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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |正序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    3 F1 U& K6 f  ~' d常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。# ?9 F( h6 T; a9 H
    ' M& @" F& }3 v. q9 Z) m
    + T7 F* k4 ?% m! ~3 B# D

    * Q$ K! u* H& j& }# k- X3 d9 ?例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
    ( J* W! S- l$ y; @; O! y6 |9 j1 T
    " v6 i. l8 c4 y1 i  V  R, m' V  S(a)假设/ Y" C2 I3 f( y
    令n = 0,1,2,...。 ( |' d$ Y% @8 D

    2 y  T' S8 p0 J
    - ^" i# R8 a; b# W
    ) W: h; P: m& _/ \
    3 U7 T( i& D+ U$ Z0 f# B8 Y
    1 y9 Z; k6 o9 h( h, k(b)建模
    5 e: ~( X  n6 z2 P9 S1 _& }! j& ^! ~! w; a3 d4 a3 C! }, \
    , Z# H+ a6 J2 B1 n( C
    " E9 A7 ^: B: b7 M, t" [

    * f$ e8 p% W8 |! F) Y
    : O6 b; h% s2 S9 A; X
    ; {2 m1 J/ f! R  l编写如下 Matlab 程序:
    9 T' ?4 M" g: g8 a% [! S4 l& O% I1 r
    syms n a0 b0 c0- h6 F7 j( i8 I( R" x# _, D
    M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');
      M! l- I$ v/ w( u9 f[p,lamda]=eig(M);' X: E/ O: b9 ~
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];6 C1 p6 \2 B8 U9 [6 b
    x=simple(x)
    3 d; u  j) V$ W# C2 j* M/ Q* V# L9 |
    & P+ u. _- s9 v% O* w
    . _1 h. [9 `' m* a; T3 G

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:


    - D6 e3 \2 J: `) b, h5 l& Osyms n a0 b0 c0
    6 T0 w" K" F, MM=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');0 B% h, B( i% e3 o
    [p,lamda]=eig(M);( ?& [5 d/ A% j# r0 J$ k$ A6 g
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    0 P4 n1 @5 ~2 m8 g: b" X7 zx=simple(x) ) C( k+ x0 v* z4 ]" i
    ) `3 O9 \/ V9 w  x9 V. i* L
    / m3 U/ T2 E( n3 l+ B5 r+ h
    * j! S# J' W2 i
    2 常染色体隐性病模型
    , B, Y% P; x) i/ v现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。; x% ~) W: G) s) @% V

    6 [5 c* }  }( ^* Z4 l(a)假设
    ! h5 J! `8 r; Q" O$ v(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    + x8 a4 z7 d: k2 F1 @$ K5 x- ~# g& M; u2 v0 g" ^
    ; U1 P* d7 R4 l# `" W6 F6 H) k
    3 q- P2 _/ ?' ?9 b) O
    (b)建模/ L9 e1 V: i# Q  T. y
    4 Y' Q, W! S: F
    : j" C2 ]$ a& [6 I

    4 j$ i- E  j' [, S9 q; ~) |  |. Y% m. B% l( N
    % B/ G' m$ m- k

    4 X  y. C( x7 |. s, P7 o7 g(c)模型讨论
    6 I6 s7 m0 \% z. F+ X研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
    $ i' P& c+ Y9 z1 v; Q5 y6 H, Y: s: Y
      l# t. P' q2 e+ o+ B- p) {
    ' y" k/ T6 D" h
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。
    , d; g1 g7 x; ?9 N+ V( N
    ; X( b2 G7 J0 M1 |$ Y3   X − 链遗传模型
    ) D8 h; K" }# K( G7 {, WX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
    : I+ q0 ~3 b/ \  R; H
    * V4 W3 }+ H6 A/ b1 x  G- A(a)假设/ P% q, v6 O# X3 y
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    $ M* t: U" Q3 f4 {1 n# Y8 B# j( W  b$ V
    (ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    5 V; x" Z* Y4 F- y
    0 m8 t# R' T( u+ ~
    : w* P2 k. r9 \* |& |
    4 [5 _0 V4 w' i* l6 d
    + Y3 [; G/ P7 B# k( }. V* M0 W, h7 X, ?
    ; e4 w9 i5 p3 q- Y3 i0 k' w4 ]! I$ T+ b
    ; M& f( M& D1 b  X3 E/ F& A( c
    ' H5 g4 y; Q. W; q' I; c& p+ G$ r6 r- q* o' n: f; l
    编写如下 Matlab 程序:
    9 A+ ~( \, t4 y7 v' t
    8 `5 d- Z8 I( K+ `( I6 Rsyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
    + z& {0 u/ w. O+ \7 p- L" SM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;
    0 \$ R; G; a( b" K- E 0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];4 d4 B9 j8 T: r: c
    M=sym(M);
      R! x7 c! Q2 r1 u4 i( y" l[p,lamda]=eig(M);
    1 o2 e9 Y# d4 _$ s( \. {4 E7 gx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];
    . e: W  b* P/ d* @! I9 b! F9 R# Jx=simple(x)
    7 {* M2 B+ W, Q8 m0 |+ z5 g" q7 `* \1 B; h8 U) o5 d
    由上述程序计算结果可以看出
    0 e" x* U" w; w% m+ }
    4 M4 u0 u4 v& S
    / [3 L* T  x' [
    . Z' }+ w7 n7 i习 题
    # E8 z' \# r+ P9 l' X1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    " ^/ B  ]7 H; |
    ; T6 y+ K# J- h* K/ ^5 H2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。( G# q( f/ |7 M6 V* @$ U. b

    : w$ j1 X# J: b& _! R* n3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
    ! Q8 u; I0 I$ Q) D- @5 S5 |0 B* J/ y. p  N
    7 H1 ]/ S2 M% ?  D/ i# N

    8 t$ h0 z) D' A, ]  }% l* R1 I6 G; s6 u6 X& H5 G
    ————————————————
    + @$ T8 p  T) A( F& h版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。) D  i, t; T: f% p$ r! N! |/ A
    原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596: H: |* J+ t( T- J4 u8 e
    / W  c& Y9 {/ X3 a# b# P. u; K6 H0 r
    + Z1 B8 c" A( b+ u7 Q/ D
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