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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |正序浏览
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    1 常染色体遗传模型5 H" q8 c$ ]- ?: T/ U" j% J' f1 Q
    常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。5 K# u) R8 ]( O9 Q2 k
    , l" G4 X6 d! u9 @7 i: R

    9 j! u8 R, t& _) a3 E; ~* E- G
    & K6 G5 X# b& O1 @例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?6 I7 x* X4 q$ {4 w

    - D  P2 Q. c6 f+ J3 A2 ^! S(a)假设; I( i. ?1 Q% c2 X
    令n = 0,1,2,...。 & I- o+ R' k$ ^6 I6 ~

      [! D. U4 G/ Q6 O: K/ V" R
    , a, G! P! G* y7 `1 l6 U; M2 S+ F$ y% B1 o) z8 W

    , j! K2 P2 K' `
    & l9 f  Q0 L, T3 {! O! r9 O(b)建模
    5 g, p' s$ Q- d! w, W7 n* q. u1 N* v

    , B& k% W' P6 b! K! S& y
    1 k* f# s6 k' g+ l- m7 w/ o1 ^
    # F/ E8 Z4 M4 W/ n& q6 G
    & j$ f0 x5 z3 ^) u( ^  z& w# n& b5 E; O6 n) N$ q0 D
    编写如下 Matlab 程序:
      L. j& }. P( z: W. p) z, }4 {/ ]; z4 H% C& Q  f6 t
    syms n a0 b0 c0
    5 w  F  u. W, UM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');
    / n; M+ ]$ G% D6 s[p,lamda]=eig(M);! r+ _$ B% M9 o/ X$ w6 Y1 B4 Y; c; B
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    ' }# I6 r6 p( C5 U+ jx=simple(x)
      }$ w6 Q: Q/ j5 ?
    . y3 `5 t1 V5 E; d) z
    # d' j, N) ]9 a* F
    : v4 z& h, u4 G% R+ S

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:

    4 V" y8 o5 z. T4 q
    syms n a0 b0 c02 j5 Z, k) Z, S
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');
    / T& o' D7 d# U[p,lamda]=eig(M);7 o, _0 J" N2 M. Q/ x! F' h. R
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    1 ~4 ?4 P' _$ M  Z9 p7 i) px=simple(x) 6 i3 u# T5 w+ o

    & ^5 ]) j/ ~2 P4 i6 v; o5 M- l+ Q' x- ]: c
    % D6 _1 g( l0 r' N" `- C! }
    2 常染色体隐性病模型  e4 B+ @! x# ?) |) g3 t* ]
    现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。
    9 x- @+ k6 q2 p0 c
    : m1 K# S5 W, j4 M0 d(a)假设, W9 X8 h8 V9 l; i. j& {9 B
    (i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。' m% _; }4 _$ Q
    # M# h" B! ~; n% U. M* R

    : b; v9 E/ S( [0 {, J( s7 J. z( O) n/ g# |% C8 K7 S, Z
    (b)建模
    4 W* o$ ^) ~7 X  E+ J( U( c( `3 J5 q" m

    / |4 o* }! {( P' c' C8 V  O; W
    - Y- q7 F! G8 [' L+ J9 U
    1 c0 ^; d9 w# C( M6 M, A( M0 D: M. ~/ {& F3 R- K, z4 F
    3 i; ?- ^$ I% W: B* {4 o/ Q- w
    (c)模型讨论8 K4 `  R6 |  U8 {
    研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为* A7 E  R. d2 F+ H( J/ Q

    / O; S7 K$ V0 y9 L0 P& f
    & V- ?# z+ S% g5 q: ^+ _8 j7 k2 s; A3 h' t4 B  R8 c
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。
    ; O+ ^) U. A& a& C8 {; ^1 n# z4 O: d6 J+ L: Z% s& M7 H
    3   X − 链遗传模型7 c+ ?- L4 ?# y2 m2 F" f  A6 y% s
    X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。% p! V: L, i0 |/ l* b4 ^
    ) S+ m4 s" M% Q) O* ]" L
    (a)假设  f0 T  L, e  ^5 E" d
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    * e: o, G, r$ ~( C/ w
    5 o& g, @4 A2 f$ {( }4 Q(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    ( E3 ~. T' A1 C$ G: `
      I; N! d" m) l2 g& {0 ?5 S% ?6 L& z
    . H3 j- m4 ]1 j; r
    - y& T7 u  z' D4 `1 ]3 t  W: w0 Q* `1 N3 s
    # \5 e, m. M$ `7 F, z" ~4 h
    & V  a; s  _# Z

    3 h: A- k+ ~% ]2 k0 Z; K
    7 L9 ~2 G/ {4 `编写如下 Matlab 程序:
    6 N6 c8 E1 x/ m% w4 d8 l, K; w- f! p
    8 g" }4 x9 F$ X- \0 Msyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0: W4 H0 n8 Q% I; }8 h
    M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;  r* e$ ]6 i) s6 ~4 ]5 r# B3 v
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
    + t/ t# }+ _- U6 s, xM=sym(M);& z7 m! V6 n4 B8 u& k
    [p,lamda]=eig(M);
    # l: ^& f; e8 ]" P* N* Mx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];0 ^, g8 V! h$ V) |
    x=simple(x)
    # u4 `/ Q& o9 v7 _! b- Y( r9 \/ y4 L# l, f( k
    由上述程序计算结果可以看出
    & M8 E2 C6 T; |: F- X- E! t
    2 r3 M/ O" S8 @; q/ W7 {4 k8 V$ h- W8 I- d1 _: S. B8 r5 I
    4 [- \% _9 h0 q
    习 题& [) h* n- I  ?1 S! M
    1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。& w; I3 Z. s8 \& o& v: C( P# }

    1 t1 U1 H1 N, ?' _( o3 U0 M. Q2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。9 y# K' W! g0 M: Z+ `
    0 D- }& s3 o% u4 a( H% _% x* h( l
    3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
    7 \$ `/ ], }4 M% a- u8 W, x* C# w3 n8 @1 @+ d1 v: {( q2 W

    8 Z( F# v# S* y( }8 q% y" }$ L2 f' Z7 W4 a  w0 _

    - n" _6 g# O4 S, D# N6 g————————————————
    % a1 K. V9 j: O2 n0 S; W+ H4 S版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    ( C7 w: r* i4 L' C9 I原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/896465967 @* l7 j$ f% I# u9 E7 E
      O+ n; R: x2 a4 y
    * b+ R; o6 M: G( c) o: u
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