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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
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    function main()
    - P! @3 h4 ]3 G3 t8 [7 X%*************主成份分析************7 R9 R+ U$ ]* W
    %
    $ v+ a0 a9 a. R%see also ' J; ?- o0 b1 L4 d" a' ?3 s
    %" @  \2 j( j# c' ~- U
    %读入文件数据
    ! N( F! {2 V+ ~, _. `4 `* _X=load('data.txt'); 2 S' O) i2 t0 a6 [+ I
    %==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================
    $ V) O, I, M6 J%标准化处理
    7 @2 F6 v& a8 ]" j% M  A' X( m[p,n]=size(X);
    - z+ e6 M/ W7 ?: |6 jfor j=1:n, J2 ~+ V* I9 K" E. y
        mju(j)=mean(X(:,j));
    ) O7 i. k9 _7 G- W5 w* [    sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));; e$ T. L3 X( M$ \3 ]( B
    end1 x* o& X; v$ x& A
    for i=1:p
    / e9 Q/ R. R5 y    for j=1:n7 x  D' T# X1 k$ x5 u0 B0 r& p
            Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j); 4 O% l2 I% N9 F9 K
        end
    9 e- W- _) M1 B5 b6 _' v$ Uend
    1 s) P- j3 K; l5 {7 OsigmaY=cov(Y);
    3 n, e8 ?9 P; n; e: \  z%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量) q+ g6 ?8 j3 |8 U3 v
    [T,lambda]=eig(sigmaY);! O0 e( h$ V8 V4 }( j
    disp('特征根(由小到大):');
    ' \: b' L' F# E4 q( _5 k. [2 S  ddisp(lambda);
    ' c# y/ l5 n% _& K% X2 c# S+ odisp('特征向量:');
    3 L. B5 j* O/ J* g- N, j0 f/ S! |disp(T);
    2 f' o! y) O$ M; ?7 P3 C$ z1 f%方差贡献率;累计方差贡献率
    1 `! F" Q' p/ c& i6 U# PXsum=sum(sum(lambda,2),1);  m8 [: o, G/ h
    for i=1:n
    2 N; K! v) }5 s  J    fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;
    5 B) P) Y3 f+ `" t( kend7 k# K( S* |' ^" E9 ~4 O
    for i=1:n
    : I2 g& \2 @( Y5 H/ v& ^) M    psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;2 p, n+ l9 F. Q
    end
    * `4 P# J; s  v: J- F! C8 jdisp('方差贡献率:');; L' L' Y" S! d- y2 u& a
    disp(fai);
    " o0 m# m8 T6 V0 Y" ~disp('累计方差贡献率:');
    # Z6 e* c$ a$ @" Y( udisp(psai);  T$ g4 o4 A6 `
    %综合评价....略$ [  q3 {2 H: ]

    ! H! D. A$ R& w& A, `$ y- R* ^
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