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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    function main()" u- Q2 A2 ^' P  q, n) R, Q
    %*************主成份分析************
    2 b5 F+ L$ X# ~%
    : f' H, A, G2 Y%see also
    9 G" g% J3 G: S! u* ]+ O2 y5 g%& j1 N  l! h: M1 O
    %读入文件数据
    % x( G8 \5 F: q* n# f: G' t  h6 AX=load('data.txt');
    + I( B& S$ Z% Y7 ^* x%==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================
    0 Y# X2 ?0 K9 q  h%标准化处理4 Y1 W0 r. I4 B
    [p,n]=size(X);3 I* d: g# i& d6 W2 C2 j/ a' n
    for j=1:n
    1 z5 o. Z/ Y: O1 ?6 X" a. X% _    mju(j)=mean(X(:,j));
      _. N& |% m+ g0 T- A    sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));, f' `7 Y4 E( ^( w# X
    end  m. e1 e& `) L5 F
    for i=1:p
    & v- h% o4 {4 c    for j=1:n7 e/ \4 H; d, Q: V+ Z/ s7 p
            Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j); 8 @' j: [5 ^3 r6 M2 e
        end
    " O# ]9 a  {3 h2 x6 D% Nend
    4 Z6 ]) c" d. \sigmaY=cov(Y);
    - n- w$ L; c- W/ o% {%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量, W4 R6 Y# K: @+ W8 F- L
    [T,lambda]=eig(sigmaY);: r2 z5 ~% q. z$ M3 H* M; |
    disp('特征根(由小到大):');
    : q; ~& ?0 t) X1 W+ G- C3 Mdisp(lambda);( l# W( g- U, L9 \
    disp('特征向量:');& `( W9 T* [- Q* j; u
    disp(T);
    - i$ w  C9 u$ G  y7 Z4 E# y%方差贡献率;累计方差贡献率& o5 T8 T, Y; M" N4 ^6 D
    Xsum=sum(sum(lambda,2),1);
    $ I- a2 q/ m3 S7 {8 `# r* rfor i=1:n. \) z& G4 F' E: X3 u/ Q' A
        fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;9 F; u8 k9 C1 {& p6 i% ^$ E
    end
    6 n3 A/ Y8 P2 _$ e( w5 afor i=1:n
    5 _) h  z1 l; U" J5 D* s    psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    & [! `, c+ d+ ]* s) c8 S, kend# O/ {4 }' l: d  Y9 c
    disp('方差贡献率:');
    " q% W' M6 |8 B! Ydisp(fai);1 A3 W# G: j) c1 d  M
    disp('累计方差贡献率:');% `8 P# I. g/ Q+ U
    disp(psai);' w7 e6 U% b$ u- A9 \( E5 g/ X
    %综合评价....略
    ; E# p" j. b' f7 R  r6 ~
    , C, J9 F8 M/ `3 G
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