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主成分分析(PCA)Matlab源码

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    发表于 2014-8-1 11:05 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    function main()* U+ z1 X) W. k5 C# L  |, T
    %*************主成份分析************$ D  f4 U" C" V9 D/ e, M
    %0 Y6 c$ l. m; @8 I# P
    %see also
    : D/ g4 \( Q1 _%& C& Q8 i$ s' ~3 m' z+ V
    %读入文件数据
    ! d3 I0 ~# R6 U0 K3 P  b  b1 K% ^X=load('data.txt'); , [- V) D" |4 c$ a% r
    %==========方法1:求标准化后的协差矩阵,再求特征根和特征向量=================7 H6 g% F- t( s
    %标准化处理) f( O% i/ V: \0 ?
    [p,n]=size(X);
    1 i4 T" G; n4 qfor j=1:n
    / B& h/ w9 h8 T, n! G1 p    mju(j)=mean(X(:,j));
    + X  O" E% d. p    sigma(j)=sqrt(cov(X(:,j)));  c# F8 u1 v, ]' G( b" F( r
    end
    , G2 L2 k% O1 ?4 K' xfor i=1:p
    $ t, e$ c/ U" C    for j=1:n; s6 h. P0 H0 U- r: w
            Y(i,j)=(X(i,j)-mju(j))/sigma(j); ! ?% d! `' O+ ?$ O! E. f
        end
    1 I8 r$ u) q: bend
    ) X+ f; S& h! o* P  _sigmaY=cov(Y);
    ) z/ l( ?; _: q, O4 b; H7 T# e: j- }%求X标准化的协差矩阵的特征根和特征向量
    6 A! y$ T# M# i" C# |+ z" ^  q/ b* K[T,lambda]=eig(sigmaY);& x& }, P$ ]: G, V0 q
    disp('特征根(由小到大):');
    ) U; q3 R3 g  E. U1 P$ A9 Pdisp(lambda);
    ) A7 P) [6 y: Rdisp('特征向量:');
    % ~3 O% F; N" u; Fdisp(T);) j; W" O9 U# X% C* ]7 a# c3 ^
    %方差贡献率;累计方差贡献率; V. V# m8 |9 f" ]5 `
    Xsum=sum(sum(lambda,2),1);
    ) ]0 f% T& B/ ]& wfor i=1:n* b+ ~( ]$ i: _( y
        fai(i)=lambda(i,i)/Xsum;
    3 b3 M9 A- X, ]; |; ?, z9 vend
    " t9 T( z$ }0 y" ?! Xfor i=1:n5 s, }0 U) Y& G: u% b, c/ c0 v' Z/ ^
        psai(i)= sum(sum(lambda(1:i,1:i),2),1)/Xsum;
    % s" o: B; d6 M  d9 U& Iend
    . X0 T' T% E9 p+ y$ M: B; v" idisp('方差贡献率:');8 A; a% I$ x4 x5 [" j& |# r
    disp(fai);0 Q$ Y6 x) L0 `8 I  C1 q' j2 b
    disp('累计方差贡献率:');
    1 @2 l( O4 c' a, f& Xdisp(psai);
    ! R& u) z8 f+ k7 V6 [- V%综合评价....略
    % n9 z7 w- ?0 d9 o% `
    5 B; v2 F& _* c0 n& Q7 s# Z
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