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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
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    function main()
    1 o' w* e  I5 ]+ e* r  U8 U2 K" `$ C%*************主成份分析************
    4 V! \( b/ ?' D1 s6 {1 Y  {%
    4 c$ p* x% L( Q8 n, m4 \  n) _%see also
    ( @( o/ X! Y5 ~- ?! c8 F%
    ) g! t9 ]" i( i9 s; w* V%读入文件数据
    , F- T- G2 d- M3 I1 XX=load('data.txt');
    6 j+ m% S! v6 h- V3 y%==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================- L$ u5 N& C6 W8 u& {9 u' G
    %标准化处理# w) D/ q! V3 M' b5 x
    [p,n]=size(X);
    & Q  h" p& {9 H. V, p" W% m2 |for j=1:n
    ) ?6 X( _1 u' r8 u2 ~: Q    mju(j)=mean(X(:,j));
    $ n" a3 o' p: h( P7 n  P6 n9 `9 f    sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));
    5 I2 a8 O- l( c& l! vend; i( |, r3 `4 T. p4 l
    for i=1:p2 W% i$ v5 \  W/ h# L
        for j=1:n
    * Y( X# t/ l& ]( a1 n' c        Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j);
    4 f& u8 V5 m% ]4 e9 ^( V) l    end7 U* o/ v$ i) s: K
    end
    * k6 R) y/ Q# x/ W( P0 |6 b1 bsigmaY=cov(Y);
    : t* m. m# u" b" o, w%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量# P2 X0 p) T( B+ Q$ D: N; a
    [T,lambda]=eig(sigmaY);" Q. T$ H# ^6 }1 l% \1 O
    disp('特征根(由小到大):');
    + N% w& L/ `/ M, e$ E+ J5 P/ w! Vdisp(lambda);
    9 p' l% Q* Z3 T' {5 d9 w! ~  o( `disp('特征向量:');0 D- ^9 Q, K  ]) {
    disp(T);
    # J) a# s# P9 G/ P' V  \%方差贡献率;累计方差贡献率
    4 @9 {7 @4 F9 H. A* TXsum=sum(sum(lambda,2),1);
    / a; R8 k% B  p, ffor i=1:n; [2 _2 T! n+ r* X- G8 |$ V; L
        fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;& _- h. O% U" ?  T" p
    end' H& n1 D; Y' n2 b# B4 m
    for i=1:n  }* H" R5 b8 U* e
        psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    / R1 ?% m2 g/ M$ R/ r8 Tend5 Z5 |+ `$ Z  w
    disp('方差贡献率:');
    * @! ^2 A! o+ U1 c4 [; p/ G% g9 gdisp(fai);
    % X2 Q4 J% Q% s2 sdisp('累计方差贡献率:');, f6 u7 C, A8 a' _3 Z. R
    disp(psai);% P7 P+ [( V  i) [3 ^
    %综合评价....略
    * ~9 x5 m) r) d* J) o* Y, B
    7 \5 x6 b6 A/ h$ J7 e; J
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    # J( L- f, Z6 _( s, T7 M
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