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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。
: }0 B2 ?* l9 r( p" H) r主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。$ b+ a! a7 |- p4 x$ J: K# D2 e
主成分分析的步骤如下:
  W2 H6 D0 n  b5 A: N" k. Y* N
# {. ?* w9 r0 f  E1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。4 v8 D; d" v6 c. q0 Y
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。6 W. R( K5 v  O+ y0 V
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
0 G3 n* l% r0 l7 J4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。# r# c# T3 G: c) v
5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。9 }2 J* j% f9 q. D

: g4 \" I. @0 c: q主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。& {: k/ a6 u5 V1 W; N$ Y
$ S+ j" d" p" z
逐行解释代码的含义:
* l% ]4 T& v* Q* v1 u9 k0 l' d+ |import numpy as np
2 d0 y9 V# i. t0 {import pandas as pd0 T2 C% A. c" s# J  W7 Q: ~
from sklearn.decomposition import PCA# J  [/ {. T5 u' M. M3 s9 O9 K
& p6 J2 z/ `. n  U& S& x) b, `4 @
这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
( W9 N& u/ y" ^- l9 t: kdf = pd.DataFrame({  [$ f( ?# g$ i: `
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],; ?+ N& g3 y" N/ [" S
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],6 `7 I+ j$ I4 J  c8 z
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]
1 i7 k. ~% P' O/ s2 r0 s& W})0 I" ]' P' v& _( v

1 U0 u( T  R- _7 b这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。+ g3 r6 [3 U" u; d: L$ \
model = PCA().fit(np.array(df))# q1 E# N. Q2 ~( p0 L. t# Z  @! E% H
1 ]1 b0 q; W- l8 N, g# o7 M. |
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
+ f9 W( h3 Y1 P6 m1 J( D; Z' s; ?print('特征值:', model.explained_variance_)6 J4 x4 ]8 P1 a' u8 E5 m8 @3 j
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
# }6 Q7 K# m2 P2 l. l  Q* `# l. _print('各主成分的系数:', model.components_); i- T2 v! P' l% e! _. }) \
$ O0 O7 n- l6 U( O2 r0 X; C, n: _
这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:! _% L2 `0 z; h; Y- h
1 P# W* W+ U0 r$ ]- p- e( S1 k- B8 l
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。; u; N8 V* K/ C8 @* a- r
2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。9 _' V3 s. Z3 r1 n4 `& ]- K
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。0 L. [* y" G( |* l1 r9 |& Y# L. b5 ]& r
3 p3 I! ?8 H* v8 X
pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))* L. o# n+ ?3 c6 {8 U* C$ {& V
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']/ n) j( P5 D0 P4 p
pca_df% H  |% o0 _0 _$ D* X; R* E( D3 x7 s

9 B% Y1 q) [; p6 s6 i1 T这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。* B6 t. G$ T7 D) q: A* o0 P
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
  z! l$ l" z- F2 j% n
! M: G  v) f( w- @2 g
' R7 Q- x8 O% V& U& [7 j

29.pca.py

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