 ]: C- ^
POP_SIZE = i. p$ F5 E# b( x* |, @; [5 Z# j3 S( g9 `
time_cost = 0
: V( \0 q2 r# ~# C# r/ Q; g, G' l min_path = 0. |$ n& v: n, \
for j in range(ITE):3 S! f7 B$ [# a6 C3 T" u7 |
time_start = time.time()
, U$ I. O K5 b% v ans = tsp_solve()0 p5 g+ z; f, ?9 N. q9 M4 O9 t
min_path += min(ans)
( G- v7 O+ u9 i( m" ~9 ]. {" H time_end = time.time()
! M# v6 K! i- e* J" S time_cost += time_end - time_start
0 _8 W l( \# u- [+ p7 z
& ~, g ]# ^/ g5 @% L b_list.append(min_path / ITE)
; L: ]+ s! R. S% ~* d+ I% ] t_list.append(time_cost / ITE)
! x; q( T m/ N7 p* y show_test_result(i_list, b_list, t_list, "POP_SIZE")
6 e3 A& \+ v+ o: B: H6 Q; _0 z, F1 V% ~1 j2 a8 u
# 3.3 交叉概率对算法结果的影响
- t7 `. a+ G% u2 \: G' mdef cross_rate_test():% Q6 ?& `( e! P* p7 J" P
global CROSS_RATE
, ?, B5 R5 [. a/ k( E ~1 J2 q ITE = 3 # 每个值测试多次求平均数以降低随机误差# u) T% n6 k" h+ Z
i_list = range(0, 21)
( J7 H3 }+ e% q b_list = []
: P, B: n) f0 R8 H1 H t_list = []$ S2 y0 r/ R- O! R
ii_list = [] # [0, 0.05, 0.1, ... 0.95, 1]
6 b6 @; \& O" } for i in i_list:
* S7 V! T! m, [+ M9 v) l) W print(i). ^% P4 ?7 q8 a2 G f ^
CROSS_RATE = 0.05 * i
/ @; a* o }9 N' M* ?" U) n ii_list.append(CROSS_RATE)
1 a' I" ?' c9 C! ^2 _; x9 [ time_cost = 01 p/ D( E2 a* |2 K: K9 W* }
min_path = 0
% J# L6 S; \3 v7 \' [& D for j in range(ITE):
2 ^$ Y( Q5 c0 ^% h time_start = time.time()
R+ e0 r; c9 l6 x; F# Y8 r ans = tsp_solve()
- P$ @8 p! v1 x% t' v4 J- y/ l min_path += min(ans)( v0 K$ d8 Y5 W- A, L1 ~7 z ^
time_end = time.time()# y- u9 b4 I9 ~* m
time_cost += time_end - time_start$ L( G" u! U1 W7 r( o
# D: Q5 L2 E9 w
b_list.append(min_path / ITE)8 U5 X; D+ r4 \6 ~4 L8 i# k
t_list.append(time_cost / ITE)
5 a8 S$ `! e% z& p9 E show_test_result(ii_list, b_list, t_list, "CROSS_RATE")* c( \) G+ m7 K. Q
/ {; N) J' _( J
# 3.4 变异概率对算法结果的影响
6 |& R- F5 l- y$ r, ]def muta_rate_test():$ @2 b9 ]/ e. ?0 Q$ y5 G- h. @
global MUTA_RATE5 u. N$ q) A4 w, N
ITE = 3 # 每个值测试多次求平均数以降低随机误差: Q7 R! Y" @1 |: D) w; m
i_list = range(0, 21)4 G8 L; D* w6 I
b_list = []
3 o+ A4 Q4 ]: _6 l t_list = []
& f4 b6 d" ^7 ?0 Z1 D ii_list = [] # [0, 0.05, 0.1, ... 0.95, 1]- R" O1 |$ a0 H! s
for i in i_list:
! Z. h# y1 N& ^, x3 J5 ] print(i)2 E! D$ X, C7 |
MUTA_RATE = 0.05 * i
G# H+ O6 {* T ii_list.append(MUTA_RATE)
1 {/ R9 x" n9 }4 A time_cost = 01 q3 y& x C/ q
min_path = 0
2 @8 w* T# g. h, p; ?2 k3 M for j in range(ITE):1 K, H$ T6 |; ~" n: j m
time_start = time.time()
% u7 V' o$ _' ]* D, _! O ans = tsp_solve()
" c: X5 a! _) B j min_path += min(ans)
L! K+ y% }0 h" | time_end = time.time()
* b. C6 v' a: o/ y time_cost += time_end - time_start& c& _8 s; ` K3 w8 K& A4 M: V' L
; C* _" \. ]2 l3 r L. d, v b_list.append(min_path / ITE)
- J/ u8 M7 _1 z' k: j t_list.append(time_cost / ITE)/ ^ k* Q' Y# V0 \; y
show_test_result(ii_list, b_list, t_list, "MUTA_RATE")
' A* M8 [! R) q
/ b$ t/ g4 r, `! z# 3.5 交叉概率和变异概率对算法结果的影响
4 z) s5 t5 U/ V1 t, R8 a& f% B+ bdef cross_muta_test():
/ w7 w1 \$ h* z s = np.array([0, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1.0])
$ b8 y1 o, m. P8 O$ H9 c5 T0 M' b X, Y = np.meshgrid(s,s). z0 j4 d' h" y" ^& A
Z = np.zeros(shape=(11, 11))1 F ^8 W( b9 F
, k) ]) y+ v' T- n
global MUTA_RATE
+ d$ R. C1 ]: Q% S3 C2 C- H. a global CROSS_RATE$ ^0 i' J* z6 K0 C
for i in range(11):
( T! t! G2 O4 R _: Z for j in range(11):2 A5 k- r& X$ f1 y) |
print(str(i) + ":" + str(j))( [( k7 E @8 ?/ P5 p
CROSS_RATE = X[0,i]
; t" \- A+ {8 d9 u1 [* z: Q( I MUTA_RATE = Y[0,j]
- m/ [* G9 G1 b/ B ans = tsp_solve()
* n! K0 [ O9 Q% q' h" E" r6 y Z[i, j] = min(ans)
: t7 i+ B1 E+ G5 A
; |% T% o1 Z: ] A ax = plt.axes(projection='3d')& Y# g# n$ d- k, h3 @) l) V% ^
ax.plot_surface(X, Y, Z, rstride=1, cstride=1,cmap='rainbow', edgecolor='none')
" {* u4 k, o( P3 j ax.set_xlabel("CROSS_RATE")$ L. _) a; C X' k( ?: g& O
ax.set_ylabel("MUTA_RATE")# G* |5 ~/ w; A$ y9 N
ax.set_zlabel("Shortest_Path")
. w. e# e3 B, s X. C4 S2 s ax.set_title('TSP')# M* ?4 {- r% S1 b# o
plt.show()# U2 D. m9 w: {
0 m& S4 r' r3 J6 L7 h3 M# 3.2-3.4 生成参数测试结果的可视化图表; X Q9 q* p9 W
def show_test_result(i_list, b_list, t_list, msg):
) `: L7 i' F1 ]0 U6 C ax1 = plt.subplot(121)
! F& C+ v1 x7 y4 A1 W6 i# b ax1.plot(i_list, b_list, 'b')! [) ^/ }$ O$ a+ S0 t+ b; w1 I
ax1.set_xlabel(msg)
, U) L, r5 }! p, J ax1.set_ylabel("Shortest Path")! i) f- S6 J" _: l0 T9 |& d( T
: p- D1 t% J9 D6 W ax2 = plt.subplot(122)6 M! W0 o: ^# V1 S5 R
ax2.plot(i_list, t_list, 'r')% R H& H+ U4 s7 z3 W
ax2.set_xlabel(msg)' i; j" I" s; d W0 Q/ K! a @2 i ^3 m
ax2.set_ylabel("Cost Time")+ J& z, O+ W. M+ g
plt.show()
. W4 W5 s$ \! q4 a* m" M: w! ^# e% j$ y \/ v6 O" A4 |! R
# 求解TSP问题并返回最大值3 Q2 o, T6 H7 H5 h, N A3 t
# muta 指定变异方式,sel 指定选择方式: D( j9 H2 {! E0 C5 g5 o* @+ ?
def tsp_solve(muta=1, sel=1):
, \, y# [7 b8 a9 S, ~9 y [ pop = []* ^9 ?! W( V) _ m
li = list(range(DNA_SIZE))
! O- |! l# @/ ^" N8 ~9 x for i in range(POP_SIZE):2 H& U( S) x/ F4 i; X
random.shuffle(li)8 u- ^+ }% k2 u0 q
l = li.copy()
. y2 s4 e# _. E. @6 P6 a/ t% ]3 v pop.append(l)7 c& b9 }9 u4 E! d/ m0 Z
best_dis = []1 J- n' L& F. t9 Q3 l$ ?+ C# q
# 进行选择,交叉,变异,并把每代的最优个体保存在best_dis中
# S6 F$ ~7 j( v for i in range(Iterations): # 迭代N代9 S/ c% ` w) |$ }1 B
pop = crossmuta(pop, CROSS_RATE, muta=muta)
8 u; E5 A( u3 h fitness = getfitness(pop)
$ @) `0 h7 f: c6 ]9 Z6 R4 g maxfitness = np.argmax(fitness); N2 N& }. W# x% H9 v, D
best_dis.append(distance(pop[maxfitness]))/ t/ ]% E1 T e6 x2 F8 G
if sel == 1:7 n5 r' @6 ]0 M) S, z0 S
pop = select(pop, fitness) # 选择生成新的种群
' j$ y6 h. u. x( D1 j elif sel == 2:
( r: {* e8 W: u+ p, Z1 l pop = selectII(pop, fitness) # 选择生成新的种群
4 w' T6 K1 e0 [" Z# y: `+ s$ T/ e- q6 p G
return best_dis( c) J( C: t, [0 Q; p& o; s
& O4 X, z# G1 q6 X$ o( a# 4.1 块逆转变异策略对比测试- C- `5 ]2 Z. C& u" p
def opt1_test():3 h' ]" k# N' V0 {; w* a3 U( z
ITE = 20 # 测试次数, U5 L4 F, E/ n: M1 E3 A" V/ l# E
i_list = range(ITE)
8 k0 [4 x) w* t- T b_list = [] # 每次求出的最短路径# Z6 H2 g6 \5 l
t_list = [] # 每次求解的耗时$ \* ]6 A2 `. O y. W( f5 b- ^
b_listII = []
. L3 ^0 I @# U t_listII = []
) [9 H4 C4 b4 ^' U b_listIII = []
; H8 ^1 T8 R D: G% Z" G3 p% P* b5 e t_listIII = []
4 E9 P( l, t& a f, F) ?. S- C/ W c) I+ M3 B9 A
for i in i_list:
7 @' i S5 `4 T6 Y4 @3 _ print(i)
" [1 Y O8 z- T; r # I. 原两点互换异策略1 P; _0 S2 ^: B0 I- a6 _" x
time_start = time.time()
4 f$ |# p9 G3 w t" a b_list.append(min(tsp_solve(muta=1)))3 d4 ]( Q# J7 Y/ q; o
time_end = time.time()% m# t, w( g9 I5 [- ^( E
t_list.append(time_end - time_start)
; z, G# ~: {; w! e5 Z* ^, I9 v( n # II. 块逆转变异策略9 C( U" {3 v' K$ U
time_startII = time.time()1 }% }6 ^4 G/ L5 @2 Z$ h
b_listII.append(min(tsp_solve(muta=2)))
' Z7 ]3 ?( P- \+ c, J! d4 g3 S time_endII = time.time()
3 \( H( a } [! C t_listII.append(time_endII - time_startII)
7 ~: @9 i2 f b f8 U; [$ V* i # III. 同时使用上述两种编译策略
7 Q* N2 ~3 P" T4 q6 h) o time_startIII = time.time()
8 W9 Y2 Z1 _2 s# l% c( B1 q& D) v b_listIII.append(min(tsp_solve(muta=3))). z7 |5 [+ g6 w2 T
time_endIII = time.time()
8 j. i& B. ^) P4 b' E/ ]5 [, S t_listIII.append(time_endIII - time_startIII)
( S8 ~; L0 a: \; @5 t# T1 d5 S8 d2 C, Q6 C R6 J/ C4 R
# 做排序处理,方便比较
8 \, ]! }" z( e: o: v% |- l8 k b_list.sort()
2 Z: i9 X! |0 x' Y+ d t_list.sort()
% W+ g6 r8 T" r# N: @ b_listII.sort()
/ Z4 c% F4 n6 u" m7 z5 n t_listII.sort()0 Y) s, G: |8 k, o
b_listIII.sort()
+ Y0 I" R; f6 z. |0 L. _% j3 q3 S& C) d t_listIII.sort()
/ G& H3 s0 c+ h' I# l. Z. R8 X: ?9 m9 ]0 X. P% w
ax1 = plt.subplot(121): I0 v7 J( W5 I$ w; E2 r. w5 X
ax1.plot(i_list, b_list, 'b', label="Origin")
f0 k* d- |# |; d. x, C ax1.plot(i_list, b_listII, 'r', label="Block-reversal")
% O1 r+ u- L& g3 R ax1.plot(i_list, b_listIII, 'g', label="Origin + Block-reversal")/ m2 X1 q9 z: D$ a# S/ y; _
ax1.set_ylabel("Shortest Path")6 y5 @6 y p2 @, N/ z
ax2 = plt.subplot(122)7 l/ w+ V; a) P
ax2.plot(i_list, t_list, 'b', label="Origin")
q" j; u7 v$ p. l/ J$ X* ^ ax2.plot(i_list, t_listII, 'r', label="Block-reversal")
2 E3 Z& N; ]# s3 S7 A ax2.plot(i_list, t_listIII, 'g', label="Origin + Block-reversal")
4 n, E# O' {& J5 P: } ax2.set_ylabel("Cost Time")( G* e, R" D8 a
plt.legend(); S. n1 M0 f( ]9 W6 q5 x; T
plt.show()
% [8 n9 ~9 _$ _- I8 |4 ~5 j1 ?" c
( G& b% ]8 U- A# ^( d1 h# 4.2 锦标赛选择策略对比测试/ v f$ L+ c& C2 ^1 m9 f1 X5 k
def opt2_test():
( l. w7 V0 \" C% V6 e& D+ M2 R ITE = 20 # 测试次数
1 v6 g5 k) @% b4 ?/ L i_list = range(ITE)
9 D' p, g/ c, k) K" y4 u' V b_list = [] # 每次求出的最短路径
! k2 x# T( ]' h- S5 S t_list = [] # 每次求解的耗时3 \. ^+ a- i& H* e' O
b_listII = []. N( T2 A- ]4 E5 K/ r+ |
t_listII = []5 a# u* B7 M- X2 C) a" P
b_listIII = [] B* P9 @ j8 R5 {* u) d; M
t_listIII = []
# P6 P& z5 R# f6 W% S3 W+ r7 w9 x* p1 o0 T4 k$ ?, _1 s
for i in i_list:
9 B8 `1 T9 t! r; O* \6 _ print(i)
1 p' V- b. O: G/ J. H0 S # I. 原赌轮盘选择策略
9 J% i9 s( @( e1 Q. K @* V time_start = time.time()1 r6 n. x# @* J6 I3 Q7 ?
b_list.append(min(tsp_solve(sel=1)))6 y# ?# C, g# |: _! i
time_end = time.time()' x! M7 `# f: \, W* @
t_list.append(time_end - time_start)
. o+ C: w! D" i9 ~5 D: e # II. 锦标赛选择策略, N" L/ o0 z; z/ E$ X. v3 \: ~
time_startII = time.time()! x1 r1 E6 y, f0 g
b_listII.append(min(tsp_solve(sel=2)))
$ X$ I. G5 c8 O* W( V. C) _* D time_endII = time.time()' W% D0 M# ?6 K& y( e: z
t_listII.append(time_endII - time_startII)6 A: H7 j7 \2 v: ]
# III. 锦标赛选择策略 + 两点互换变异 + 块逆转变异策略
9 l- t# R9 ^2 L# D* C# |7 u! x. I time_startIII = time.time()* M& f" G' ?2 U: ^+ N
b_listIII.append(min(tsp_solve(sel=2,muta=3)))0 B& _, S+ ^2 S1 E- e
time_endIII = time.time()! x" c# M9 s \7 ?
t_listIII.append(time_endIII - time_startIII)7 G' N* o! |9 D0 u
9 L8 e' P0 u- x, x: Q4 d/ |, O: c # 做排序处理,方便比较
5 P: O! Y7 P/ W6 d. ~5 S I1 l b_list.sort()
8 Q6 p9 B- b. x, R t_list.sort()
1 {% z" [) E8 m+ ?' Y( A- s# }3 R" N0 S b_listII.sort()
' S+ Q% Y4 o9 A* {$ N2 u t_listII.sort()
4 X% _1 I, U# W b_listIII.sort()
. k1 d3 Y! T! ~. H% ?" q t_listIII.sort()& j/ l$ L y5 E
* ~+ g$ M( ^9 c
ax1 = plt.subplot(121)5 T. H- x8 l$ l. K# V
ax1.plot(i_list, b_list, 'b', label="Origin")$ X. [, Z/ D1 g/ v
ax1.plot(i_list, b_listII, 'r', label="Tournament")
7 p( @/ C5 [, k. C. y, w ax1.plot(i_list, b_listIII, 'g', label="Tournament + Block-reversal + Origin")
4 q7 j7 b; z# m5 G ax1.set_ylabel("Shortest Path")
$ l/ e. ~) ^& n; p ax2 = plt.subplot(122)- o. M9 a% g( x) R! d
ax2.plot(i_list, t_list, 'b', label="Origin")
0 h( |! K+ ~1 j5 o E) ^ ax2.plot(i_list, t_listII, 'r', label="Tournament")( |2 c0 d& B% x( v7 V( C+ |
ax2.plot(i_list, t_listIII, 'g', label="Tournament + Block-reversal + Origin")
7 Y) H5 K L. X) ?" S+ G0 |- ]) j ax2.set_ylabel("Cost Time")/ ~1 n2 |' N& |; u: m
plt.legend()9 _3 D p) J+ X! o& u3 c; J/ L: { G
plt.show()
) R/ O$ ^8 e4 E9 O" w$ ?& F: m
! J: \2 ~0 @! Y {7 n% z U# 3.1 原程序的主函数 - 求解不同规模的TSP问题的算法性能
Y F; B* _: ]& B/ |def ori_main():* {5 p4 K! d% q9 }) u3 g
time_start = time.time()
! U" A' J1 p* t! L6 d# V7 p pop = [] # 生成初代种群pop1 W! f; I/ J4 t; R" X# m
li = list(range(DNA_SIZE)). t2 ]+ j7 j' K
for i in range(POP_SIZE):
; ~! Z- W9 ?% P1 N9 c# t random.shuffle(li)
; Q! }# c6 a) @0 g l = li.copy()4 A/ X/ ~5 d2 }. v/ n
pop.append(l)
& i* `8 e3 W& q7 g! V) W best_dis= []
( G4 E Z9 W; y5 [! x # 进行选择,交叉,变异,并把每代的最优个体保存在best_dis中
: y3 I+ Q- l) ?/ w2 S7 |$ M for i in range(Iterations): # 迭代N代
- U! Y' }% q, P3 N# {6 K4 K* @( y pop = crossmuta(pop, CROSS_RATE)( u. F& v6 R) I9 s
fitness = getfitness(pop)
, Y- l7 P! A% i! N* P maxfitness = np.argmax(fitness)
' v; _& s3 V5 l& r" S5 T best_dis.append(distance(pop[maxfitness]))
/ o! f! e; \" ? pop = select(pop, fitness) # 选择生成新的种群; u. J) ]7 P2 V' l
+ A* M2 Y& [; W" }" o time_end = time.time()7 J6 o$ ] ^: A# T, m
print_info(pop)
$ {, N- i- w5 _% ?8 U+ i print('逐代的最小距离:',best_dis)% }6 v7 D' G, V% d; V) v# {
print('Totally cost is', time_end - time_start, "s")
4 [+ @5 Y- v, V plt.figure(), {" Z! }' y( r6 ^5 Z- @) S. k, U
plt.plot(range(Iterations),best_dis)1 S5 ^9 f& y/ I7 j
/ \) b; q8 F& n) A+ I5 H7 a
# 4.1 块逆转变异策略运行效果展示
* V* z( J7 y% y; Ldef opt1_main():$ n0 K2 c& ~7 F9 \: t/ U
time_start = time.time()
# z5 Z5 `4 G7 r7 J pop = [] # 生成初代种群pop/ ]3 L) Z# E) X; e; l
li = list(range(DNA_SIZE))3 P0 r) j# h7 K/ w4 v/ X6 ]7 ~2 w
for i in range(POP_SIZE):
/ U: Y* L" {" ~+ t2 V7 r+ ? random.shuffle(li)! Y' t0 }) m6 t. J( N& `7 k
l = li.copy()
; q0 F+ H( Y3 G7 v8 _: G: o pop.append(l)/ `- n5 G T& h4 w5 p$ J
best_dis= []1 R) i: F& O6 p7 ?0 n+ m
# 进行选择,交叉,变异,并把每代的最优个体保存在best_dis中
' E. D5 q1 h# U; K0 f' K) G5 v" F for i in range(Iterations): # 迭代N代( |7 V) G/ k5 @3 K/ _1 S1 `
pop = crossmuta(pop, CROSS_RATE, muta=3)0 t3 @3 Y/ X6 ?# L6 g% t; O
fitness = getfitness(pop)8 g8 g, @) l; V! v( v: e
maxfitness = np.argmax(fitness)
* b' J! D1 ~" L best_dis.append(distance(pop[maxfitness]))8 ?1 d: t, o+ p( ~; I P
pop = select(pop, fitness) # 选择生成新的种群; J% ]1 x/ a( a$ [7 C
8 k$ n/ t% j% S6 P- f. T time_end = time.time()
' r$ h; T7 M5 \1 l$ ~ {9 B! y print_info(pop)( e* G% z7 ? @- n9 t
print('逐代的最小距离:',best_dis); Z7 M/ W. A% |7 p1 v, m( t
print('Totally cost is', time_end - time_start, "s")
& e {9 e. [8 ]* C A/ V plt.figure()! P6 O" Q: K& a+ v7 M
plt.plot(range(Iterations),best_dis)
" l2 x$ ^ u0 w9 d' P: J
y1 ~2 R, ]6 p, ]$ J) iif __name__ == "__main__":9 A' m. x$ O8 A' J4 K& j
9 i- J% j9 n# q, n! ?1 S ori_main() # 原程序的主函数
7 B& r3 J8 g3 ^# q: w opt1_main() # 块逆转变异策略运行效果展示
2 j: A6 v9 N( E7 X# c+ ?3 i plt.show()5 M8 H$ J& |# m- x0 U9 R" G: t) o
plt.close()* E' s. v: N1 W1 C- Q( G3 s
, I7 A H6 o0 l- X7 k; K/ T # opt1_test() # 块逆转变异策略对比测试
: M' l+ r4 j3 |. D5 Z8 q$ I # opt2_test() # 锦标赛选择策略对比测试
% \, L F& E8 d& Y! W6 q5 G7 K& w$ K M/ {, ^2 @* U
# pop_size_test() # POP_SIZE 种群规模参数测试
1 s7 a7 S; m7 ` # cross_rate_test() # CROSS_RATE 交叉率参数测试
1 {1 A# x u) y7 X. y # muta_rate_test() # MUTA_RATE 变异率参数测试
" W; ^% c9 n( h3 g5 f/ w" m' _ z3 Y # cross_muta_test() # 交叉率和变异率双参数测试1 B7 _7 i- r' P- b! l, m& j
7 @4 o' Y0 B% B4 T+ J$ [& }4 n" { f
u0 M% I- Q7 I! v: x1
. j$ P( w+ @# r# c25 o1 Y5 \9 a2 F3 k0 y2 ?
3
/ F, R# b/ |; A4) t* _( Q; Z2 u: {7 C, ]: e
5
7 F; h- N6 m- F; h) Y( X2 h" v2 s- q6
* u, q$ l1 M: o0 }( B79 P' `, P$ ^/ A4 m0 N) z
8
4 [0 F, G" F5 m+ H1 x2 i9
. ~( E+ u8 ~% Z10( {+ d' l: ^$ }2 o* [2 P& R
11
; ~/ e# G! I4 U' q( p0 |2 ~6 H125 ~! H f/ d* [3 w) L) E! L j
13: Q& h* K. X; ]; H7 B
14) z/ J3 I& p5 C
15
8 z5 H1 J7 Q8 g! q7 N16
% }2 ~$ z/ q$ T/ x; e7 s) w172 m' R' T5 g# r
18# p( a& ^8 W" e$ N
19; s/ t- k+ j* P% o7 M& i
20
4 R$ b& T4 x; W21; c! x# f P7 H2 A/ V
22& l: z' m9 l$ f. r) f+ P. t
23
) n6 [0 c. i' V2 z% y244 P$ s6 D& N; e9 ?2 B" F
25
* r2 _/ y4 @2 p9 O+ v! n s26& r: d7 u: y, B* o
27" Y4 ^2 \7 } [7 ~: Z
281 G: U+ D. |* C4 ]4 G5 U
29( p- U2 W* z9 v4 m
30
7 L& S. r7 P& K/ R0 z( S8 l5 l+ r316 ^8 Q; q3 e8 o& v
32
( F9 x3 Q9 p H* ?33
6 w# @6 p# l5 X W' J4 l34
: y5 \7 C, M u m. N4 t( F35+ g7 Q- d) m; I' }: u6 b* U
36
/ C; {) Q/ [% R6 Y37
; `% L1 i. W7 `# D3 q0 \) E38
( S% ~% V1 q5 W/ E" }39
, x6 ^8 {( w4 M1 |40
2 r; p7 m- G9 t5 v) Z, b* d9 v41" ?3 R7 I0 Z1 @0 x! H5 a- ^4 Y
42% h4 A: t7 N- p& ?4 a3 `& d" ?" v
43! e1 J8 g0 {, I" b, ~
44
- ~4 N, `, ?- w$ f45, N7 H7 ?! x+ x# g$ G
460 `0 L3 l3 f9 x+ [8 C: z5 Y
47% C4 ]9 \; v1 |
48) f7 b1 K& g2 y& \! U5 f
49
" G6 o' y0 v- V1 Y: h' Z3 d50
: A3 E+ A. x2 C& ?516 w/ ^; N5 V0 X" ?8 P
52
]" D I4 x; H4 J# ~53
) H( G# F" p* s$ _; ?: c5 _54
& A$ P, z @! I& M- [9 e. `) ^) O55" {, j, W8 L, \3 V; v4 b
56
( i1 b6 x7 l. W3 _57
( X5 m/ K. q" c58% O; h/ d+ b* Q+ R7 `/ N) \! m F) T
59
& y% \$ h4 n8 T. l60+ j' {2 X' n2 Y8 k* [
61
8 S" D' o1 |9 v( c& Q0 r62
' q$ W2 o8 A2 t63' F z. S ^$ W% a
64
. A% `: X$ w! O5 {4 g/ V6 J65
% @! g+ x/ B/ g- X# H, V66. Q+ x2 \3 {+ M& ^' G
67
$ I% r* a: j2 b4 G# J% W2 a68* z. c# O$ o9 a8 A# Q2 L; ] y
69
! F0 Q. S. @! M4 h70* D" o# n1 V0 T9 N
71
7 T0 j% T% N, D) ?! N. n728 C! ^5 z" _: K/ o8 f
73
3 d" ^! Y) y, k: l; V74
5 A" ?' l( q: S3 A75
# Y" `! q1 ^6 `! |& ]76
$ V& u E8 u+ G2 d( m77
5 g& K2 G: g3 Y; M9 F789 p; O. U% s' _6 R
794 A( s; ^* m3 L/ E$ a* Z- j" v& H
800 h6 E& M7 o0 D& X6 C
81 F9 r" a0 @9 x0 t8 h( A
82. N+ b$ d- y" b+ X1 [3 U ?8 e
83
4 \4 C( |7 v9 h N84
l2 S6 ]& y7 H$ F- R850 W) `, M: j0 Y; Y2 z/ R: o* o
86
) u+ G* w8 ~1 L% S87
+ s! F" y8 {, Q( q88 R5 {' V# w" N0 J3 r" N
89
- O9 k0 A4 S& E( v902 m: Y6 ]: g+ L5 o+ Z2 q
91
0 u1 x# f& H4 u+ S92
; v% l$ o% M) ~6 a93; K1 a" W0 `/ ]$ i/ U5 t
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