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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
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    function main()
    $ k1 I+ @. \. H; T7 E5 g3 ]%*************主成份分析************) |; Z/ X6 \" w" Y
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    6 H6 q& |  ?6 B- Z" fX=load('data.txt');
    2 p) S+ I  `! x! t%==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================3 V3 X! X* M6 n3 @' H9 M5 l* o, o8 |
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    [p,n]=size(X);
    8 P- d' b% _0 l5 }  ]* Mfor j=1:n; r. a- y/ b9 O, O' P6 F
        mju(j)=mean(X(:,j));; i0 A" p/ u% E$ Z& n4 X
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    for i=1:p+ E0 m4 c( g( O- }' o
        for j=1:n
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    ' _* ?/ e) L3 F/ o1 [0 uend
    " C  e, R2 n# A" x0 l+ o0 }sigmaY=cov(Y);
    + x  p. I* T* W2 n0 a%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量( N5 D' F- |" a; T; _. V8 i
    [T,lambda]=eig(sigmaY);
    ) \6 _+ k: V0 ~- I$ y' l! E$ Kdisp('特征根(由小到大):');+ Z* r2 r$ A# ?
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    %方差贡献率;累计方差贡献率
    - U0 p; O  z8 `, t! F5 p$ C$ g, T! sXsum=sum(sum(lambda,2),1);2 W. H- o% Q* S+ I+ T4 n
    for i=1:n
    4 g9 |3 h. N' }0 e) J% K( w- V    fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;- ~; U# w9 _) \+ N4 S; O. g( ]
    end% `; c4 p, U8 e0 c
    for i=1:n
    # w' J7 b5 s  Q( T+ N6 m6 Q    psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;6 l1 Z# G3 P9 z# `
    end; y0 Q' d: r1 A; F$ o; ~* S
    disp('方差贡献率:');
    $ E  [# M3 y* U# e( l6 T8 t/ bdisp(fai);9 Y4 u6 f4 Y' f+ x
    disp('累计方差贡献率:');
    9 I+ s4 O  ^8 O! R6 G1 Adisp(psai);
    4 C- _0 a  ~  n2 H%综合评价....略
    8 M2 c5 t8 L# x# U6 a2 S5 g4 @6 n
    : F! @7 E* {$ A# y4 D  c
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