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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。7 }$ C( u5 ^5 g& S
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。) O: V) D# I! C3 L( G9 `% v
主成分分析的步骤如下:( g% ~( ?) z* E+ {5 e( ?5 a+ k& l* s) K
7 b4 r2 j0 v+ {0 f4 p/ ^6 P
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。. x( m6 A4 w6 @" S$ c8 L
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。2 T% _8 w0 X6 P: O. e# j( ], d
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
( ^5 B* I3 D( E- Y  f" W4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
/ t+ s2 w" L; ]% \5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。
% Z8 F6 t8 a) F+ {
1 Z' q, p2 ]! A, v# I主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。
4 u. n2 E4 A# n4 O. [8 W
# N5 R" J9 P  C5 ~! \- ]逐行解释代码的含义:
& `/ |0 ~0 G3 |4 [; himport numpy as np0 _8 D6 V( ~# J: I3 _
import pandas as pd
, r( k) F  l* b) t7 ^from sklearn.decomposition import PCA
# X* h2 R  C+ {2 P7 A$ |# r' B9 C. W9 U
这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
- Q: j) v' g3 _' d, Ldf = pd.DataFrame({
' @# X1 Q; D0 E3 H: {    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],3 D# O3 j  I$ Y8 |" v- O& a2 S0 {
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],
* f# }7 R, W) N    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]: {2 `+ |- `: M3 N' C& |5 m+ p! T5 u, Z% X
})% W9 s$ h* d. h+ G
+ f; P9 L/ J% E+ H1 U
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。
. l, \$ @: s$ u% d) Z/ j% ]+ e; t$ rmodel = PCA().fit(np.array(df))- d( {  S, y' x* f0 k
: Z/ @/ q2 H, \( }& x2 h
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
( _8 e5 m$ C) ~0 A2 Hprint('特征值:', model.explained_variance_)
0 p5 t) t  i* @3 q& [" ]4 Jprint('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)2 B& X% o: a+ K+ d
print('各主成分的系数:', model.components_)& K3 S& M! s9 D. v

4 ]/ n- l6 ]: e& p& |) o. |, u8 r这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:' l% F& s( P  T, N2 q$ R) ]
% M3 u9 j# p3 S4 E* Q4 O& P
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。0 c3 m; t; U- b1 {! H5 A
2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
( k& B9 @0 z9 E+ K& {& Y& q8 p3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。) H* q1 g; `& V1 a* _0 y

4 q! a0 {" {3 b3 E4 dpca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))7 z/ o9 i4 R( w/ A/ r
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']0 N5 k! H$ P, b, l
pca_df; S4 p# E6 ^7 D1 K% j) {

* e/ C3 t' v" i这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。
9 \9 T# J& m5 ~  r* q希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
% k2 x( R# N( T
2 l  V" a& F. D- ]  l5 R* B/ J2 c6 l( {% Q: ?, U

29.pca.py

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